New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1695039 | 96 (1.080) | 6 (0.070) | 6/236 | NT | 5.8% | coding (963/1275 nt) | wspC | biofilm formation methyltransferase WspC |
? | NC_002947 | = 1695092 | 103 (1.210) | coding (1016/1275 nt) | wspC | biofilm formation methyltransferase WspC |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CACCCGCCCAAACTGCCAAGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGC > NC_002947/1694894‑1695188 | cACCCGCCCAAACTGCCAAGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCCGGGTCGACGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAC‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCg > 1:419532/1‑150 (MQ=255) aCCCGCCCAAACTGCCAAGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGa > 1:756867/1‑150 (MQ=255) aCCCGCCCAAACTGCCAAGCGTGCGTTCACGACGTTAACCCCACATGTTTGTCCTGAGCCCATTGTGCCGTCCTCCCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGa < 1:541764/150‑1 (MQ=255) ccGCCCAAACTGCCAAGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGt < 1:175921/150‑1 (MQ=255) ccGCCCAAACTGCCAAGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCCTGTTCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGt > 2:75144/1‑150 (MQ=255) aaaCTGCCAAGCGTGCTTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCACCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTTCTGCCCGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CCCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGCCCAGCGAGCTGCTgg > 2:1957283/1‑150 (MQ=255) aaaCTGCCAAGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTgg > 2:1497604/1‑150 (MQ=255) aaCTGCCAAGCGTGGGTTCACGACGTTCCCCGCACCGGTATATCCGCAGCCCAGTGGGCCGTTGCCGCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGCTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGC‑TCACCGCCACCAGGGGGGCAGCGAGTTGCTGGc < 2:894339/150‑1 (MQ=255) cTGCCAAGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCg < 1:2191377/150‑1 (MQ=255) cTGCCAAGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCg < 2:1434770/150‑1 (MQ=255) cAAGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCAt > 1:1922964/1‑150 (MQ=255) aaGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGTTGCCTGTGGCGGCCAGG‑CCCG‑ACAAAACCAAACG‑GCAGAGCTACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCAtt > 1:540960/1‑150 (MQ=255) cgtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGc < 1:536570/150‑1 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACCGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt < 1:1507457/150‑1 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt > 1:1012089/1‑150 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt < 2:1012089/150‑1 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt > 1:1145390/1‑150 (MQ=255) ttCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTg < 1:266457/150‑1 (MQ=255) 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ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 2:278844/1‑150 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 2:1820587/1‑150 (MQ=255) gCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGcc > 2:2088511/1‑150 (MQ=255) gCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGcc > 2:45497/1‑150 (MQ=255) cACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCa < 2:208558/150‑1 (MQ=255) 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< 2:1848575/150‑1 (MQ=255) ttGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCACGCCCGTAGCGAATGCCAACGc > 2:1594052/1‑150 (MQ=255) gCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGtt > 1:1291958/1‑81 (MQ=255) gCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTa > 1:2408979/1‑150 (MQ=255) ccTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAc < 2:1284215/150‑1 (MQ=255) ccTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAc > 2:1235550/1‑150 (MQ=255) 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cagg‑ccag‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGta > 2:1128854/1‑150 (MQ=255) g‑ccag‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGtacta > 1:321204/1‑150 (MQ=255) g‑ccag‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGtacta > 2:1087905/1‑150 (MQ=255) ccag‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCGCAGGTGtactac > 1:864755/1‑150 (MQ=255) ccag‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGtactac > 2:793484/1‑150 (MQ=255) gcgAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTAGCGGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggct < 1:1872108/150‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggctgg < 2:1988180/150‑1 (MQ=255) ccGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGc < 1:1483544/109‑1 (MQ=255) ccGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGttt > 1:854554/1‑150 (MQ=255) ccGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGttt > 1:1334500/1‑150 (MQ=255) ccGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGGTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGc > 2:1483544/1‑109 (MQ=255) cgcgA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTg < 2:1882704/150‑1 (MQ=255) a‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCa < 1:390935/150‑1 (MQ=255) a‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCa < 2:1152165/150‑1 (MQ=255) gCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc > 1:1846937/1‑92 (MQ=255) cacaGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCTGCATTGCGAGGCCGGCGAATTCCGGTTCCATCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCTAACGCTACCTGAGCCCGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGt < 2:1130425/150‑1 (MQ=255) ccACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAggccccctcgtggctgtgctcgcgggctcgcgctggcctggccgccaccggcagcacacgccgcgaacgag < 1:1975280‑M2/137‑72 (MQ=255) ccACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATAc > 2:452035/1‑150 (MQ=255) gggggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTTCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAgg > 2:1534413/1‑150 (MQ=255) gggggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAgg < 2:1007653/150‑1 (MQ=255) gggggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAgg < 1:114857/150‑1 (MQ=255) ggggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAggccccctcgtggctgtgctcgcgggctcgcgctggcctggccgccaccggcagcacacgccgcgaacgaggcaacggcacactgggctgc < 2:2375921‑M2/150‑92 (MQ=255) gggCCtgctcgctggcaccggcattggccagccgggcaatgccggccagcaactcgctggccccctcgtggctgtgctcgcgggctcgcgctggcctggccgccaccggcagcacacgccgcgaacgaggcaacggcacactgggctgcg < 1:719947‑M1/150‑146 (MQ=255) gggCCtgctcgctggcaccggcattggccagccgggcaatgccggccagcaactcgctggccccctcgtggctgtgctagcgggctcgcgctggcctggccgccaccggcagcacacgccgcgaacgaggcaacggcacactgggctgcg > 2:327244‑M1/1‑5 (MQ=255) gggCCtgctcgctggcaccggcattggccagccgggcaatgccggccagcaactcgctggccccctcgtggcggggtttgctggctcgcgctggcctggccgccaccggcagcacacgccgcgaacgaggcaacggcacactgggctgcg > 1:1497604‑M1/1‑5 (MQ=255) gggCCtgctcgcgggcaccggcattggccagccgggcaatgccggccagcaactcgctggccccctcgtggctgtgctcgcgggctcgcgctggcctggccgccaccggcagcacacgccgcgaacgaggcaacggcacacttggctgcg < 1:1001561‑M1/150‑146 (MQ=255) gggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTTCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCg < 1:1534413/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCACCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGa > 1:1558392/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAggccccctcgtggctgtgctcgcgggctcgcgctggcctggccgccaccggcagcacacgccgcgaacgaggcaacggcacactgggctgcggata < 1:2232842‑M2/150‑97 (MQ=255) cAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTAGCTGTTTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgc > 2:1398072/1‑150 (MQ=255) | CACCCGCCCAAACTGCCAAGCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGC > NC_002947/1694894‑1695188 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |