| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 1777114 = | 101 (1.140) | 5 (0.060) | 5/230 | NT | 5.5% | coding (109/303 nt) | PP_5476 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1777148 = | 77 (0.930) | coding (143/303 nt) | PP_5476 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TGAGTAGGATACTGTTTTTATATACAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGA > NC_002947/1776967‑1777263 | ccttcccaggcgttctgccgaccaagatccgtccgtggtcttgttctggaaaattctcaaaccgaaacaactcgagatcccaggcttcctcatgctctagcagcgcccatagccgtgcggcttctgccagctcaagcatctcgcataGCt < 1:1860891‑M1/3‑1 (MQ=255)ccttcccaggcgttctgccgaccaagatccgtccgtgatgatgatctgaaaaattctcaaaccgaaacaactcgagatcccgggcttcctcatgctctagcagcgcccatagccgtgctgcttctgccagctcatgcgtgtcgcataGCt < 1:2298243‑M1/3‑1 (MQ=255) ttcccaggcgttctgccgaccaagatccgtccgtgatcttgatctgaaaaattctcaaaccgaaacaactcgagatcccaggcttcctcatgctctagcagcgcccatagccgtgcggcttctgccagctcaagcatctcgcataGCTCa < 2:1068313‑M1/5‑1 (MQ=255) 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tGTTTTTATATACAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCcggcgg < 2:1621903/150‑1 (MQ=255) tGTTTTTATATACAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCcggcgg < 2:299342/150‑1 (MQ=255) gTTTTTATATACAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCggg < 1:2130708/150‑1 (MQ=255) tttttATATACAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGga > 2:925841/1‑150 (MQ=255) tttttATATACAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGga < 1:490293/150‑1 (MQ=255) tatataCAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTCCTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATc < 1:2057409/150‑1 (MQ=255) tatataCAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATc < 2:357437/150‑1 (MQ=255) ataCAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGAc < 1:1524215/150‑1 (MQ=255) aCAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCAccgccg < 2:2055301/135‑1 (MQ=255) aCAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCAccgccg > 1:2055301/1‑135 (MQ=255) 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tCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCAACGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCgg > 1:1068313/1‑150 (MQ=255) cGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGt < 2:1690904/150‑1 (MQ=255) ggCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGtt < 1:176780/150‑1 (MQ=255) gCTGTGTTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTCTGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATggg < 1:2301127/103‑1 (MQ=255) gCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATggg > 2:2301127/1‑103 (MQ=255) cTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTg > 1:249858/1‑150 (MQ=255) 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gagaTGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCa < 1:333490/150‑1 (MQ=255) gaTGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGa > 1:392592/1‑123 (MQ=255) gaTGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGa < 2:392592/123‑1 (MQ=255) ggCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGa > 2:1822386/1‑120 (MQ=255) gAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGCCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAgtt < 1:1411666/120‑1 (MQ=255) gAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGCCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAgtt > 2:1411666/1‑120 (MQ=255) aaGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGTCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCagatcaagat < 2:66093/150‑1 (MQ=255) ggcTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCacgg > 1:2313538/1‑150 (MQ=255) ggcTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCacgg > 1:1617601/1‑150 (MQ=255) GCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCacgga > 1:326167‑M1/1‑150 (MQ=255) GCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCacgga > 1:1338767‑M1/1‑150 (MQ=255) | TGAGTAGGATACTGTTTTTATATACAGTAATGGTGAGCTATGGCCATCCTACTCCCTCCAGCGTGGGTCGCTGAACTTGATGATCGTTTTGCGCTGGTGACCGATCCGGACGGCCGCTCGGCTGTGCTGGCAGAGATGGCGAAGGCGGCTCACCGCCGGCGGGAGATCGACGCCGGTGAGCTATGCGAGATGCTTGAGCTGGCAGAAGCCGCACGGCTATGGGCGCTGCTAGAGCATGAGGAAGCCTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGA > NC_002947/1776967‑1777263 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |