| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1804733 | 115 (1.300) | 7 (0.080) | 7/238 | NT | 5.8% | intergenic (+96/‑76) | accA/tilS | acetyl‑CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha/tRNA lysidine(34) synthetase TilS |
| ? | NC_002947 | = 1804747 | 115 (1.340) | intergenic (+110/‑62) | accA/tilS | acetyl‑CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha/tRNA lysidine(34) synthetase TilS | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
AACGATGCGCTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGT > NC_002947/1804584‑1804882 | aaCGATGCGCTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGC > 2:152493‑M1/1‑150 (MQ=255) tGCGCTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGccc > 1:1682514/1‑150 (MQ=255) gcTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTg > 2:1379674/1‑150 (MQ=255) gcTACTGGCCCGTAGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTg > 2:2328813/1‑150 (MQ=255) cTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGa < 2:413175/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAgg < 2:1454043/150‑1 (MQ=255) ggCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCtt < 1:1669298/150‑1 (MQ=255) ccGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTgcg > 2:1768243‑M2/1‑147 (MQ=255) ccGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCGAATTCTTATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCCCAGGGTTCGCAGTTGTCAGTGGGTAAACCCCGCCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTgcg < 2:530261‑M2/150‑4 (MQ=255) cgtcgtTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTgcgc < 1:92191‑M2/150‑5 (MQ=255) tcgtTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCg > 2:159854/1‑150 (MQ=255) gtTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTa > 1:1548700/1‑150 (MQ=255) taGCTCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACgtgt > 1:1290273/2‑150 (MQ=255) gAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACgtgt < 2:2382378/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTgg < 1:20874/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTgg < 2:886181/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTgg < 1:2328813/150‑1 (MQ=255) cTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGc > 1:484547/1‑150 (MQ=255) gatgaGCTACGGCCTCTAATTCTTATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTATGTGTGGGAGCgg < 1:820356/150‑1 (MQ=255) atgaGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTCCCCCGTACGTGTGGGCGCcgg > 2:1380920/1‑150 (MQ=255) tgaGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGc > 1:2093051/1‑150 (MQ=255) tgaGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGc < 2:378506/150‑1 (MQ=255) aGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCAt < 1:304861/150‑1 (MQ=255) cTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCCGGCATGc < 2:92191/150‑1 (MQ=255) ggCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGTACGGCGCaagcctcaagggcagcgcaatacctgtaggagcgggtttacccgc < 1:1319610‑M1/150‑46 (MQ=255) ccTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGGTTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGa > 1:553291/1‑150 (MQ=255) ctctAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCAGCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTCAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaa < 1:2296280/150‑1 (MQ=255) tctAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGc > 1:199282/1‑142 (MQ=255) tctAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGc < 2:199282/142‑1 (MQ=255) tctAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAt < 2:1606733/150‑1 (MQ=255) tAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAt > 1:1885273/1‑148 (MQ=255) tAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAt < 2:1885273/148‑1 (MQ=255) aTTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCAAGCCTCAAGGGCAgcgcaatacctgtaggagcggg > 2:8150‑M2/1‑111 (MQ=255) aTTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCAAGCCTCAAGGGCAgcgcaatacctgtaggagcggg < 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(MQ=255) cccGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCtt > 1:1795418/1‑116 (MQ=255) cccGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTtctc > 2:1953936/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAAc < 1:2184563/105‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAAc > 2:2184563/1‑105 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACgccgccggagaa > 2:877695/1‑144 (MQ=255) gCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTgcgccgtacgtgtgggagcgggcatgcccgcgaacaccggcgaagccggtgccatcaatcacaagggccgcaaaacggccccggggcaaatcagaa > 1:664457‑M2/1‑33 (MQ=255) gCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTgcgccgtacgtgtgggagcgggcatgcccgcgaacaccggcgaagccggtgccatcaatcacaagggccgcaaaacggccccggggcaaatcagaa < 2:664457‑M2/129‑97 (MQ=255) gCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAgat < 2:1690513/96‑1 (MQ=255) gCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAAc < 2:1441182/121‑1 (MQ=255) gCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAAc > 1:1441182/1‑121 (MQ=255) aCAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCt > 2:698931/1‑150 (MQ=255) cAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTc < 2:484547/150‑1 (MQ=255) aGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCg > 1:1324677/1‑150 (MQ=255) aGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCg > 1:682705/1‑150 (MQ=255) gTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGGTCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTGGAt > 1:2322177/1‑150 (MQ=255) tATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTgcgcaatacctgtaggagcgggtttacccgcgaacaccggcgaagccggtgccatcaatcacaag > 1:485798‑M2/1‑22 (MQ=255) tGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCa < 2:2262860/150‑1 (MQ=255) gcgcaagcctcaagggcagcgcaatacctgtaggagcgggtttacccgcgaacaccggcgaagccggtgccatcaatcacaagggccgcaaaacggccccggggcaaatcagaattagaggccgtagctcatcaggcgctcgtaacgacg < 1:92191‑M1/150‑147 (MQ=255) gcgcaagcctcaagggcagcgcaatacctgtaggagcgggtttacccgcgaacaccggcgaagccggtgccatcaatcacaagggccgcaaaacggccccggggcaaatcagaattagaggccgtagctcatcaggcgctcgtaacgacg < 2:885814‑M1/150‑147 (MQ=255) cgcaagcctcaagggcagcgcaatacctgtagggcggggtttacccactgacaactgcgaaccctgggccatcaatcacaagggccgcaaaacggccccggggcaaataagaattcgaggccgtagctcatcaggcgctcgtaacgacgg < 2:530261‑M1/150‑148 (MQ=255) caagcctcaagggcagcgcaatacctgtaggagcgggtttacccgcgaacaccggcgaagccggtgccatcaatcacaagggccgcaaaacggccccggggcaaatcagaattagaggccgtagctcatcaggcgctcgtaacgacgggc < 1:5723‑M1/150‑150 (MQ=255) | AACGATGCGCTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGT > NC_002947/1804584‑1804882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |