| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 1804733 | 115 (1.300) | 7 (0.080) | 7/238 | NT | 5.8% | intergenic (+96/‑76) | accA/tilS | acetyl‑CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha/tRNA lysidine(34) synthetase TilS |
| ? | NC_002947 | = 1804747 | 115 (1.340) | intergenic (+110/‑62) | accA/tilS | acetyl‑CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha/tRNA lysidine(34) synthetase TilS | |||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGTCCTCCTGCACCTG > NC_002947/1804598‑1804895 | ggCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCtt < 1:1669298/150‑1 (MQ=255) gCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTg < 1:5723‑M2/150‑2 (MQ=255) ccGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTgcg > 2:1768243‑M2/1‑147 (MQ=255) ccGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCGAATTCTTATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCCCAGGGTTCGCAGTTGTCAGTGGGTAAACCCCGCCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTgcg < 2:530261‑M2/150‑4 (MQ=255) tcgtTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCg > 2:159854/1‑150 (MQ=255) taGCTCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACgtgt > 1:1290273/2‑150 (MQ=255) gAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACgtgt < 2:2382378/150‑1 (MQ=255) gAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACgtgt > 1:1460794/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTgg < 1:2328813/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTgg < 2:886181/150‑1 (MQ=255) tgatgaGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCg > 2:1454988/1‑150 (MQ=255) atgaGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTCCCCCGTACGTGTGGGCGCcgg > 2:1380920/1‑150 (MQ=255) tgaGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGc > 1:2092548/1‑150 (MQ=255) aGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCAt < 1:304861/150‑1 (MQ=255) cTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCCGGCATGc < 2:92191/150‑1 (MQ=255) tctAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGc > 1:199282/1‑142 (MQ=255) tAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAt > 1:1885273/1‑148 (MQ=255) tAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGc > 1:39446/1‑150 (MQ=255) aTTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGtgtg > 2:182452/1‑125 (MQ=255) aTTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGtgtg < 1:182452/125‑1 (MQ=255) aTTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCAAGCCTCAAGGGCAgcgcaatacctgtaggagcggg < 1:8150‑M2/133‑23 (MQ=255) aTTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCAAGCCTCAAGGGCAgcgcaatacctgtaggagcggg > 2:8150‑M2/1‑111 (MQ=255) cTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCt < 2:2399140/150‑1 (MQ=255) cTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCt < 1:1149034/150‑1 (MQ=255) 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tttGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGaa < 2:5723/150‑1 (MQ=255) tGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATc < 2:39446/150‑1 (MQ=255) gCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATcg > 1:1572758/1‑150 (MQ=255) ccccGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGGGCCGTACGCGTGGGAATGTGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATcga > 1:383649/1‑150 (MQ=38) ccccGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATcga < 2:1935999/150‑1 (MQ=255) acGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGaa < 2:1702040/143‑1 (MQ=255) ggggCGTTTTGCGGCTCTTGTTATTGATGTCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTAGTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCTTGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATcgagcgag < 2:383649/150‑1 (MQ=38) ggCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTCTTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGAAGGGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAgg > 1:740119/1‑150 (MQ=255) gCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCgg > 1:820772/1‑114 (MQ=255) gCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCgg < 2:820772/114‑1 (MQ=255) gTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTGGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGc > 1:610398/1‑117 (MQ=255) 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gCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAgat > 1:1690513/1‑96 (MQ=255) gCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAAc > 1:1441182/1‑121 (MQ=255) gCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAAc < 2:1441182/121‑1 (MQ=255) aCAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCt > 2:698931/1‑150 (MQ=255) cAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTc < 2:484547/150‑1 (MQ=255) aGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCg > 1:682705/1‑150 (MQ=255) gTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGGTCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTGGAt > 1:2322177/1‑150 (MQ=255) tATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTgcgcaatacctgtaggagcgggtttacccgcgaacaccggcgaagccggtgccatcaatcacaag < 2:485798‑M2/87‑66 (MQ=255) tATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTgcgcaatacctgtaggagcgggtttacccgcgaacaccggcgaagccggtgccatcaatcacaag > 1:485798‑M2/1‑22 (MQ=255) tGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCa < 2:1548700/150‑1 (MQ=255) tGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGc > 2:1447495/1‑122 (MQ=255) tGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGc < 1:1447495/122‑1 (MQ=255) cTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCt > 1:485630/1‑133 (MQ=255) ttGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGTcctcct > 1:1357869/1‑150 (MQ=255) ttGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGTcctcct > 2:619840/1‑150 (MQ=255) ggCTTGCGCCGTAGGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGCGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGACTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGTCCTCCTGCAc < 2:740119/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGTCCTCCTGCAc < 1:1380920/150‑1 (MQ=255) gCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGTCCTCCTGCAcc < 1:824091/150‑1 (MQ=255) gCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGTCCTCCTGCAcc > 1:1316239/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCAATCCTAGACCAAAACACGCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGTCCTCCTGCACctg > 1:2090701/1‑150 (MQ=255) | GGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCCCCACCTGGTACGTCGCCTTCTCCGGCGGCCTCGATTCCACCGTCCTCCTGCACCTG > NC_002947/1804598‑1804895 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |