| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1970763 = | 75 (0.850) | 12 (0.160) | 10/206 | NT | 16.7% | intergenic (+14/‑252) | mtnA/PP_mr25 | methylthioribose‑1‑phosphate isomerase/gyrA regulatory region |
| ? | NC_002947 | 1970865 = | 57 (0.770) | intergenic (+116/‑150) | mtnA/PP_mr25 | methylthioribose‑1‑phosphate isomerase/gyrA regulatory region | |||||
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TCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCCA > NC_002947/1970616‑1970912 | tCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CAC > 1:1626045‑M1/1‑150 (MQ=255) caatgagttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgatatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCa < 2:1847876‑M1/2‑1 (MQ=255) gAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCG > 1:1586064‑M1/1‑150 (MQ=255) tgagttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCg < 2:1963233‑M1/5‑1 (MQ=255) tgagttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCg > 2:2174546‑M1/146‑150 (MQ=255) agttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGc > 2:1168993‑M1/144‑150 (MQ=255) cccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGC < 2:1238510‑M1/141‑1 (MQ=255) cccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGC > 1:1238510‑M1/1‑141 (MQ=255) ccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTcg < 1:91411‑M1/14‑1 (MQ=255) ccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGG < 2:1760117‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGC > 1:1035476‑M1/1‑140 (MQ=255) atggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTcgcg > 1:299248‑M1/135‑150 (MQ=255) ggTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGC > 1:2119697‑M1/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CAC > 2:2284248‑M1/1‑134 (MQ=255) ggTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CAC < 1:2284248‑M1/134‑1 (MQ=255) ttCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGc > 2:361384/1‑150 (MQ=255) ttCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGc > 1:1180206/1‑150 (MQ=255) gATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCg > 1:978035/1‑150 (MQ=255) 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ccggccgACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGC‑AGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTgg < 1:2229480/150‑1 (MQ=255) cggccgACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTgg < 2:1313825/150‑1 (MQ=255) gccgACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGa < 1:449881/150‑1 (MQ=255) cgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTggg < 1:1254298‑M1/37‑1 (MQ=255) gACCTGATCGATGTGATCGTAACCGAACGCGGCATCATCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACGGGGatat > 2:91411/1‑150 (MQ=255) gATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGG > 1:82623‑M1/1‑121 (MQ=255) gATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGG < 2:82623‑M1/121‑1 (MQ=255) cGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGc < 1:1077321/150‑1 (MQ=255) gtgATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTa < 2:817117/150‑1 (MQ=255) gATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGATGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGTGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggc > 1:1706454‑M1/1‑115 (MQ=255) ttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAg < 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aaCGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGaa < 1:1660686/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAAc < 2:1626045/150‑1 (MQ=255) gCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑TGCCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagt < 2:2387328‑M1/150‑52 (MQ=255) cATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCCCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTgg > 2:538461/1‑150 (MQ=255) tatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTCGCgg < 1:1334490‑M1/17‑1 (MQ=255) tatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTCGCgg > 2:1334490‑M1/79‑95 (MQ=255) tcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTggg < 1:608027‑M1/74‑1 (MQ=255) cgtcgAGCGCCCGGATGATGACAAGCTGGCTAAGCTGGTTTGCCGCAAGTGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggag < 2:1706454‑M1/150‑57 (MQ=255) tcgAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGGTCAGCTGGTTTGCAGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGTGCTTGCTCGGTCCCGCTCGGATCTCGCATGGCGTTAGGGCCGTGGTGGACCTGTGGgggcg > 1:281086/1‑150 (MQ=255) aaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGgggcg > 1:1847876‑M1/73‑150 (MQ=255) gcgcCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑TGCCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgctatcccagtgggagcgggc > 2:1977505‑M1/1‑89 (MQ=255) 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ccagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGgggcgg < 2:1489166‑M1/79‑1 (MQ=255) ccagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGgggcgg > 1:1489166‑M1/37‑115 (MQ=255) ccGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAAc > 2:133231/1‑150 (MQ=255) gCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCG‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgggcaa < 2:409505‑M1/113‑64 (MQ=255) cAAGCGCCTGCATTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CGCCGGCATCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGCCGAGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAg < 2:37822/150‑1 (MQ=39) cAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATGCCCCG‑CACCGGCCTCTTCGCGTGCTcgaccggggtcacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtgaggcgatacaaaatcagt < 1:1835155‑M1/150‑101 (MQ=255) aaGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAgg > 1:214359/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAGGt < 2:347226/150‑1 (MQ=255) gcCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAGGTTTc > 2:1938426/1‑150 (MQ=255) gaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCctct < 1:1416129‑M1/11‑1 (MQ=255) gaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCctct > 2:1416129‑M1/25‑35 (MQ=255) cTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAGGTTTCaa < 1:1277306/150‑1 (MQ=255) aCTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCa > 2:2152597/1‑122 (MQ=255) cTGATTTTGTAT‑CGCCC‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGGCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAGGTTTCAAGcgcg < 2:281086/150‑1 (MQ=255) tGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgg < 1:1783512‑M1/95‑60 (MQ=255) gATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgggcaagccc > 2:2369620‑M1/1‑35 (MQ=255) gATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgggcaagccc < 1:2369620‑M1/102‑68 (MQ=255) aTTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGc > 1:2008306/1‑150 (MQ=255) aTTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGATCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCt > 1:2290137/1‑150 (MQ=255) tGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTgaga < 1:1559411/150‑1 (MQ=255) tGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTgaga < 2:1458995/150‑1 (MQ=255) t‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCaa > 2:962644/1‑115 (MQ=255) t‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACGGGGATATCGCATGGCTTTAGGGCCGTGTTGAACCTGTGGGCGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCACTAC‑AAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCGGCGACCaa > 1:337534/1‑150 (MQ=38) ccT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcg > 1:1954050‑M1/1‑23 (MQ=255) ccT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAg > 1:1694095/1‑124 (MQ=255) CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGgggc < 1:2159124‑M1/77‑1 (MQ=255) | TCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAT‑CGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATAC‑AAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCCA > NC_002947/1970616‑1970912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |