| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
ATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAA‑CGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTCAATGGGGCTATTGACTTAGCTTCGCCACCTGCGTAAATTTCGCGGCCTCAGCGAAGCAAAC > NC_002947/2271127‑2271422 | tGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCGAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAA‑Cgg > 1:1185929/1‑150 (MQ=255) tGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAA‑Cgg < 2:734051/150‑1 (MQ=255) ccTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAA‑CGGTTAATg < 2:2253369/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAC‑CGGTTAATGt > 1:227036/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAA‑CGGTTAAt < 1:2383448/148‑1 (MQ=255) ggTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAA‑CGGTTAATGTcc < 1:906425/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAA‑CGGTTAATGTc < 2:1902603/148‑1 (MQ=255) gTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAA‑CGGTTAATGTc > 1:1902603/1‑148 (MQ=255) 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1:1846466/1‑80 (MQ=255) tCCTACAA‑CGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCt < 2:1845506/80‑1 (MQ=255) cTACAA‑CGGTTAATGTCCGACtgtaggagcgggtttagccgcgaagaggccggcgcagtttaaacaaggtgctcaggtatagatcatcttgcg > 1:1754066‑M2/1‑21 (MQ=255) cTACAA‑CGGTTAATGTCCGACtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcgcagtttaaacaaggtgctcaggtatagatcatcttgcgggtcatgccgccatcgaccacaaactcctggccggt < 2:1248207‑M2/129‑109 (MQ=255) cTACAA‑CGGTTAATGTCCGACtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcgcagtttaaacaaggtgctcaggtatagatcatcttgcgggtcatgccgccatcgaccacaaactcctggccggt > 1:1248207‑M2/1‑21 (MQ=255) tACAgtcggacattaaccgttgtaggagcgggtttagccgcgaagaggccggcgcagtttaaacaaggtgctcaggtatagatcatcttgcgggtcatgccgccatcgaccacaaactcctggccggtgacaaatgccgcctggcgtgac > 2:865723‑M1/1‑4 (MQ=255) tACAgtcggacattaaccgttgtaggagcgggtttagccgcgaagaggccggcgcagtttaaacaaggtgctcaggtatagatcatcttgcgggtcatgccgccatcgaccacaaactcctggccggtgacaaatgccgcctggcgtgac < 2:94249‑M1/150‑147 (MQ=255) aCAgtcggacattaaccgttgtaggagcgggtttagccgcgaagaggccggcgcagtttaaacaaggtgctcaggtatagatcatcttgcgggtcatgccgccatcgaccacaaactcctggccggtgacaaatgccgcctggcgtgaca < 2:1508732‑M1/150‑148 (MQ=255) aCAgtcggacattaaccgttgtaggagcgggtttagccgcgaagaggccggcgcagtttaaacaaggtgctcaggtatagatcatcttgcgggtcatgccgccatcgaacacaaacccctggccggtgacaaatgccgcctggcgtgaca < 1:1666152‑M1/150‑148 (MQ=255) cAA‑CGGTTAATGTCCGACtgtaggagcgagtttagccgcgaagaggccggcgcagttta > 1:2222724‑M2/1‑18 (MQ=255) cAA‑CGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTCAATGGGGCTATTGACTTAGCTTCGCCACCTGCGTAAATTTCGCGGCCTCAGCGAAGCaaa > 1:1669109/1‑150 (MQ=255) cAA‑CGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTCAATGGGGCTATTGACTTAGCTTCGCCACCTGCGTAAATTTCGCGGCCTCAGCGAAGCaaa > 1:1095949/1‑150 (MQ=255) | ATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAA‑CGGTTAATGTCCGACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCACATCACGTTGCCTTTTTGAAAAAAATTCAATGGGGCTATTGACTTAGCTTCGCCACCTGCGTAAATTTCGCGGCCTCAGCGAAGCAAAC > NC_002947/2271127‑2271422 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |