New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GTTCGCCGCCACTTTGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTG > NC_002947/2275871‑2276168 | gTTCGCCGCCACTTTGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATCACCTCCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTT < 1:559335‑M1/150‑1 (MQ=255) gtatcgtcaccaagcagacgctgcaactgggcgtcaacgacaagggcgaacaggtgatggtatatgccatggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTg < 1:1049542‑M1/3‑1 (MQ=255) tcgtcaccaagcagacgctgcaactgggcgtcaacgacaagggcgaacaggtgatggtatatgccatggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTgccg < 1:1565102‑M1/6‑1 (MQ=255) gccACTTTGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACATTGCCGCCg > 2:1514249‑M1/1‑149 (MQ=255) aCTTTGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACg > 2:1085400/1‑150 (MQ=255) tttGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGcc > 2:1683401/1‑150 (MQ=255) aTGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTg < 2:2265458/150‑1 (MQ=255) tGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTgg > 1:1791368/1‑150 (MQ=255) gACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGcc > 2:388058/1‑150 (MQ=255) gAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACgg < 2:774601‑M2/150‑3 (MQ=255) aaTGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggc > 1:916138‑M2/1‑147 (MQ=255) aacgacaagggcgaacaggtgatggtatatgccatggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCAcggc < 2:1308509‑M1/38‑1 (MQ=255) acgacaagggcgaacaggtgatggtatatgccatggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCAcggcg > 1:1308509‑M1/112‑150 (MQ=255) gttgttGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggc < 1:1790257‑M1/150‑34 (MQ=255) ttgttgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggca < 1:689388‑M2/150‑8 (MQ=255) tgttgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaa < 2:588643‑M1/150‑36 (MQ=255) gttgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCGCCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAAt > 1:2378470/1‑150 (MQ=255) tgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaaggt < 1:276597‑M1/150‑39 (MQ=255) 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2:1666303/1‑150 (MQ=255) tCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCg < 1:2116837/134‑1 (MQ=255) tCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCg > 2:2116837/1‑134 (MQ=255) cACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGt < 2:689388/150‑1 (MQ=255) cACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGt < 1:388058/150‑1 (MQ=255) aCGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTg > 2:861593/1‑150 (MQ=255) tGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTCGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaa < 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tgCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCat > 2:969970/1‑150 (MQ=255) cgacgaTCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCAtata < 1:861593/150‑1 (MQ=255) gacgaTCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgc < 2:2157631/66‑1 (MQ=255) gacgaTCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCCTCGGTGATGACCACCCAGCTGTCCAGTTGTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATAc < 1:421864/150‑1 (MQ=255) acgaTCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATAcc < 1:1057088/150‑1 (MQ=255) gaTCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCAt > 2:542327/1‑150 (MQ=255) gaTCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCAt < 2:2027424/150‑1 (MQ=255) gaTCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTAGTGTTTTGGACATCCGGGGCTTCGGCGATGGCAtgtaatat > 1:1201389/1‑146 (MQ=255) tCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCa < 2:462816/150‑1 (MQ=255) aaCG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGAAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCAcc > 2:592941/1‑150 (MQ=255) aCG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCt > 1:2253849/1‑150 (MQ=255) aCG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCt > 2:2234229/1‑150 (MQ=255) cATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAg < 2:2294435/85‑1 (MQ=255) cATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAg > 1:2294435/1‑85 (MQ=255) cATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTc < 2:1788316/150‑1 (MQ=255) tCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggcaatgtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaac < 1:1514249‑M2/150‑111 (MQ=255) aCCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaacca < 1:276597‑M2/150‑113 (MQ=255) cTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCt > 2:861203/1‑140 (MQ=255) ttGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttgg > 1:608968‑M1/1‑8 (MQ=255) ttGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggcgaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatcca > 2:1495233‑M2/1‑35 (MQ=255) ttGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaaccaaca < 2:588643‑M2/150‑116 (MQ=255) | GTTCGCCGCCACTTTGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTG > NC_002947/2275871‑2276168 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |