| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGATACGGG > NC_002947/2275913‑2276211 | gttgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCGCCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAAt > 1:2378470/1‑150 (MQ=255) ttgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAAtt > 2:1049542/1‑150 (MQ=255) gTTACCCCACCCGCCACCCCGCACCCGATAATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcg > 2:1470918/1‑150 (MQ=255) 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ccGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcgc > 2:17124/1‑141 (MQ=255) ccGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATgg > 1:735060/1‑150 (MQ=255) ccGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATgg < 2:166064/150‑1 (MQ=255) ccaccaCGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCtt > 2:1057088/1‑150 (MQ=255) ccacGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCATCGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCgg > 2:2248669/1‑150 (MQ=255) cacGCGCTCAATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTACGCCCAGGATGGCTTCGGt < 1:104452/150‑1 (MQ=255) catggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAAtt > 1:954934‑M1/81‑125 (MQ=255) tCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGacc > 1:1576767/1‑150 (MQ=255) tCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCg > 2:2116837/1‑134 (MQ=255) tCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCg < 1:2116837/134‑1 (MQ=255) cACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGt < 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cACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCAc > 2:77133/1‑124 (MQ=255) cACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCAc < 1:77133/124‑1 (MQ=255) cACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGc < 1:2300817/132‑1 (MQ=255) aCCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAg > 2:614892/1‑150 (MQ=255) ccGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCa > 1:1429901/1‑117 (MQ=255) ccGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGACCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgtctgt < 2:2329403/76‑1 (MQ=255) ccACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATACTCCATCTCCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCa < 1:1666303/150‑1 (MQ=255) aCGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGtt < 2:596802/134‑1 (MQ=255) aCGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGtt > 1:596802/1‑134 (MQ=255) ggcggTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGAGGCCCAGTTGCAGCGt > 2:1684131/1‑150 (MQ=255) gTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGc < 2:1991422/150‑1 (MQ=255) cggctgCAATTTCGTCCTGCATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCTTGTTTTGCACATCCGGATCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTATGCtcgcgca < 2:1201389/150‑7 (MQ=255) cggcggCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGa < 2:409038/150‑1 (MQ=255) caaTTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGATAc < 1:1049542‑M2/147‑1 (MQ=255) aaTTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGATACg > 1:2062342‑M2/3‑150 (MQ=255) aTTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGATACgg < 2:2252238‑M2/149‑1 (MQ=255) ttGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGATACggg < 2:2062342/150‑1 (MQ=255) | GTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGATACGGG > NC_002947/2275913‑2276211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |