| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GCCACTTTGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTG > NC_002947/2275878‑2276174 | aCTTTGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACg > 2:1085400/1‑150 (MQ=255) aCTTTGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACg > 2:1552272/1‑150 (MQ=255) cTTTGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGc > 1:554516/1‑150 (MQ=255) tttGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGcc > 2:1683401/1‑150 (MQ=255) gcgcTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCAcgg < 2:2048962/150‑1 (MQ=255) aTGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTg < 2:2265458/150‑1 (MQ=255) tGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTgg > 1:1791368/1‑150 (MQ=255) ggACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCcacgccaccgccgtggcgggtggc < 1:1085400‑M1/150‑25 (MQ=255) gACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGcc > 2:388058/1‑150 (MQ=255) gAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACgg < 2:774601‑M2/150‑3 (MQ=255) aaTGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggc > 1:916138‑M2/1‑147 (MQ=255) aacgacaagggcgaacaggtgatggtatatgccatggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCAcggc < 2:1308509‑M1/38‑1 (MQ=255) acgacaagggcgaacaggtgatggtatatgccatggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCAcggcg > 1:1308509‑M1/112‑150 (MQ=255) gttgttGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggc < 1:1790257‑M1/150‑34 (MQ=255) tgttgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaa < 2:588643‑M1/150‑36 (MQ=255) ttgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAAtt > 2:1049542/1‑150 (MQ=255) tgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaaggt < 1:276597‑M1/150‑39 (MQ=255) gTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACATTGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaaggtga < 1:1514249‑M1/150‑41 (MQ=255) 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aaCG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCAcc > 1:2367192/1‑150 (MQ=255) aaCG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGAAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCAcc > 2:592941/1‑150 (MQ=255) aCG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCt > 2:2234229/1‑150 (MQ=255) aCG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCt > 1:2253849/1‑150 (MQ=255) g‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGt < 1:774601/150‑1 (MQ=255) cATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAg < 2:2294435/85‑1 (MQ=255) cATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAg > 1:2294435/1‑85 (MQ=255) cATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTc < 2:1788316/150‑1 (MQ=255) tCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggcaatgtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaac < 1:1514249‑M2/150‑111 (MQ=255) aCCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaacca < 1:276597‑M2/150‑113 (MQ=255) cTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCt > 2:861203/1‑140 (MQ=255) ttGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttgg < 2:608968‑M1/81‑74 (MQ=255) ttGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttgg > 1:608968‑M1/1‑8 (MQ=255) ttGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggcgaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatcca > 2:1495233‑M2/1‑35 (MQ=255) tGCCGCCgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaaccaacaa < 1:689388‑M1/150‑144 (MQ=255) gccgccCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaaccaacaac < 1:1790257‑M2/150‑118 (MQ=255) ccgccCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaaccaacaaca < 2:562109‑M2/150‑119 (MQ=255) gccgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaaccaacaacatt > 1:916138‑M1/1‑3 (MQ=255) GCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGtt > 1:2234229‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgtggccaccgccgtggcgggtggcgtgggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaaccaacaacattc < 2:774601‑M1/150‑149 (MQ=255) CCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATc > 1:452310‑M1/1‑129 (MQ=255) | GCCACTTTGACCATGGGCGCTATGGACGGAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACG‑CCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTG > NC_002947/2275878‑2276174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |