New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2276026 | 101 (1.140) | 8 (0.100) | 7/230 | NT | 7.4% | coding (1339/1644 nt) | PP_2006 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 2276053 | 106 (1.280) | coding (1312/1644 nt) | PP_2006 | membrane protein |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGA > NC_002947/2275906‑2276202 | gAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACgg < 2:774601‑M2/150‑3 (MQ=255) aacgacaagggcgaacaggtgatggtatatgccatggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCAcggc < 2:1308509‑M1/38‑1 (MQ=255) acgacaagggcgaacaggtgatggtatatgccatggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCAcggcg > 1:1308509‑M1/112‑150 (MQ=255) ttgttgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACggcggca < 1:689388‑M2/150‑8 (MQ=255) gttgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCGCCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAAt > 1:2378470/1‑150 (MQ=255) gTTACCCCACCCGCCACCCCGCACCCGATAATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcg > 2:1470918/1‑150 (MQ=255) gTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcg > 1:2027424/1‑150 (MQ=255) gTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcg > 1:1788316/1‑150 (MQ=255) ccGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcgc > 2:17124/1‑141 (MQ=255) ccGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATgg < 2:166064/150‑1 (MQ=255) ccGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATgg > 1:735060/1‑150 (MQ=255) ccaccaCGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCtt > 2:1057088/1‑150 (MQ=255) ccacGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCATCGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCgg > 2:2248669/1‑150 (MQ=255) cacGCGCTCAATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTACGCCCAGGATGGCTTCGGt < 1:104452/150‑1 (MQ=255) catggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAAtt < 2:954934‑M1/45‑1 (MQ=255) catggtcggagacccggatgtccaaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAAtt > 1:954934‑M1/81‑125 (MQ=255) tCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGacc > 1:1576767/1‑150 (MQ=255) gatgatCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGCTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGATTCGATGATGaccac > 2:1666303/1‑150 (MQ=255) tCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCg > 2:2116837/1‑134 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aCGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAg < 1:2232095/113‑1 (MQ=255) aCGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAg > 2:2232095/1‑113 (MQ=255) caaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCAcgg < 1:2009550‑M1/37‑1 (MQ=255) caaaacacgacagacatcgccacctgggtggtcatcaccgaagccatcctgggcgcaaTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCAcgg > 2:2009550‑M1/59‑95 (MQ=255) ttGCGGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgtctgtc < 2:1117116/149‑1 (MQ=255) aTGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgtctgtc < 1:1683401/150‑1 (MQ=255) aTGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATCGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgtctgtc < 1:1757562/150‑1 (MQ=255) tGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgtctgt < 1:1528589/148‑1 (MQ=255) tGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgtctgt > 2:1528589/1‑148 (MQ=255) gCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCgt < 1:702239/150‑1 (MQ=255) tGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGGAATTGCTTGCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCgtgt > 1:759580/1‑150 (MQ=255) tGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCgtgt > 1:462816/1‑150 (MQ=255) aaTGGCCGCCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTg < 2:2378470/150‑1 (MQ=255) aaTGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTg < 1:408448/150‑1 (MQ=255) tGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGa < 2:2278572/150‑1 (MQ=255) ggCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgt > 2:743815/1‑134 (MQ=255) caccaccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATc < 2:554516/150‑1 (MQ=255) accaccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGc > 2:1914885/1‑125 (MQ=255) accaccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGc < 1:1914885/125‑1 (MQ=255) accaccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATcc > 1:2189793/1‑150 (MQ=255) caccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCgg < 2:1576767/150‑1 (MQ=255) caccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCgg > 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cGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTcc < 2:1194273/150‑1 (MQ=255) gCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCg > 1:2081592/1‑150 (MQ=255) gCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGGTTTGGACATCCGGGTCTCCg > 1:1361131/1‑150 (MQ=255) cTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGGGGTGGCCACGGCGGGAATTTCGCCCAGGATATCTGCGGGGATGAACACCCAATAGCCGCTGTGAGTGGCGTTTTGGACATGCGGGTCTACgc > 2:855626/1‑149 (MQ=255) atgatgCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATg < 1:1200961/150‑1 (MQ=255) 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> 2:34090/1‑150 (MQ=255) cACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTCAc < 1:2403208/150‑1 (MQ=255) gCCACCCGCCACGGCGGTGGCGTGggcggcaaggtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaaccaacaacattccgtcc < 1:1085400‑M2/150‑127 (MQ=255) gCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGAc > 2:293664/1‑93 (MQ=255) gCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGAc < 1:293664/93‑1 (MQ=255) attgccGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGc < 2:1446286/129‑1 (MQ=255) attgccGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGc < 1:1174925/129‑1 (MQ=255) attgccGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGc > 1:1446286/5‑133 (MQ=255) cACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTTGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATCCCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCa < 1:1470918/150‑1 (MQ=255) cACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCAc < 1:77133/124‑1 (MQ=255) cACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCAc > 2:77133/1‑124 (MQ=255) cACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGc < 1:2300817/132‑1 (MQ=255) ccGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGACCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgtctgt < 2:2329403/76‑1 (MQ=255) ccACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATACTCCATCTCCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCa < 1:1666303/150‑1 (MQ=255) aCGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGtt < 2:596802/134‑1 (MQ=255) aCGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGtt > 1:596802/1‑134 (MQ=255) ggcggTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGAGGCCCAGTTGCAGCGt > 2:1684131/1‑150 (MQ=255) gTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGc < 2:1991422/150‑1 (MQ=255) cggctgCAATTTCGTCCTGCATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCTTGTTTTGCACATCCGGATCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTATGCtcgcgca < 2:1201389/150‑7 (MQ=255) cggcggcaatgtgatggcgttgatcgtcggcatcatcgcagcgttggtggtggccattgtcagcatcgtcatccacgtgatcatcgagcgcgtggtggcgggtggggtaaccaacaacattccgtccatagcgcccatggtcaaagtggc > 2:1514249‑M2/1‑1 (MQ=255) cggcggCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGa < 2:409038/150‑1 (MQ=255) | GAATGTTGTTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGA > NC_002947/2275906‑2276202 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |