| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2353681 = | 81 (0.910) | 6 (0.070) | 6/236 | NT | 7.2% | coding (894/1278 nt) | PP_2068 | multidrug MFS transporter membrane fusion protein |
| ? | NC_002947 | 2353703 = | 77 (0.910) | coding (872/1278 nt) | PP_2068 | multidrug MFS transporter membrane fusion protein | |||||
GACACGTATTTCTACCGGTTGCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATG > NC_002947/2353534‑2353825 | gACACGTATTTCTACCGGTTGCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCGAAACAGCCAACAGCGGCCGGAGCGCGGGCACTGACTGGCCGGTGCGCACGGGGCGCTGGcg > 2:2372317/1‑149 (MQ=255)gACACGTATTTCTACCGGTTGCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGcc > 1:429479/1‑150 (MQ=255) acacGTATTTCTACCGGTTGCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCg > 2:1382261/1‑150 (MQ=255) tttCTACCGGTTGCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑Gc > 1:508833/1‑150 (MQ=255) tttCTACCGGTTGCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑Gc > 1:936688/1‑150 (MQ=255) tttCTACCGGTTGCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑Gc > 2:76893/1‑150 (MQ=255) tCTACCGGTTGCCCGGGGAGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCg < 2:2359622/150‑1 (MQ=255) tACCGGTTGCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGt > 1:426765/1‑150 (MQ=255) tACCGGTTGCCCGGGGCGCATGCCAGTGAATGGTGTTTCCTTGTAGTTGTCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGt < 1:1812014/150‑1 (MQ=255) aCCGGTTGCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCgatc < 2:1082919/150‑4 (MQ=255) gTTGCCCGGGGCACATGCGGGCCAGTTGGGATCCCTTGTCGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTCATCg > 2:223769/1‑150 (MQ=255) gCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGgcg > 2:647290/1‑150 (MQ=255) ccGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGgcgcg > 2:633283/1‑150 (MQ=255) ggggCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGcgcgcg < 1:375522/150‑1 (MQ=255) aTGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACg > 2:906645/1‑150 (MQ=255) aTGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACg < 1:579040/150‑1 (MQ=255) agggCCTGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGgtg > 2:300365/2‑150 (MQ=255) gggCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGgtgt > 2:1693077/1‑150 (MQ=255) 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ttGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTc > 2:1038959/1‑150 (MQ=255) ttGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTc > 1:1406429/1‑150 (MQ=255) ggTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTc < 1:1200188/147‑1 (MQ=255) ggTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTc > 2:1200188/1‑147 (MQ=255) ggTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTc < 1:1693077/150‑1 (MQ=255) ttCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCTGGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCACGGAGCACGGTGTCCTGTTGGTccgg > 2:1324714/1‑148 (MQ=255) ccTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCt > 2:2286685/1‑150 (MQ=255) ttGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCa < 1:765195/103‑1 (MQ=255) ttGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCa > 2:765195/1‑103 (MQ=255) ttGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCg > 1:1777593/1‑150 (MQ=255) gTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGc > 1:1255849/1‑150 (MQ=255) gTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGc < 2:1146247/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAg < 1:2322360/150‑1 (MQ=255) gCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGCgctca > 1:2142690/1‑148 (MQ=255) cACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGCGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGctgctg > 1:1132596/1‑150 (MQ=255) cATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTggg > 2:1809417/1‑150 (MQ=255) aTAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGc > 1:174192/1‑150 (MQ=255) aGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCt > 2:2043418/1‑150 (MQ=255) gCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTgg < 2:426765/150‑1 (MQ=255) gCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTgg < 2:1170213/150‑1 (MQ=255) gCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTgg > 2:910577/1‑150 (MQ=255) 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1:1826923/150‑1 (MQ=255) tACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTTTGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGGTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTgg > 1:1489575/1‑150 (MQ=255) tACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTgg < 2:1423407/150‑1 (MQ=255) tACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTgg < 1:1451129/150‑1 (MQ=255) tACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTgg < 2:2381343/150‑1 (MQ=255) tACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTgg > 1:1496198/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCtggtgg < 2:2173121/91‑1 (MQ=255) gCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCtggtgg > 1:2173121/1‑91 (MQ=255) gCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGc > 2:1594519/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGc > 1:589738/1‑150 (MQ=255) acaggacaccgtgatccgcgcGCCGATCAC‑CGGCGTGGTCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGc < 1:908141‑M1/57‑1 (MQ=255) acaggacaccgtgatccgcgcGCCGATCAC‑CGGCGTGGTCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGc > 2:908141‑M1/22‑78 (MQ=255) cACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCtt < 1:1594519/150‑1 (MQ=255) cACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCCGGGCAGCCCAGGccga < 2:936688/150‑3 (MQ=255) cgcgGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCCGGGCAGCCCAGGccgagg < 1:906645/150‑5 (MQ=255) cggcgCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTtggcc < 2:589738/150‑1 (MQ=255) tccgcgcGCCGATCACCGGCG‑TGGTCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTg < 2:1019223‑M1/123‑1 (MQ=255) tccgcgcGCCGATCACCGGCG‑TGGTCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTg > 1:1019223‑M1/8‑130 (MQ=255) cgcTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGACTGCCCGGGCCTtggccatg < 2:1143717/150‑1 (MQ=255) | GACACGTATTTCTACCGGTTGCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATG > NC_002947/2353534‑2353825 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |