| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2353681 = | 81 (0.910) | 6 (0.070) | 6/236 | NT | 7.2% | coding (894/1278 nt) | PP_2068 | multidrug MFS transporter membrane fusion protein |
| ? | NC_002947 | 2353703 = | 77 (0.910) | coding (872/1278 nt) | PP_2068 | multidrug MFS transporter membrane fusion protein | |||||
GCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGTTGTGAGCGTTGCT > NC_002947/2353554‑2353844 | gCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGgcg > 2:647290/1‑150 (MQ=255) ccGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGgcgcg > 2:633283/1‑150 (MQ=255) ggggCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGcgcgcg < 1:375522/150‑1 (MQ=255) aTGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACg < 1:579040/150‑1 (MQ=255) aTGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACg > 2:906645/1‑150 (MQ=255) agggCCTGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGgtg > 2:300365/2‑150 (MQ=255) gggCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGgtgt > 2:1693077/1‑150 (MQ=255) gggCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGgtgt > 1:1146247/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTc < 1:633283/150‑1 (MQ=255) aGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGt > 1:1423407/1‑150 (MQ=255) gTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGtt > 2:10544/1‑150 (MQ=255) ttGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTc > 2:1038959/1‑150 (MQ=255) ttGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTc > 2:2005129/1‑150 (MQ=255) ttGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTc > 1:1406429/1‑150 (MQ=255) ggTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTc > 2:1200188/1‑147 (MQ=255) ggTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTc < 1:1200188/147‑1 (MQ=255) ggTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTc < 1:1693077/150‑1 (MQ=255) caggccgaggccgagctgcaacaacgggcagcggccctggcacgcgcccaggcccaccagcagctcgccgagcaggacgaacaggacaccgtgatccgcgcgccgaccacgccggtgatcggcGCGCGGa < 2:1019223‑M2/7‑1 (MQ=255) caggccgaggccgagctgcaacaacgggcagcggccctggcacgcgcccaggcccaccagcagctcgccgagcaggacgaacaggacaccgtgatccgcgcgccgaccacgccggtgatcggcGCGCGGa > 1:1019223‑M2/124‑130 (MQ=255) ttCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCTGGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCACGGAGCACGGTGTCCTGTTGGTccgg > 2:1324714/1‑148 (MQ=255) ccTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCt > 2:2286685/1‑150 (MQ=255) ttGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCg > 1:1777593/1‑150 (MQ=255) gTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGc < 2:1146247/150‑1 (MQ=255) gTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGc > 1:1255849/1‑150 (MQ=255) 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ttGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGgc > 2:2183978/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGCGGCCCTggca > 1:17293/1‑148 (MQ=255) tgctgcAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGgcg > 1:2381343/1‑150 (MQ=255) gctgcCGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCTCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCCC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGgcgc < 1:1126609/150‑1 (MQ=255) tgcAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGt < 1:1038959/150‑1 (MQ=255) cAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCGGCACAGCCGCCAGGGACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCGGGACGAGCAA‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTAGGCGCGTGc > 2:91026/1‑150 (MQ=255) ggggCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGa > 2:199341/1‑123 (MQ=255) ggggCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGa < 1:199341/123‑1 (MQ=255) ggggCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCa < 1:647290/150‑1 (MQ=255) gggCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACg > 2:473768/1‑97 (MQ=255) gggCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACg < 1:473768/97‑1 (MQ=255) 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cACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCtt < 1:1594519/150‑1 (MQ=255) cACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCCGGGCAGCCCAGGccga < 2:936688/150‑3 (MQ=255) cgcgGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCCGGGCAGCCCAGGccgagg < 1:906645/150‑5 (MQ=255) cggcgCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTtggcc < 2:589738/150‑1 (MQ=255) tccgcgcGCCGATCACCGGCG‑TGGTCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTg < 2:1019223‑M1/123‑1 (MQ=255) tccgcgcGCCGATCACCGGCG‑TGGTCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTg > 1:1019223‑M1/8‑130 (MQ=255) cgcTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGACTGCCCGGGCCTtggccatg < 2:1143717/150‑1 (MQ=255) gccgatcaccggcgtggtcggcGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGgc < 1:2151182‑M2/56‑1 (MQ=255) gccgatcaccggcgtggtcggcGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGgc > 2:2151182‑M2/23‑78 (MQ=255) CGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTTTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGtt > 1:1324714‑M1/1‑150 (MQ=255) cccAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGTtgt < 2:902710/149‑1 (MQ=255) ACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGTtgt > 1:10544‑M1/1‑150 (MQ=255) ccAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGTtgtg < 1:910577/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGTTGTGAGCg > 2:313792/1‑150 (MQ=255) caccgTGATCCGCGCGCCGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCtt > 2:360833/5‑129 (MQ=255) caccgTGATCCGCGCGCCGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCtt < 1:360833/125‑1 (MQ=255) cGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGTCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGcc < 1:1261766/119‑1 (MQ=255) cGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGcc > 2:1261766/1‑119 (MQ=255) cGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTtggccatgg > 2:1420102/1‑135 (MQ=255) cGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTtggccatgg < 1:1420102/135‑1 (MQ=255) cGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGTTGTGAGCGtt > 1:2270781/1‑150 (MQ=255) ttGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGCGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGTTGTGAGCGtttc > 1:1267006/2‑148 (MQ=255) gTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGc > 2:467861/1‑59 (MQ=255) gTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGc < 1:467861/59‑1 (MQ=255) gTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGTTGTGAGCGTTGc > 1:2311482/1‑150 (MQ=255) tGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGTTGTGAGCGTTGCt < 2:1496198/150‑1 (MQ=255) | GCCCGGGGCGCATGCGGGCCAGTTGGGTTTCCTTGTAGTTGGCCACTACATAGGCTTGCTGCAGGGGCACCACAGCCAACAGCGGCTGGCCCGGCACCACGTACTGGCCGGTGCGCACGCGGCGCTGGCCGACCAC‑GCCGGTGATCGGCGCGCGGATCACGGTGTCCTGTTCGTCCTGCTCGGCGAGCTGCTGGTGGGCCTGGGCGCGTGCCAGGGCCGCTGCCCGTTGTTGCAGCTCGGCCTCGGCCTGGGCTGCCCGGGCCTTGGCCATGGCCAGTTGTGAGCGTTGCT > NC_002947/2353554‑2353844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |