| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGG > NC_002947/2457230‑2457528 | tctGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGc > 1:105694/1‑150 (MQ=255) ctGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCa < 1:2075440/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGTTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCAc > 1:70766/1‑150 (MQ=255) gccTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGc > 2:2100698/1‑150 (MQ=255) cTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGccc < 1:444777/150‑1 (MQ=255) cTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTgcgc > 1:2299070/1‑150 (MQ=255) tCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTgg < 2:924045/138‑1 (MQ=255) tCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTgg > 1:924045/1‑138 (MQ=255) gcgTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAg > 1:457095/1‑150 (MQ=255) cccatggcctgcaggcgcgcagcgatcaagtcgacagcatgaccggcgacgatgctgttgaagtcgagctgcaccggggcatccttgcacagggctcgacctttgacgcgcaagtgctggtaacccacaCACTGGCCCAGGTGCGCCAGc > 2:192162‑M1/130‑150 (MQ=255) gTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCg > 1:724184/1‑150 (MQ=255) tCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTgg < 2:568573/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTgg < 1:191624/150‑1 (MQ=255) 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gcaagtgctggtaacccacaCGCTGGCGCACCTGGGCCAGTGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCaa > 2:1492851‑M1/21‑87 (MQ=255) gcaagtgctggtaacccacaCGCTGGCGCACCTGGGCCAGTGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCaa < 1:1492851‑M1/67‑1 (MQ=255) gTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTgcg < 2:85406/150‑1 (MQ=255) cccGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTgcgcgc > 2:1637227/1‑150 (MQ=255) ccGAACCACAGGCACTGGCAAAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGcc < 1:226445/150‑1 (MQ=255) gAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCgg > 1:995409/1‑119 (MQ=255) aCCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCa < 2:2406188/150‑1 (MQ=255) ccACAGGCAATGCCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCACTGTGCAAGCATGACCCGGTGCAGCTCGTCT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAg < 1:1099715/150‑1 (MQ=255) cacaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAgg < 1:1095806/150‑1 (MQ=255) cacaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAgg > 1:1778816/1‑150 (MQ=255) cacaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAg < 1:1985748/149‑1 (MQ=255) cacaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAg > 2:1985748/1‑149 (MQ=255) ccacaCGCTGGCGCACCTGGGCCAGTGTGTGGGTTACCAGTACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAg > 1:343610‑M1/6‑88 (MQ=255) acaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCCAGGTTGTCACGGTGCAAC‑CGTTTATCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGc < 1:2100698/150‑1 (MQ=255) acaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGc > 1:2160853/1‑150 (MQ=255) acaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGc > 1:1701055/1‑150 (MQ=255) ggCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCAt < 1:836975/150‑1 (MQ=255) CACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATgg > 2:1301822‑M1/1‑150 (MQ=255) | TCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGG > NC_002947/2457230‑2457528 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |