New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGCCGA > NC_002947/2457256‑2457550 | tCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTgg < 1:191624/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTgg < 2:568239/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTgg < 2:568573/150‑1 (MQ=255) 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ccACAGGCAATGCCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCACTGTGCAAGCATGACCCGGTGCAGCTCGTCT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAg < 1:1099715/150‑1 (MQ=255) cacaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAgg < 1:1095806/150‑1 (MQ=255) cacaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAgg > 1:1778816/1‑150 (MQ=255) cacaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAg < 1:1985748/149‑1 (MQ=255) cacaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAg > 2:1985748/1‑149 (MQ=255) ccacaCGCTGGCGCACCTGGGCCAGTGTGTGGGTTACCAGTACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAg < 2:343610‑M1/83‑1 (MQ=255) ccacaCGCTGGCGCACCTGGGCCAGTGTGTGGGTTACCAGTACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAg > 1:343610‑M1/6‑88 (MQ=255) acaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCCAGGTTGTCACGGTGCAAC‑CGTTTATCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGc < 1:2100698/150‑1 (MQ=255) acaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGc > 1:1701055/1‑150 (MQ=255) acaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGc > 1:2160853/1‑150 (MQ=255) ggCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCAt > 1:2081610/1‑150 (MQ=255) ggCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCAt < 1:836975/150‑1 (MQ=255) CACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATgg > 2:1301822‑M1/1‑150 (MQ=255) gctggcgcacctgggccagtgTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATggg > 2:192162‑M2/22‑150 (MQ=255) ctggcgcacctgggccagcgTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGt < 2:1901372‑M2/57‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGgt < 1:39398/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTc < 2:724184/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTcagc > 2:2247958/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATG‑CCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTcagca < 2:2215508/150‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGtttt < 1:2198204/150‑1 (MQ=255) cGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGcc < 2:1701055/150‑1 (MQ=255) gTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATAGCCCCTCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGCCg > 1:23060‑M2/2‑150 (MQ=255) tgtgGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGCCGa < 1:2247958/150‑1 (MQ=255) | TCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACT‑TCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGCCGA > NC_002947/2457256‑2457550 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |