| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 2660074 = | 87 (0.980) | 4 (0.050) | 4/228 | NT | 5.3% | coding (305/1536 nt) | PP_2331 | membrane protein |
| ? | NC_002947 | 2660112 = | 62 (0.760) | coding (267/1536 nt) | PP_2331 | membrane protein | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GCGCCATCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTGG > NC_002947/2659925‑2660221 | gcgcCATCAGGGCTTCAGCGGCGACCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGAc > 1:328770/1‑150 (MQ=255) gcCATCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGt > 1:492309/1‑150 (MQ=255) gcctgtggaacagcgacgccaaggtcgagttcgtggccagcaggaaggacccggtcaaggtgcagatgttcgtgccacggctgaaccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctgcaacagctacggggtcagcatcaccCGTg > 2:2299659‑M1/147‑150 (MQ=255) cATCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGc < 2:896734/150‑1 (MQ=255) ctgtggaacatcgacgccaaggtcgagttcgtggccagcagcaaggacccggtcaaggtgcagatgttcgtgccaccgctgaaccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGcc < 1:1559711‑M1/6‑1 (MQ=255) aTCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGcc < 1:2032601/150‑1 (MQ=255) aTCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGcc > 1:1404506/1‑150 (MQ=255) aTCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGcc > 2:1443444/1‑150 (MQ=255) tgtggaacatcgacgccaaggtcgagttcgtggccagcagcaaggacccggtcaaggtgcagatgttcgtgccaccgctgaaccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGCCg < 2:1338524‑M1/7‑1 (MQ=255) tggaacatcgacgccaaggtcgagttcgtggccagcagcaaggacccggtcaaggtgcagatgttcgtgccaccgctgaaccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGCCGAc > 1:2049838‑M1/142‑150 (MQ=255) gCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAg < 2:924872/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCACGTCGCGccagtg > 2:790334/1‑142 (MQ=255) aGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAAc < 2:568138/150‑1 (MQ=255) aGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAAc > 2:14299/1‑150 (MQ=255) aGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAAc < 1:252048/150‑1 (MQ=255) aGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAAc > 2:681803/1‑150 (MQ=255) gcggcgATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAAcc < 1:1019561/150‑1 (MQ=255) gATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAg > 1:179940/1‑139 (MQ=255) 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ttCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACg > 2:1044021/1‑150 (MQ=255) ttCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACg > 2:428199/1‑150 (MQ=255) ccaCGGCCAGGCCGTCCCGGAAGGTCGGGCATGTGACTTTGGTGTTCTCGGGGCTGAATGGCTTGGTGAGTACCAGGCGGTAGTCGAGTGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGTCCAGCTAACCTTGCGGTTGCCGTCGCCACGGt < 2:281899/148‑1 (MQ=255) gACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGtt < 1:428199/150‑1 (MQ=255) agcagcaaggacccggtcaaggtgcagatgttcgtgccaccgctgaaccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACgg > 1:631768‑M1/109‑147 (MQ=255) 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2:769513/68‑1 (MQ=255) gagGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCCGCCTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCAc > 1:1467215/1‑150 (MQ=255) agGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCAcc < 2:2337808/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCtt > 2:290711/1‑150 (MQ=255) gTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCgg < 1:1579680/150‑1 (MQ=255) ttGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCggg < 1:587721/150‑1 (MQ=255) tGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGt > 1:2238247/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGc < 1:1066987/38‑1 (MQ=255) aCTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGc > 2:1066987/1‑38 (MQ=255) aCTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCtt > 2:528540/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGATGAGCTCGTAGTTGAAGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCtt > 1:1499243/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTtg < 2:736561/150‑1 (MQ=255) gACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTgg < 1:1272784/150‑1 (MQ=255) aCGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCgg > 1:1731928/1‑100 (MQ=255) aCGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCgg < 2:1731928/100‑1 (MQ=255) | GCGCCATCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTGG > NC_002947/2659925‑2660221 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |