New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2660074 = | 87 (0.980) | 4 (0.050) | 4/228 | NT | 5.3% | coding (305/1536 nt) | PP_2331 | membrane protein |
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CGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTGGCCACGAACTCGACCTTGGCGTCGATGTTCCACAGGTCGTC > NC_002947/2659964‑2660261 | ccaCGGCCAGGCCGTCCCGGAAGGTCGGGCATGTGACTTTGGTGTTCTCGGGGCTGAATGGCTTGGTGAGTACCAGGCGGTAGTCGAGTGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGTCCAGCTAACCTTGCGGTTGCCGTCGCCACGGt < 2:281899/148‑1 (MQ=255) gACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGtt < 1:428199/150‑1 (MQ=255) agcagcaaggacccggtcaaggtgcagatgttcgtgccaccgctgaaccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACgg < 2:631768‑M1/39‑1 (MQ=255) agcagcaaggacccggtcaaggtgcagatgttcgtgccaccgctgaaccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACgg > 1:631768‑M1/109‑147 (MQ=255) cGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGa < 1:1399379/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCt > 2:35757/1‑150 (MQ=255) gAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAgtt < 2:2102103/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTCCCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGATAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGttgttg < 1:1044021/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGttgttg < 1:14299/150‑1 (MQ=255) gggCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCg > 2:1775448/1‑138 (MQ=255) gggCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCg < 1:1775448/138‑1 (MQ=255) ggCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGgaga > 1:967569/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGAt < 2:753358/150‑1 (MQ=255) 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tCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCg > 1:306982/1‑150 (MQ=255) tCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTAGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAg < 2:2137678/127‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCa < 2:328770/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGt > 2:1502727/1‑92 (MQ=255) cAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGt < 1:1502727/92‑1 (MQ=255) gCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGaa > 2:2084422/1‑150 (MQ=255) 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gTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTGGCCACGAACTCGACCTTGGCGTCGAt > 1:326909/1‑150 (MQ=255) ccGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAg < 1:1621284/66‑1 (MQ=255) ccGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAg > 2:1621284/1‑66 (MQ=255) cGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCgg < 2:1277523/106‑1 (MQ=255) cGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCgg > 1:1277523/1‑106 (MQ=255) gtcggcacgGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTGGCCACGAACTCGACCTTGGCGTCGATGTTCca > 1:2049838‑M2/10‑150 (MQ=255) cggcacgGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTGGCCACGAACTCGACCTTGGCGTCGATGTTCcaca < 2:1338524‑M2/143‑1 (MQ=255) ggcacgGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTGGCCACGAACTCGACCTTGGCGTCGATGTTCCACAg < 1:1559711‑M2/144‑1 (MQ=255) ggcacgGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTGGCCACGAACTCGACCTTGGCGTCGATGTTCCACAg > 2:967539‑M2/7‑150 (MQ=255) cacgGGTGATGCTGACCCCGTAGCTGTTGCAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCCGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTCCTGCTGGCCACGAACTCGACCTTGGCGTCGCTGTTCCACaggc > 2:2299659‑M2/5‑149 (MQ=255) gTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTGGCCACGAACTCGACCTTGGCGTCGATGTTCCACAGgtcgtc > 1:1710862/1‑150 (MQ=255) | CGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACCGGGTCCTTGCTGCTGGCCACGAACTCGACCTTGGCGTCGATGTTCCACAGGTCGTC > NC_002947/2659964‑2660261 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |