New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TTATCGGCGTAGCGCTTGATCGCCGCCGACCAGGCTTGAATTTCCCGGTGTCGGTCGGCCCGTTCAGCGGTCAGCGGTTCCAGGTCGCGCAGCCGCGCATGGACGTCGGCCAGCACGTCGCTCGCTTCATCCAAGGTGTCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTTGTCGTTGTCGTCCAGTTGCACCGCGGTGTAGCCCA > NC_002947/3222333‑3222627 | ttATCGGCGTAGCGCTTGATCGCCGCCGACCAGGCTTGAATTTCCCGGTGTCGGTCGGCCCGTTCAGCGGTCAGCGGTTCCAGGTCGCGCAGCCGCGCATGGACGTCGGCCAGCACGTCGCTCGCTTCATCCAAGGTGTCCCGCTCGccc > 1:136535/1‑150 (MQ=255) tgccacctgccatcgccctgttcggcatgttgctgttcgtgggctacaccgcggtgcaactggacgacaacgacaaccgattggtgtcgctcgaaaaacagcgctacccgacgctggaagctgccgacaacgtgatcttccagttctccc < 2:1627814‑M1/3‑1 (MQ=255) tCGGCGTAGCGCTTGATCGCCGCCGACCAGGCTTGAATTTCCCGGTGTCGGTCGGCCCGTTCAGCGGTCAGCGGTTCCAGGTCGCGCAGCCGCGCATGGACGTCGGCCAGCACGTCGCTCGCTTCATCCAAGGTGTCCCGCTCGCCCGC‑t > 1:1134071/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) gctcgctTCATCCAAGGTGTCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGgttgtcgttgtc < 2:1723886/150‑1 (MQ=255) ctcgctTCATCCAAGGTGTCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGttgtcgttgtcg > 1:884880/1‑150 (MQ=255) tcgctTCATCCAAGGTGTCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTtgtcgttgtcgt > 2:232041/1‑150 (MQ=255) tcgctTCATCCAAGGTGTCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTtgtcgttgtcgt > 2:1258736/1‑150 (MQ=255) tcgctTCATCCAAGGTGTCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTtgtcgttgtcgt > 2:1259116/1‑150 (MQ=255) 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cAAGGTGTCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCGGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTTGTCGTTGTCGTCCAGTTGCAc > 2:1252383/1‑150 (MQ=255) ggTGTCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTTGTCGTTGTCGTCCAGTTGCACcgc > 2:2023190/1‑150 (MQ=255) gtgtCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTTGTCGTTGTCGTCCAGTTGCACcgcg < 1:1544497/150‑1 (MQ=255) tCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTTGTCGTTGTCGTCCAGTTGCACCGCGgtg > 2:185682/1‑150 (MQ=255) ccGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTTGTCGTTGTCGTCCAGTTGCACCGCGGTGTa > 1:2088308/1‑150 (MQ=255) cGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCAGGGCAGGCGGTAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTTGTCGTTGTCGTCCAGTTGCACCGCGGTGTAGCCCa < 2:2371499/150‑1 (MQ=255) | TTATCGGCGTAGCGCTTGATCGCCGCCGACCAGGCTTGAATTTCCCGGTGTCGGTCGGCCCGTTCAGCGGTCAGCGGTTCCAGGTCGCGCAGCCGCGCATGGACGTCGGCCAGCACGTCGCTCGCTTCATCCAAGGTGTCCCGCTCGCCCGC‑TGCCACGGCGCTGTTGAGCAGGCCGGGCAGGCGGGAGAACTGGAAGATCACGTTGTCGGCAGCTTCCAGCGTTGGGTAGCGCTGTTTTTCGAGCGACACCAATCGGTTGTCGTTGTCGTCCAGTTGCACCGCGGTGTAGCCCA > NC_002947/3222333‑3222627 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |