| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GACGATGGCGAAATTGACCAGCAGGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCACGCGGTCCAGGGCATGGGCGTGGCGCAGCATG > NC_002947/3462395‑3462691 | gACGATGGCGAAATTGACCAGCAGGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGgtg > 2:1024089/1‑150 (MQ=255) aTGGCGAAATTGACCAGCAGGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCa > 2:1386849/1‑150 (MQ=255) tgaaaaaaaTGACAAGCAGGATAGCCAGCAGCGTCGGGATGATCATCAACAGACGGAGCAGAATATAAGCGGTCATGGCGTGGCCTTCCGGCTTTCGGCCAGCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTGCCTCCCACCAGGTGTCCAg < 2:114046/145‑1 (MQ=255) tGGCGAAATTGACCAGCAGGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGGCAGGCCTTCCGGCGTTCGGCTGGCTGGAGACTGGGTAGCTGGGTATGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAg < 1:1024089/150‑1 (MQ=255) ctggtccgcgccgacacccaggccgacatgctgcgccacgcccatgccctggaccgcgtgctgcaatggaattactactggatccccaactattacccaccgggcagctccaccgtctggtggaaccgcttcggcctgcccaagGTCCAg < 2:1892601‑M1/6‑1 (MQ=255) gCGAAATTGACCAGCAGGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGc > 1:1753191/1‑150 (MQ=255) aTTGACCAGCAGGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCg < 2:969403/150‑1 (MQ=255) cagcagGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAg < 2:1579585/150‑1 (MQ=255) cagcagGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAg > 1:181700/1‑150 (MQ=255) cagcagGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCGTCCTGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAg < 2:77355/150‑1 (MQ=255) gcagGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGt > 2:1447987/1‑150 (MQ=255) cagGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTg < 2:428694/150‑1 (MQ=255) ccaggccgacatgctgcgccacgcccatgccctggaccgcgtgctgcaatggaattactactggatccccaactattacccaccgggcagctccaccgtctggtggaaccgcttcggcctgcccaagGTCCAg > 2:1777031‑M1/128‑133 (MQ=255) ccaggccgacatgctgcgccacgcccatgccctggaccgcgtgctgcaatggaattactactggatccccaactattacccaccgggcagctccaccgtctggtggaaccgcttcggcctgcccaagGTCCAg < 1:1777031‑M1/6‑1 (MQ=255) ccaggccgacatgctgcgccacgcccatgccctggaccgcgtgctgcaatggaattactactggatccccaactattacccaccgggcagctccaccgtctggtggaaccgcttcggcctgcccaagGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTgg < 2:729899‑M1/23‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTg < 1:860347/150‑1 (MQ=255) gccgacatgctgcgccacgcccatgccctggaccgcgtgctgcaatggaattactactggatccccaactattacccaccgggcagctccaccgtctggtggaaccgcttcggcctgcccaagGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTg > 2:1751150‑M1/124‑150 (MQ=255) ccgacatgctgcgccacgcccatgccctggaccgcgtgctgcaatggaattactactggatccccaactattacccaccgggcagctccaccgtctggtggaaccgcttcggcctgcccaagGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTgg > 1:729899‑M1/123‑150 (MQ=255) 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gTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCag > 2:1904085/1‑120 (MQ=255) gTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCag < 1:1904085/120‑1 (MQ=255) tAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCACGCGGTCCAggg > 2:143699/1‑150 (MQ=255) ccgcttcggcctgcccaagGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGcc > 2:655819‑M1/20‑44 (MQ=255) ttACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCT‑GACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCACGCGGTCCAGGGCATGGGc < 2:444842/150‑1 (MQ=255) aCCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCa < 2:1949675/122‑1 (MQ=255) aCCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCa > 1:1949675/1‑122 (MQ=255) aCCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGAAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCAcgcg < 2:2065263/134‑1 (MQ=255) aCCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGAAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCAcgcg > 1:2065263/1‑134 (MQ=255) cTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGaa < 2:1727538/57‑1 (MQ=255) cTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGaa > 1:1727538/1‑57 (MQ=255) tCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCAtt > 2:2129359/1‑121 (MQ=255) tCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCAtt < 1:2129359/121‑1 (MQ=255) tCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCACGCGGTCCAGGGCATGGGCGTgg > 1:717118/1‑150 (MQ=255) cccACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCACGCGGTCCAGGGCATGGGCGTGgc < 2:912012/150‑1 (MQ=255) cccACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCACGCGGTCCAGGGCATGGGCGTGgc > 2:957351/1‑150 (MQ=255) accaGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTgg < 2:2398475/85‑1 (MQ=255) accaGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTgg > 1:2398475/1‑85 (MQ=255) accaGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATc < 2:2192852/101‑1 (MQ=255) accaGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATc > 1:2192852/1‑101 (MQ=255) accaGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCACGCGGTCCAGGGCATGGGCGTGGCgca > 2:1493993/1‑150 (MQ=255) accaGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGATCCTTGTGCAGGCCGAAGCGGTTAACCCTGACTGGAGTTCCGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGACCCAGTAGTAAGTCCATTGCAGCACGCGGTCCAGGGCATGGGCGTGGCgca < 1:1622267/150‑1 (MQ=255) aGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTggg < 2:1778149/83‑1 (MQ=255) aGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTggg > 1:1778149/1‑83 (MQ=255) gtgtCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCACGCGGTCCAGGGCATGGGCGTGGCGCAGCATg > 1:2020071/1‑150 (MQ=255) | GACGATGGCGAAATTGACCAGCAGGATTGCCAGCAGCGTCGGGATGATCAGCAACAGACGGCGCAGGATATAAGCGGTCATGGCGAGGCCTTCCGGCGTTCGGCCATCTGCGCGTTGGTCAGCGGGGTAGGGTTTACCTCCCACCAGGTGTCCAGGCCCTCGTCATAGGTGGCCTGGACCTTGGGCAGGCCGAAGCGGTTCCACCAGACGGTGGAGCTGCCCGGTGGGTAATAGTTGGGGATCCAGTAGTAATTCCATTGCAGCACGCGGTCCAGGGCATGGGCGTGGCGCAGCATG > NC_002947/3462395‑3462691 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |