| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3621157 | 96 (1.080) | 5 (0.060) | 5/240 | NT | 5.0% | coding (288/1053 nt) | PP_3191 | threonine ammonia‑lyase/dehydratase |
| ? | NC_002947 | = 3621180 | 95 (1.100) | coding (265/1053 nt) | PP_3191 | threonine ammonia‑lyase/dehydratase | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
AGCGCGCGCATTGCCTCTGTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGCCGGTCAGTGCCGACAAACGAGGGCTGTGCAAGAGCGGGGTAATGCTGACGGCCGGGCGG > NC_002947/3621008‑3621304 | aGCGCGCGCATTGCCTCTGTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCC > 2:1675739‑M1/1‑150 (MQ=255) ccTCTGTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCa > 2:319362/1‑150 (MQ=255) ctctGTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCAt > 2:1372305/1‑150 (MQ=255) ctctGTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGAGTACACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATTAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGGGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCAt > 1:571816/1‑150 (MQ=255) ctctGTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGATGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAAGGCCAGGGCCTCCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCAt > 1:1061349/1‑150 (MQ=255) tctGTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCggcaacaagatgcgc < 1:1675739‑M1/150‑16 (MQ=255) tGTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCtt > 1:1045369/1‑150 (MQ=255) tGTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACATTCACTGGAAGCCCAGCTATCTTGGCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGATGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCtt > 1:1253229/1‑150 (MQ=255) gTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCttg > 2:179882/1‑150 (MQ=255) tttGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCttgtt < 1:978093/150‑1 (MQ=255) tGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGc < 1:1417108/150‑1 (MQ=255) aTGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCaa > 1:1020178/1‑124 (MQ=255) aTGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCaa < 2:1020178/124‑1 (MQ=255) gcCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCGATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCGGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACGGCGaca > 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gtAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCttgttg < 2:1715754/124‑1 (MQ=255) gtAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCttgttg > 1:1715754/1‑124 (MQ=255) tAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCg > 1:1410893/1‑150 (MQ=255) ccTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGgtgt < 2:1147422/150‑1 (MQ=255) ccTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGgtgt > 2:1401848/1‑150 (MQ=255) cTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCCGGGCAAGAGAATACCTGAGCACCCGGGATCAGGCGGCTAGCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGtgtg > 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ttCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGAATGAGGCGGCTATCACAGATTTCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAAAAGGC‑GCATTTTGTTTCTGGCACCACGAAACTTGAACGAACCGGTGtgc > 1:1140640/1‑150 (MQ=255) aCTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGtgctgc > 2:1661542/1‑150 (MQ=255) cTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCa < 1:848357/150‑1 (MQ=255) cTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCa < 1:1648536/150‑1 (MQ=255) tGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATc > 2:720848/1‑106 (MQ=255) tGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATc < 1:720848/106‑1 (MQ=255) 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tATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCACCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGCCGGTCAGTGCCGACAAACGAGGGCTGTGCAagag > 1:2218844/1‑150 (MQ=255) tCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGcc > 2:135491/1‑115 (MQ=255) tCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGcc < 1:135491/115‑1 (MQ=255) cccccTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTgaa > 1:2026279/1‑64 (MQ=255) cccccTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTgaa < 2:2026279/64‑1 (MQ=255) ccccTGCTTGCGTGCCTCGGCCggcaacaggcgcatcttgttgctggccgaggcacgcaagcagggggtgatagccgcctcatccggtaaccatgggcaggccctggccctggccg < 2:74273‑M1/116‑95 (MQ=255) ccccTGCTTGCGTGCCTCGGCCggcaacaggcgcatcttgttgctggccgaggcacgcaagcagggggtgatagccgcctcatccggtaaccatgggcaggccctggccctggccg > 1:74273‑M1/1‑22 (MQ=255) ccccTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCa < 2:1705820/80‑1 (MQ=255) ccccTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCa > 1:1705820/1‑80 (MQ=255) ccccTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGCCGGTCAGTGCCGACAAACGAGGGCTGTGCAAGAGCGGGGt > 1:829951/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCg < 2:2213130/68‑1 (MQ=255) ccTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCg > 1:2213130/1‑68 (MQ=255) tGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGCCGGTCAGTGCCGACAAACGAGAGCTGTTCAAGAGCGGGGTAATg > 1:1929254/1‑150 (MQ=255) gCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGGGCAGCACTTCACAGCCGGTCAGTGCCGACAAACGAGGGCTGTGCAAGAGCGGGGTAATGc < 2:1977037/150‑1 (MQ=255) gCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGCCGGTCAGTGCCGACAAACGAGGGCTGTGCAAGAGCGGGGTAATGCTGAc < 2:1804841/150‑1 (MQ=255) gCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGCCGGTCAGTGCCGACAAACGAGGGCTGTGCAAGAGCGGGGTAATGCTGAc > 1:1026404/1‑150 (MQ=255) gTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGCCGGTCAGTGCCGACAAACGAGGGCTGTGCAAGAGCGGGGTAATGCTGACgg > 1:1499140/1‑150 (MQ=255) gCCGCGGCCGGCAACAGGC‑TCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGCCGGTCAGTGCCGACAAACGAGGGCTGTGCAAGAGCGGGGTAATGCTGACGGcc > 2:1901500/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTggccgaggcacgcaagcagggggtgatagccgcctcatccggtaaccatgg > 2:1711280‑M2/1‑31 (MQ=255) ccTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTggccgaggcacgcaagcagggggtgatagccgcctcatccggtaaccatgg < 1:1711280‑M2/82‑52 (MQ=255) cggccggcAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGCGGGTCAGTGCCGACAAACGAGGGCTGTGCAAGAGCGGGGTAATGCTGACGGCCGGGc < 2:1418687/150‑1 (MQ=255) ccagcaacaagatgcgcctgttgccggccgaggcacgcaagcagggggtgatagccgcctcatccggtaaccatgggcaggccctggccctggccggcaagatggctggcgtgccagtgaaggtctacaccaccacgggcgcatcggcat < 1:862020‑M1/150‑149 (MQ=255) | AGCGCGCGCATTGCCTCTGTTTTGTATGCCGATGCGCCCGTGGTGGTGTAGACCTTCACTGGCACGCCAGCCATCTTGCCGGCCAGGGCCAGGGCCTGCCCATGGTTACCGGATGAGGCGGCTATCACCCCCTGCTTGCGTGCCTCGGCCGGCAACAGGC‑GCATCTTGTTGCTGGCACCGCGAAACTTGAACGAACCGGTGTGCTGCAGGTGTTCGCATTTGAGCAGCACTTCACAGCCGGTCAGTGCCGACAAACGAGGGCTGTGCAAGAGCGGGGTAATGCTGACGGCCGGGCGG > NC_002947/3621008‑3621304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |