New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 3779702 = | 85 (1.000) | coding (110/1575 nt) | nikA | nickel ABC transporter substrate‑binding protein |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGC > NC_002947/3779520‑3779818 | aacctgccaggcctcagccagccatggctccagcgtacccgcggacgtacgccgcaccatggtttcatagaccaaggcctgggcgtacatctggttgggggaatagccacgcgggtcgagcggcccggcattcacaggccaggagtacac > 1:1741333‑M1/150‑150 (MQ=255) ctgccaggcctcagccagccatggctccagcgtacccgcggcggtatagcgcaccaggggttcatagaccatggcctgggcgtacatctggttgggggaatagccacgcgggtcgagcggcccggcattcacaggccaggagtacaCCAg < 1:544610‑M1/4‑1 (MQ=255) ctgccaggcctcagccagccatggctccagcgtacccgcggcggtatagcgcaccaggggttcatagaccatggcctgggcgtacatctggttgggggaatagccacgcgggtcgagcggcccggcattcacaggccaggagtacaCCAg < 1:2083965‑M1/4‑1 (MQ=255) atgatTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCGGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAgc < 2:595651/150‑1 (MQ=255) atgatTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAgc > 1:2236744/1‑150 (MQ=255) tttCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAgccgcg > 2:1782896/1‑150 (MQ=255) cGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCgccgcc > 1:248942/1‑150 (MQ=255) tAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGa < 1:880838/150‑1 (MQ=255) aCATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCa > 2:1436331/1‑150 (MQ=255) atcatACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAg > 2:722261/1‑150 (MQ=255) catACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAggg < 1:1436331/150‑1 (MQ=255) atACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGc > 1:537392/1‑150 (MQ=255) tACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGcc < 1:1919176/150‑1 (MQ=255) 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ctcctTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTAt < 1:722261/150‑1 (MQ=255) tcctTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGa > 1:1062771/1‑100 (MQ=255) tcctTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGa < 2:1062771/100‑1 (MQ=255) ttcttcttGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAAc < 2:1262726/150‑1 (MQ=255) cttcttGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCa < 2:2310681/119‑1 (MQ=255) cttcttGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCa > 1:2310681/1‑119 (MQ=255) tgcttGCGGCGCGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTTTACTCCTGGCCTGTGAACGCCGGGCCGCTCGTCCGCCGTTTCTACTCCCCCTTCCAGTTGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAAcccc < 1:47408/148‑1 (MQ=255) cttGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTg < 2:1857939/150‑1 (MQ=255) cttGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTg < 1:164417/150‑1 (MQ=255) cggcattcacaggccaggagtacaCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTg > 1:1910248‑M1/25‑56 (MQ=255) cggcattcacaggccaggagtacaCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTg < 2:1910248‑M1/32‑1 (MQ=255) gctgcGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTg > 2:2287991/1‑150 (MQ=255) gctgcGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTg > 2:845194/1‑150 (MQ=255) tgcgtgcgCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTgcg > 2:1541563/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATAccgc > 2:544610/1‑150 (MQ=255) ctgcGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGCTGTACGCACAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATAccgccg > 2:2071992/1‑150 (MQ=255) tgcGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACcgccgc > 1:1822506/1‑150 (MQ=255) gcCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCggg > 1:1720660/1‑150 (MQ=255) cGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGt > 1:1692473/1‑99 (MQ=255) cGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGt < 2:1692473/99‑1 (MQ=255) ggCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTAc > 2:1390651/1‑150 (MQ=255) CCAGCAGCGCCGCCGAGCAAGGGCTTCAGCGGGTGTATGCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGc > 2:1946749‑M1/1‑150 (MQ=255) | TAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGC > NC_002947/3779520‑3779818 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |