New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TCATAGATGGCCCAGGCACTGATGCGGTTCGGCATCGGCGCTGCGGCTTCACCGGTGACCACGTACTGCTGCATATGCTGGGCAGCCAGCAGCACGCAATTCTCGTACAGGGCACTTTGCACCTCACGGCCCCTGCCGGTGCTGTGGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCGGGCGCCCCACCGGCCCTGTCATGTAGGCCAGACCGGCCATCATCTGTACCACTTCATCCAGCGCCAGGC > NC_002947/3844034‑3844331 | tCATAGATGGCCCAGGCACTGATGCGGTTCGGCATCGGCGCTGCGGCTTCACCGGTGACCACGTACTGCTGCATATGCTGGGCAGCCAGCAGCACGCAATTCTCGTACAGGGCACTTTGCACCTCACGGCCCCTGCCGGTGCTGTGGCGC > 2:1863128‑M1/1‑150 (MQ=255) aTAGATGGCCCAGGCACTGATGCGGTTCGGCATCGGCGCTGCGGCTTCACCGGTGACCACGTACTGCTGCATAGGCTGGGCAGCCAGCAGCACGCAATTCTCGTACAGGGCACTTTGCACCTCACGGCCCCTGCCGGTGCTGTGGCGCTc < 2:932937/150‑1 (MQ=255) aGATGTCCCACTCACTGATGCGGTTCGGCATCGGCTCTGCGGCTTCACCGGTGACCACGTACTGCTGCATATGCTGGGCAGCCAGCAGCACGCAATTCTCGTACAGGGCACTTTGCACCTCACGGCCCCTGCCGGTGCTGTGGCTCTCgg < 2:536968/150‑2 (MQ=255) 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ccccTGCCGGTGCTGTGGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACCTGACACCCATGATGTCGGTGAGCTATCTGCCTGCGCGCAGCGGGCGCCCCACCGGCCCTGTCATGTAGGCCAGACCGGCCATCATCTGTAcc > 1:2099064/1‑150 (MQ=255) cTGCCGGTGCTGTGGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCGGGCGCCCCACCGGCCCTGTCATGTAGGCCAGACCGGCCATCATCTGTACCACt > 1:15123/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTGCTGTGGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCgg < 2:249799/97‑1 (MQ=255) tGCCGGTGCTGTGGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCgg > 1:249799/1‑97 (MQ=255) ggTGCTGTGGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCGGGCGCCCCACCGGCCCTGTCATGTAGGCCAGACCGGCCATCATCTGTACCACTTCATc < 2:2153281/150‑1 (MQ=255) tgctgcGGTGCCGGTTGAGTGCTGCTAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCGGGCGCCCCACCGGCCCTGTCATGTAGGCCAGACCGGCCATCATCTGTACCACTTCATCCa < 2:751643/150‑1 (MQ=255) tGCTGTGGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCGGGCGCCCCACCGGCCCTGTCATGTAGGCCAGAcc < 2:954398/124‑1 (MQ=255) tGCTGTGGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCGGGCGCCCCACCGGCCCTGTCATGTAGGCCAGAcc > 1:954398/1‑124 (MQ=255) cTGTGGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGATCTGCCTGAGTGCAGCGGGCGCCCCACCGGACCTGTCATGTAGGCCAGACCGGCCATCATCTGTACCACTTCATCCAgc < 1:1977556/150‑1 (MQ=255) gtgGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGgcgccacagcaccggcaggggccgtgaggtgcaaagtgccctgtacgagaattgcgtgctgctggctgcccagcatatgcagcagtacgtggt > 2:1513900‑M2/1‑34 (MQ=255) gtgGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGgcgccacagcaccggcaggggccgtgaggtgcaaagtgccctgtacgagaattgcgtgctgctggctgcccagcatatgcagcagtacgtggt < 1:1513900‑M2/127‑94 (MQ=255) ggCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGgcgccacagcaccggcaggggccgtgaggtgcaaagtgccctgtacgagaattgc > 2:1146215‑M2/1‑32 (MQ=255) ggCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGgcgccacagcaccggcaggggccgtgaggtgcaaagtgccctgtacgagaattgc < 1:1146215‑M2/87‑56 (MQ=255) gcgccattggcgtgctggccgcactcaacgagcgccacagcaccggcaggggccgtgaggtgcaaagtgccctgtacgagaattgcgtgctgctggctgcccagc > 2:1551777‑M1/1‑4 (MQ=255) gcgccattggcgtgctggccgcactcaacgagcgccacagcaccggcaggggccgtgaggtgcaaa > 2:2369417‑M1/1‑4 (MQ=255) gcgccattggcgtgctggccgcactcaacgagcgccacagcaccggcaggggccgtgaggtgcaaa < 1:2369417‑M1/66‑63 (MQ=255) gcgcTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGgcgccacagcaccggcaggggccgtgaggtgcaaagtgccctgtacgagaattgcgtgctgctggctgcccagcatatgcagcagtacgtggtcaccggtgaagccgcagcgccgatgc < 1:342076‑M2/150‑120 (MQ=255) cgcTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCGGGCGCCCCACCGGCCCTGTCATGTAGGCCAGACCGGCCATCATCTGTAc > 1:995148/1‑131 (MQ=255) gcTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGgcgccacagcaccggcaggggccgtgaggtgcaaagtgccctgtacgagaattgcgtgctgctggctgcccagcatatgcagcagtacgtggtcaccggtgaagccgcagcgccgatgccg < 2:2387852‑M2/150‑122 (MQ=255) gcTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGgcgccacagcaccggcaggggccgtgaggtgcaaagtgccctgtacgagaattgcgtgctgctggctgcccagcatatgcagcagtacgtggtcaccggtgaagccgcagcgccgatgccg < 2:160340‑M2/150‑122 (MQ=255) gcTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGctgc > 1:153775/1‑69 (MQ=255) gcTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGctgc < 2:153775/69‑1 (MQ=255) gcTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCGGGCGCCCCACCGGCCCTGTCATGTAGGCCAGACCGGCCATCATCTGTACCACTTCATCCAGCGCCAGGc > 1:526545/1‑150 (MQ=255) | TCATAGATGGCCCAGGCACTGATGCGGTTCGGCATCGGCGCTGCGGCTTCACCGGTGACCACGTACTGCTGCATATGCTGGGCAGCCAGCAGCACGCAATTCTCGTACAGGGCACTTTGCACCTCACGGCCCCTGCCGGTGCTGTGGCGCTCGTTGAGTGCGGCCAGCACGCCAATGGCGCCGAACATGCCACCCATGATGTCGTTCACCGAGCTGCCTGCGCGCAGCGGGCGCCCCACCGGCCCTGTCATGTAGGCCAGACCGGCCATCATCTGTACCACTTCATCCAGCGCCAGGC > NC_002947/3844034‑3844331 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |