| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4003395 | 86 (0.970) | 6 (0.070) | 6/232 | NT | 6.9% | intergenic (+9/+74) | PP_3531/PP_3532 | hypothetical protein/AsnC family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 4003419 | 81 (0.970) | intergenic (+33/+50) | PP_3531/PP_3532 | hypothetical protein/AsnC family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
ACCGGGTGACCGAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATGGCGTTCAGC > NC_002947/4003247‑4003544 | gggtgaccgAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCCGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGc < 2:1328883/150‑1 (MQ=255) ggtgaccgAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGACGGCcggct < 2:2211443‑M1/150‑6 (MQ=255) gtgaccgAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCCGCAGGCTg < 2:919287/150‑1 (MQ=255) tgaccgAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGc > 1:2275988/1‑150 (MQ=255) gaccgAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCa < 2:2045707/150‑1 (MQ=255) cgcggTGAACTACCAGTTGCAGGCCGCGCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGAc > 2:704621/4‑150 (MQ=255) gAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGAcc > 2:1615740/1‑150 (MQ=255) gAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGAcc > 1:1635703/1‑150 (MQ=255) tGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACt < 2:1328243/150‑1 (MQ=255) aCCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTgc > 2:1985855/1‑150 (MQ=255) aCCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTgc > 2:463471/1‑150 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAgg > 1:1970218/1‑133 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAgg < 2:1970218/133‑1 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTgcag > 2:2018126/1‑150 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTgcag < 2:1539718/150‑1 (MQ=255) aCCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTgcagca < 2:325415/150‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGCATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGCCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgc > 1:997685‑M2/1‑148 (MQ=255) gCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccgg > 2:955038‑M2/1‑145 (MQ=255) aGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggca < 2:1762115‑M2/150‑8 (MQ=255) gccgccCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgc < 2:1873499‑M2/143‑3 (MQ=255) gccgccCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgc > 1:1873499‑M2/1‑141 (MQ=255) ccgccCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTTCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCt < 1:829264/150‑1 (MQ=255) cccTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCttttt < 1:1985855/150‑1 (MQ=255) 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2:311965/1‑108 (MQ=255) aGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGa < 1:311965/108‑1 (MQ=255) gctggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGcc > 1:1502068/1‑150 (MQ=255) ctggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTATGCAATACACCTGGCAAAAGGCCt < 2:728565/150‑1 (MQ=255) tggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccgg < 2:1168693‑M1/115‑30 (MQ=255) tggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccgg > 1:1168693‑M1/1‑86 (MQ=255) tggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTtgtg > 1:2128102/1‑127 (MQ=255) tggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTtgtg < 2:2128102/127‑1 (MQ=255) cAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACAcc < 1:491128/132‑1 (MQ=255) cAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACAcc > 2:491128/1‑132 (MQ=255) cAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTc > 2:526940/1‑150 (MQ=255) aaCCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTg > 2:347222/1‑133 (MQ=255) aaCCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTcc > 1:2031599/1‑150 (MQ=255) 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tGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGc > 1:2150392/1‑150 (MQ=255) gcgcCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCggg > 2:1967990/1‑150 (MQ=255) gcCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTc < 2:956451/109‑1 (MQ=255) gcCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTc > 1:956451/1‑109 (MQ=255) ccAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATc < 1:776460/150‑1 (MQ=255) cAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCg > 2:341661/1‑150 (MQ=255) cAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCg < 1:1333067/150‑1 (MQ=255) aCCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAg < 1:1967990/150‑1 (MQ=255) aCCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTCGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAg < 1:2297173/150‑1 (MQ=255) ccTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGc < 2:1635703/150‑1 (MQ=255) ccTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCCGGTCTCAGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGc < 1:1615740/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCg > 1:752261/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcct < 1:2092940‑M1/150‑144 (MQ=255) tGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcct < 2:1762115‑M1/150‑144 (MQ=255) ccGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcctgc > 2:955038‑M1/1‑5 (MQ=255) ccGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggcca > 1:1168693‑M2/1‑29 (MQ=255) ggCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggc > 2:1421182‑M2/1‑27 (MQ=255) ggCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggc < 1:1421182‑M2/88‑62 (MQ=255) gCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcaggcaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatgcaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcctgcaac > 1:997685‑M1/1‑2 (MQ=255) gCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggc < 2:1873499‑M1/143‑142 (MQ=255) ccctgctgcattcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcctgcaact < 1:2211096‑M1/150‑150 (MQ=255) cAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGtt > 1:937311/1‑116 (MQ=255) cAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGtt < 2:937311/116‑1 (MQ=255) | ACCGGGTGACCGAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAGGCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATGGCGTTCAGC > NC_002947/4003247‑4003544 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |