| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 4021749 | 69 (0.780) | 4 (0.050) | 4/234 | NT | 5.0% | coding (601/942 nt) | PP_3547 | NAD(P)‑binding oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | = 4021806 | 85 (1.010) | coding (544/942 nt) | PP_3547 | NAD(P)‑binding oxidoreductase | |||||
ACGCCATTGACGCGCACGCCCTCGCCTGCCACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGT > NC_002947/4021601‑4021898 | aCGCCATTGACGCGCACGCCCTCGCCTGCCACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCc > 2:1852362‑M1/1‑149 (MQ=255) cATTGACGCGCACGCCCTCGCCTGCCACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCGCTTGGAGGGTTCATAGTCGACATATTCGTTGGGGGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCtt > 1:1966444/1‑150 (MQ=255) gcgcACGCCCTCGCCTGCCACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGcc < 2:2194455/150‑1 (MQ=255) gcACGCCCTCGCCTGCCACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCAt < 2:989058/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCTGCCACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGccaag > 2:954296/1‑147 (MQ=255) gCCTGCCACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGgcgcgc < 1:2137416/150‑1 (MQ=255) gCCACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATg > 1:640172/1‑150 (MQ=255) gCCACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATg > 1:1985803/1‑150 (MQ=255) cACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATgcg < 2:2015132/150‑1 (MQ=255) ttcttTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCgcag > 2:1628728/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGc < 1:1628728/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCg < 1:1814589/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCGATGGTGAAGGGGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGt < 1:2279562/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGTGGCATAGTCAACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTg < 2:2277645/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTg < 1:211207/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGACGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGTACAGTCGGAATTTTCGGTGAACGTACCCAGTCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTg < 1:285724/150‑1 (MQ=255) aGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGCCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGc < 1:2201924/150‑1 (MQ=255) gATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGgc > 1:1340291/1‑150 (MQ=255) 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cTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGtt > 2:901653/1‑150 (MQ=255) ttGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGTCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTg < 2:1631632/150‑1 (MQ=255) ttGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTg < 1:2059367/150‑1 (MQ=255) ttGGAGGCGGCATAGGCGACATATGCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCGCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTg < 2:654262/150‑1 (MQ=255) tGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTgg < 1:1063419/150‑1 (MQ=255) 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> 2:662338‑M1/1‑66 (MQ=255) aTAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCatgctctgcgccaagcacgccctgctgcgcatggcgcgccggcatggcgggcaaggc < 1:662338‑M1/123‑58 (MQ=255) aGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCa > 2:1067969/1‑77 (MQ=255) aGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCa < 1:1067969/77‑1 (MQ=255) aCATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGt > 2:534146/1‑150 (MQ=255) atTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGcc < 1:628557/150‑1 (MQ=255) atTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGcc < 2:684919/150‑1 (MQ=255) 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ttGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATg < 2:1502498/150‑1 (MQ=255) gACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTTCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGt < 1:2295718/150‑1 (MQ=255) gATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGAAAAAGGCCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGAACCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGcc > 1:1852459/1‑150 (MQ=255) gCCCCatgctctgcgccaagcacgccctgctgcgcatggcgcgccggcatggcgggcaaggcggggccatcgtcaacgtatcatcggtagccgcacgcctgggttcgcccaacgaatatgtcgactatgccgcctccaagggcgcgctcg > 1:1559526‑M1/1‑5 (MQ=255) gCCCCatgctctgcgccaagcacgccctgctgcgcatggcgcgccggcatggcgggcaaggcggggccatcgtcaacgtatcatcggtagccgcaagcctgggttcgcccaacgaatatgtcgactatgccgcctccaagggcgcgctcg > 1:341388‑M1/1‑5 (MQ=255) ccccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCa < 2:1775028/84‑1 (MQ=255) ccccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCa > 1:1775028/1‑84 (MQ=255) ccccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGAc > 1:1695308/1‑88 (MQ=255) ccccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGAc < 2:1695308/88‑1 (MQ=255) ccccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCgt > 2:450014/1‑150 (MQ=255) ccccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCgt > 2:464328/1‑150 (MQ=255) cccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCg > 1:2198994/1‑106 (MQ=255) cccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCg < 2:2198994/106‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCgtt < 1:176402/150‑1 (MQ=255) ccatgctctgcgccaagcacgccctgctgcgcatggcgcgccggcatggcgggcaaggcggggccatcgtcaacgtatcatcggtagccgcacgcctggg < 2:1974855‑M1/100‑99 (MQ=255) ccatgctctgcgccaagcacgccctgctgcgcatggcgcgccggcatggcgggcaaggcggggccatcgtcaacgtatcatcggtagccgcacgcctggg > 1:1974855‑M1/1‑2 (MQ=255) ccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCa > 2:1548315/1‑91 (MQ=255) ccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCa < 1:1548315/91‑1 (MQ=255) ccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCgttg > 2:1429058/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCgttg < 1:450014/150‑1 (MQ=255) catgctctgcgccaagcacgccctgctgcgcatggcgcgccggcatggcgggcaaggcggggccatcgtcaacgtatcatcggtagccgcacgcctgggttcgcccaacgaatatgtcgactatgccgcctccaagggcgcgctcgacac < 2:267377‑M1/150‑150 (MQ=255) cGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCgttgt > 2:1862699/1‑150 (MQ=255) | ACGCCATTGACGCGCACGCCCTCGCCTGCCACTTCTTTGGCCAGGCCGATGGTGAAGGTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGT > NC_002947/4021601‑4021898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |