| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4021749 | 69 (0.780) | 4 (0.050) | 4/234 | NT | 5.0% | coding (601/942 nt) | PP_3547 | NAD(P)‑binding oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | = 4021806 | 85 (1.010) | coding (544/942 nt) | PP_3547 | NAD(P)‑binding oxidoreductase | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCTCGTCGTCGACGCGCAGGAACAGCTGG > NC_002947/4021658‑4021951 | gtgtCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATg < 2:267377‑M2/150‑2 (MQ=255) gcCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCgacgac > 2:176402/1‑150 (MQ=255) gcCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCgacgac > 2:628557/1‑150 (MQ=255) gcCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCgacgac > 1:684919/1‑150 (MQ=255) ttGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGTCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTg < 2:1631632/150‑1 (MQ=255) ttGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTg < 1:2059367/150‑1 (MQ=255) ttGGAGGCGGCATAGGCGACATATGCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCGCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTg < 2:654262/150‑1 (MQ=255) tGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTgg < 1:1063419/150‑1 (MQ=255) gAGGCGGCATAGTCGACATATCCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTc < 1:1444698/150‑1 (MQ=255) gcggcATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTg < 1:2018032/144‑1 (MQ=255) gcggcATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTg > 2:2018032/1‑144 (MQ=255) ggcATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCAt < 2:499239/150‑1 (MQ=255) cATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGa > 1:1502498/1‑150 (MQ=255) aCATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGt > 2:534146/1‑150 (MQ=255) atTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGcc > 2:1542472/1‑150 (MQ=255) atTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGcc < 1:628557/150‑1 (MQ=255) atTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGcc < 2:684919/150‑1 (MQ=255) gTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGaa > 2:142159/1‑150 (MQ=255) 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aTGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGCGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGt > 1:263862/1‑150 (MQ=255) tctgcgccaagcacgccctgctgcgcatggcgcAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGcc < 1:2364531‑M2/82‑1 (MQ=255) tctgcgccaagcacgccctgctgcgcatggcgcAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGcc > 2:2364531‑M2/34‑115 (MQ=255) gcgcgcCATGCTCAGCAGGTCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACggg < 2:1340291/150‑1 (MQ=255) GCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACATAGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGc < 1:61791‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAg > 1:1273555‑M1/1‑134 (MQ=255) GCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAg < 2:1273555‑M1/134‑1 (MQ=255) ccaagcacgccctgctgcgcatggcgcAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCgg > 1:1231831‑M2/28‑74 (MQ=255) ccaagcacgccctgctgcgcatggcgcAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCgg < 2:1231831‑M2/47‑1 (MQ=255) tGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCt > 1:700294/1‑150 (MQ=255) gcagGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCtcgtcgt < 1:1429058/150‑1 (MQ=255) gggCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCTCGTTGTCGa < 2:602711/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGa < 2:2300598/68‑1 (MQ=255) gCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGa > 1:2300598/1‑68 (MQ=255) gCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCTCGTCGTCGAcg < 2:1862490/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCTCGTCGTCGAcg > 1:1862490/1‑150 (MQ=255) gTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCTCGTCGTCGAcgcg < 1:876692/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCTCGTCGTCGACGCGCAgg > 1:765752/1‑150 (MQ=255) gcAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGAcc > 2:150521‑M2/3‑70 (MQ=255) gcAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGAcc < 1:150521‑M2/68‑1 (MQ=255) gcAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCTCGTCGTCGACGCGCAGGAACAg > 2:1980734‑M2/3‑150 (MQ=255) cAGAGCGTGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCTCGTCGTCGACGCGCAGGAACAGc < 2:640172‑M2/149‑1 (MQ=255) agCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCTCGTCGTCGACGCGCAGGAACAGCTgg < 2:1852459/150‑1 (MQ=255) | GTGTCGAGCGCGCCCTTGGAGGCGGCATAGTCGACATATTCGTTGGGCGAACCCAGGCGTGCGGCTACCGATGATACGTTGACGATGGCCCCGCCTTGCCCGCCATGCCGGCGCGCCATGCGCAGCAGGGCGTGCTTGGCGCAGAGCATGGGGCCGACGACGTTGGTCTTCATGACGTTCAGTAGCCGGAACTCGGACATGTCCTCGACCCTGCTCTGCTGGCCGATGGTGCCGGCGTTGTTGACCAGTGCGGTGACGGGGCCGAGCTCGTCGTCGACGCGCAGGAACAGCTGG > NC_002947/4021658‑4021951 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |