New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4069837 | 119 (1.340) | 6 (0.070) | 6/232 | NT | 5.7% | coding (2366/3099 nt) | mdtB | multidrug transporter membrane protein |
? | NC_002947 | = 4069885 | 88 (1.050) | coding (2318/3099 nt) | mdtB | multidrug transporter membrane protein |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CCAGCGGCATGCCGATGTCCTTCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGC > NC_002947/4069688‑4069986 | cAGCGGCATGCCGATGTCCTTCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCcg > 1:1217538/1‑150 (MQ=255) aGCGGCATGCCGATGTCCTTCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACCGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCcgc < 1:149075/150‑1 (MQ=255) aTGCCGATGTCCTTCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAgc > 2:1138901/1‑150 (MQ=255) tGCCGATGTCCTTCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGCAATCTCGAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAgcg > 1:126655/1‑150 (MQ=255) tGCCGATGTCCTTCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAgcg > 1:168846/1‑150 (MQ=255) gCCGATGTCCTTCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAgcgc > 2:1177030/1‑150 (MQ=255) gATGTCCTTCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGa > 1:2287463/1‑150 (MQ=255) gATGTCCTTCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGa > 1:1692841/1‑150 (MQ=255) tGTCCTTCTGCACCTGCTCGAGCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGaaa < 1:439545/150‑1 (MQ=255) ttCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCacgtcaaggccaccgatggc > 1:1793161‑M1/1‑130 (MQ=255) tCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGgcgcc > 2:47818/1‑149 (MQ=255) tCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCa < 2:2228993/150‑1 (MQ=255) cACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTg > 1:258802/1‑150 (MQ=255) 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tG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTggatcgagcagcgtcaagcgcagctggctatttcccacatcggacagttcccggcggtgaccttgtcgttcaacctggcc < 1:59544‑M2/150‑81 (MQ=255) gcTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTg > 2:1578601/1‑111 (MQ=255) gcTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTg < 1:1578601/111‑1 (MQ=255) ttGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTggc < 2:109793/99‑1 (MQ=255) ttGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTggc > 1:109793/1‑99 (MQ=255) tGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATg < 2:1151546/150‑1 (MQ=255) gctgctCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCTTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTGCTGGCTGGCCCGGTTCTAGATGGTCg > 2:306784/1‑150 (MQ=255) ctgctCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCga < 1:1217484/150‑1 (MQ=255) ctgctCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCga < 1:868003/150‑1 (MQ=255) tgctCGATCCGCGCCCGAGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTggatcgagcagcgtcaagcgcagctggctatttcccacatcggccagttcccggcggtgaccttgtcgttcaacctggcccacggcgcgtcg < 2:1793161‑M2/150‑93 (MQ=255) gctCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGAAGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCgaga < 1:2308930/150‑1 (MQ=255) tCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATc > 2:1447946/1‑150 (MQ=255) cGATCCacgtcaaggccaccgatggcggccaggtgcgcctttcggcgctggcgcggatcgagcagcgtcaagcgcagctggctatttcccacctcggccagttcccggcggtgaccttgtcgttcaacctggcccacggcgcgtcgctgg < 2:205057‑M1/150‑145 (MQ=255) cGATCCacgtcaaggccaccgatggcggccaggtgcgcctttcggcgctggcgcggatcgagcagcgtcaagcgcagctggctatttcccacatcggccagttcccggcggtgaccttgtcgttcaacctggcccacggcgcgtcgctgg < 2:1258107‑M1/150‑145 (MQ=255) gATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTggatcgagcagcgtcaagcgcagctggctatttcccacatcggcca < 1:1170473‑M2/99‑47 (MQ=255) aTCCacgtcaaggccaccgatggcggccaggtgcgcctttcggcgctggcgcggatcgagcagcgtcaagcgcagctggctatttcccacatcggccagttcccggcggtgaccttgtcgttcaacctggcccacggcgcgtcgctgggc < 2:216201‑M1/150‑147 (MQ=255) ccGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCg < 1:2180673/150‑1 (MQ=255) cacgtcaaggccaccgatggcggccaggtgcgcctttcggcgctggcgcggatcgagcagcgtcaagcgcagctggctatttcccacatcggccagttcccggcggtgaccttgtcgttcaacctggcccacggcgcgtcgctgggcgaa < 2:1326028‑M1/150‑150 (MQ=255) | CCAGCGGCATGCCGATGTCCTTCTGCACCTGCTCGATCACCTGCACGGCTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTG‑CGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGC > NC_002947/4069688‑4069986 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |