| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 4069837 | 119 (1.340) | 6 (0.070) | 6/232 | NT | 5.7% | coding (2366/3099 nt) | mdtB | multidrug transporter membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 4069885 | 88 (1.050) | coding (2318/3099 nt) | mdtB | multidrug transporter membrane protein | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACAGGGCATTGGTGATCTGCGAGACGCT > NC_002947/4069736‑4070030 | cTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGGCGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGt < 1:1850213/150‑1 (MQ=255)cTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGt > 2:868003/1‑150 (MQ=255)cTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGt < 2:502902/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTg < 2:1326028‑M2/150‑2 (MQ=255) gCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTggat < 2:216201‑M2/150‑5 (MQ=255) gCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCCCCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAACGCCCACCTGGCCGCCACCGGTCGCCTTGACGTggat < 2:950572‑M2/150‑5 (MQ=255) cccAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTggatc > 1:1148608‑M2/1‑145 (MQ=255) ccAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTggatcg < 2:1258107‑M2/150‑7 (MQ=255) ccAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGAGGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTggatcg < 2:205057‑M2/150‑7 (MQ=255) aGCCACCCGCCGTGGGCCGGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCCGGAACGCGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCCATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTTGCCTTGACGTGGATCGAc < 2:951505/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCa < 2:1496890/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCa > 1:2027596/1‑150 (MQ=255) gcgcCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAgc > 2:1755726/1‑150 (MQ=255) gcgcCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAgc < 2:2299601/150‑1 (MQ=255) ccGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGcc > 2:177750/1‑150 (MQ=255) ccGTGGGCCAGGTTGAACGAAAAGGTCACCGGCGGGAACAGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCGTGACGCTGCTGGAGCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCCGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGcc < 2:1063804/150‑1 (MQ=255) tGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGc < 2:1458304/150‑1 (MQ=255) gTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGAt > 1:538509/1‑150 (MQ=255) 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cgccATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACAGGGCATTgg < 1:1447946/150‑1 (MQ=255) gccATCGGTGGCCTTGACGTggatcgagcagcgtcaagcgcagctggctatttcccacatcggccagttcccggcggtgaccttgtcgttcaacctggcccacggcgcgtcgctgggcgaagccgtgcaggtgatcgagcaggtgcagaa > 1:1793161‑M2/1‑20 (MQ=255) gccAGCGGTGGCCTGGACGTGGATCGACGCCGGCGCCGGCGGGGCGATCGTGGCGGCGTCACGGGACTGCGACACCACGCGGTACGGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACGGGGCATTGGt < 2:671385/150‑1 (MQ=255) ccATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGCGTAGATGGt < 2:2285060/107‑1 (MQ=255) ccATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGCGTAGATGGt > 1:2285060/1‑107 (MQ=255) cATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAg > 2:258213/1‑128 (MQ=255) cATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAg < 1:258213/128‑1 (MQ=255) cATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACAGGGCATTGGTGa > 2:624510/1‑150 (MQ=255) cATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACAGGGCATTGGTGa < 1:624510/150‑1 (MQ=255) cATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACAGGGCATTGGTGa > 1:1653640/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACAGGGCATTGGTGATCTGCg > 2:2352344/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGACGTGGATCGACTCAAGCGCATGCGGCACGAGCGTTGCGGCTTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACAGGGCATTGGTGATCTGCga < 1:539411/150‑1 (MQ=255) gCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACAGGGCATTGGTGATCTGCgag > 2:1550965/1‑150 (MQ=255) gACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACAGGGCATTGGTGATCTGCGAGACGCt < 1:489904/150‑1 (MQ=255) gTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTActggctg < 1:781446/73‑1 (MQ=255) | CTTCGCCCAGCGACGCGCCGTGGGCCAGGTTGAACGACAAGGTCACCGCCGGGAACTGGCCGATGTGGGAAATAGCCAGCTGCGCTTGACGCTGCTCGATCCGCGCCAGCGCCGAAAGGCGCACCTGGCCGCCATCGGTGGCCTTGACGTGGATCGACTCCAGCGCCTGCGGGCCGATCGTGGCGGCGTCACTGGACTGCAACACCACGCGGTACTGGCTGGCCTGGGTGTAGATGGTCGAGATCTGCCGCTGGCCGAAGGCGTCGTACAGGGCATTGGTGATCTGCGAGACGCT > NC_002947/4069736‑4070030 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |