| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 4139817 | 92 (1.040) | 5 (0.060) | 4/236 | NT | 5.2% | coding (706/1041 nt) | PP_3644 | monooxygenase subunit |
| ? | NC_002947 | = 4139831 | 93 (1.100) | coding (720/1041 nt) | PP_3644 | monooxygenase subunit | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GCAATGTCATGGTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGATCTCGCGCTTCTACCGCACCTTCGATGCCTGGTTCGGCAACAAGACGACCCCGGTGAATGGCTTCCTGGAGCCGAGCCCGGAGTCGAAGTTCGCCGAAGTGCCGGCGTTC > NC_002947/4139677‑4139966 | gCAATGTCATGGTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGAcc > 1:763602/1‑150 (MQ=255) tGTCATGGTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGa > 1:1257052/1‑150 (MQ=255) gTCATGGTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGaa < 2:850684/150‑1 (MQ=255) gTCATGGTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGaa < 2:1329725/150‑1 (MQ=255) tCATGGTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCGGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAg < 2:1347880‑M2/150‑2 (MQ=255) tGGTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCttccgggtcggacgggct < 1:2384789‑M1/150‑19 (MQ=255) gTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGAccc < 1:1523182/140‑1 (MQ=255) gTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGAccc < 1:1522639/140‑1 (MQ=255) gTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGAccc > 2:1523182/1‑140 (MQ=255) gTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGAccc > 2:1522639/1‑140 (MQ=255) cccGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGt > 1:1272589/1‑150 (MQ=255) cTGATGAAGGGGGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGt < 2:2047451/150‑1 (MQ=255) gaAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCa > 1:1408034/1‑150 (MQ=255) gaagaaGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCGACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGACTGGCAGGTCGGTGCCCAGGCGCTCTcg > 2:1782106/1‑150 (MQ=255) gaagaaGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTTGAAGGTCGGTg > 1:539213/1‑136 (MQ=255) gaagaaGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTg < 2:539213/136‑1 (MQ=255) gaagaaGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAg > 1:916751/1‑141 (MQ=255) gaagaaGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGa < 1:1060474/145‑1 (MQ=255) gaagaaGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGa > 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(MQ=255) ccACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGATCTCGCGCTTCTACCGCACCTTCGATGCCTGGTTCGGCAACAAGACGACCCCGGTGAATgg > 1:1340156/1‑114 (MQ=255) acaGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGATCTCGCGCTTCTACCGCACCTTCGATGCCTGGTTCGGCAACAAGACGACCCCGGTGAATGGCTTCCTGGAGCCGAGCCCGGAGTCGAAGTTCGCCGAAGTGCCgg > 2:299421/1‑150 (MQ=255) acaGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGATCTCGCGCTTCTACCGCACCTTCGATGCCTGGTTCGGCAACAAGACGACCCCGGTGAATGGCTTCCTGGAGCCGAGCCCGGAGTCGAAGTTCGCCGAAGTGCCgg > 2:1953483/1‑150 (MQ=255) aGCCttccgggtcggacgggctgtgcacgtgggtgtggcgcagcaccatcagttgcgggcgcggcacgtccgggttgttgtccagggcggcctggaacttgttcttcaggtccagcacttcttcgtcacccttcatcagcggggtgacca > 1:204612‑M1/1‑4 (MQ=255) aGCCCGTCCGACCCGGAAggctgtgcacgtgggtgtgtcgcagcaccatcagttgcgggcgcggcacgtccgggtt < 1:1398248‑M2/76‑59 (MQ=255) aGCCCGTCCGACCCGGAAggctgtgcacgtgggtgtggcgcagcaccatcagttgcgggcgcggcacgtccgggttgttgtccagggcggcctggaacttgttcttcaggtccagcacttcttcgtcacccttcatcagcggggtgacca < 1:2384789‑M2/150‑133 (MQ=255) aGCCCGTCCGACCCGGAAggctgtgcacgtgggtgtggcgcagcaccatcagttgcgggcgcggcacgtccgggtt > 2:1398248‑M2/1‑18 (MQ=255) cccGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGATCTCGCGCTTCTACCGCACCtt > 2:2373135/1‑63 (MQ=255) cccGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGATCTCGCGCTTCTACCGCACCtt < 1:2373135/63‑1 (MQ=255) cttccgggtcggacgggctgtgcacgtgggtgtggcgcagcaccatcagttgcgggcgcggcacgtccgggttgttgtccagggcggcccggaacttgttcttcaggtccagcacttcttcgtcacccttcatcagcggggtgaccatga < 2:1347880‑M1/150‑150 (MQ=255) ccGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGATCTCGCGCTTCTACCGCACCTTCGATGCCt < 1:1852539/70‑1 (MQ=255) ccGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGATCTCGCGCTTCTACCGCACCTTCGATGCCt > 2:1852539/1‑70 (MQ=255) | GCAATGTCATGGTCACCCCGCTGATGAAGGGTGACGAAGAAGTGCTGGACCTGAAGAACAAGTTCCAGGCCGCCCTGGACAACAACCCGGACGTGCCGCGCCCGCAACTGATGGTGCTGCGCCACACCCACGTGCACAGCCCGTCCGACCCGGAAGGCTGGAAGGTCGGTGCCCAGGCGATCTCGCGCTTCTACCGCACCTTCGATGCCTGGTTCGGCAACAAGACGACCCCGGTGAATGGCTTCCTGGAGCCGAGCCCGGAGTCGAAGTTCGCCGAAGTGCCGGCGTTC > NC_002947/4139677‑4139966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |