New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 4296963 | 66 (0.760) | intergenic (+86/‑12) | gloA/PP_3767 | lactoylglutathione lyase/hypothetical protein |
TTCCAGAAACGCCTGCAGGACGGCCGCATGAACCACCTGGCCTTCGTCAAGGACCCGGACGGTTATTGGGTCGAAGTGATCCAGCCAACCGAGCTCGAAGGCTAAGCGTTCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATGCAATCTCTTCACTGTGAATACCGCGAGCACACCATCACTGCCAGCGTGATGCCCCATCCCGACTCACCCCTGCCCTATGCCGCCGGCTGCCTGA > NC_002947/4296773‑4297071 | ttCCAGAAACGCCTGCAGGACGGCCGCATGAACCACCTGGCCTTCGTCAAGGACCCGGACGGTTATTGGGTCGAAGTGATCCAGCCAACCGAGCTCGAAGGCTAAGCGTTCGTCGCGGCGCCCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCT < 1:1772090‑M1/150‑1 (MQ=255) aGAAACGCCTGCAGGACGGCCGCATGAACCACCTGGCCTTCGTCAAGGACCCGGACGGTTATTGGGTCGAAGTGATCCAGCCAACCGAGCTCGAAGGCTAAGCGTTCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCt > 2:2212468/1‑150 (MQ=255) gAAACGCCTGCAGGACGGCCGCATGAACCACCTGGCCTTCGTCAAGGACCCGGACGGTTATTGGGTCGAAGTGATCCAGCCAACCGAGCTCGAAGGCTAAGCGTTCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCtg > 2:2220530/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTGCAGGACGGCCGCATGAACCACCTGGCCTTCGTCAAGGACCCGGACGGTTATTGGGTCGAAGTGATCCAGCCAACCGAGCTCGAAGGCTAAGCGTTCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCtgtg < 2:720372/150‑1 (MQ=255) gCCTGCAGGACGGCCGCATGAACCACCTGGCCTTCGTCAAGGACCCGGACGGTTATTGGGTCGAAGTGATCCAGCCAACCGAGCTCGAAGGCTAAGCGTTCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCtt > 1:2002815/1‑141 (MQ=255) gCCTGCAGGACGGCCGCATGAACCACCTGGCCTTCGTCAAGGACCCGGACGGTTATTGGGTCGAAGTGATCCAGCCAACCGAGCTCGAAGGCTAAGCGTTCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCtt < 2:2002815/141‑1 (MQ=255) ccTGCAGGACGGCCGCATGAACCACCTGGCCTTCGTCAAGGACCCGGACGGTTATTGGGTCGAAGTGATCCAGCCAACCGAGCTCGAAGGCTAAGCGTTCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCtgtg < 1:1321139/146‑1 (MQ=255) ccTGCAGGACGGCCGCATGAACCACCTGGCCTTCGTCAAGGACCCGGACGGTTATTGGGTCGAAGTGATCCAGCCAACCGAGCTCGAAGGCTAAGCGTTCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCtgtg > 2:1321139/1‑146 (MQ=255) 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ttCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATGCAAt < 1:81377/101‑1 (MQ=255) ttCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATGCAAt > 2:81377/1‑101 (MQ=255) ttCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATGCAATCTCTTCACTGTGAATACcgc > 2:1870651/1‑121 (MQ=255) ttCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGATTCACAGACCACAGCGAGGTAAGGACGATGCAATCTCTTCACTGTGAATACcgc < 1:1870651/121‑1 (MQ=255) ggcgCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATg < 1:1545858/89‑1 (MQ=255) ggcgCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATg > 2:1545858/1‑89 (MQ=255) cgcgcTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATGCAATCTCTTCACTGTGAATACCGCGAGCACACCATCACTGCCAGCGTGATGCCCCATCCCGAc < 1:2174024/150‑1 (MQ=255) 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2:221142‑M2/1‑50 (MQ=255) ccTCTTGCTGTGGTATATGATG‑‑GCAACTGGTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGAGGATGCAATCTCTTCAATGTGAATACCGCGAGCACCCCATCACTGCCGGCGTGATGCCCCATCCCGACTCACCCCTGCCCTATGCCGCCGGCTGc < 2:496938/150‑1 (MQ=255) ctctTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGagaggccgggagttcccggcctgacgagcgcgccgcgacgaacgcttagccttcgagctcggttggctggatcacttcga < 2:244577‑M2/125‑81 (MQ=255) ctctTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGagaggccgggagttcccggcctgacgagcgcgccgcgacgaacgcttagccttcgagctcggttggctggatcacttcga > 1:244577‑M2/1‑45 (MQ=255) ctctTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATGCAATCTCTTCACTGTGAATACCGCGAGCACACCATCACTGCCAGCGTGATGCCCCATCCCGACTCACCCCTGCCCTATGCCGCCGGCTGcc < 1:1403049/150‑1 (MQ=255) tctTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATGCAATCTCTTCACTGTGAATACCGCGAGCACACCATCACTGCCAGCGTGATGCCCCATCCCGACTCACCCCTGCCCTATGCCGCCGGCTGCCt < 2:1548846/150‑1 (MQ=255) ctcgctgtggtatgtgaagcagttaccttcatataccacagcaagaggccgggagttcccggcctgacgagcgcgccgcgacgaacgcttagccttcgagctcggttgcacgcgggggttcgacccaataaccgtccgggtccttgacga > 1:737435‑M1/1‑2 (MQ=255) ctcgctgtggtatgtgaagcagttaccttcatataccacagcaagaggccggaaagtacgtgcctgacgagcgcgccgcgacgaacgcttagccttcgagctcggttggctggatcacttcgacccaataaccgtccgggtccttgacga > 2:2020066‑M1/1‑2 (MQ=255) ttGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATGCAATCTCTTCACTGTGAATACCGCGAGCACACCATCACTGCCAGCGTGATGCCCCATCCCGACTCACCCCTGCCCTATGCCGCCGGCTGCCTGa > 1:2118096/1‑150 (MQ=255) tcgctgtggtatgtgaagcagttaccttcatataccacagcaagaggccgggagttcccggcctgacgagcgcgccgcgacgaacgcttagccttcgagctcggttggctggatcacttcgacccaataaccgtccgggtccttgacgaa < 1:1648485‑M1/150‑150 (MQ=255) tcgctgtggtatgtgaagcagttaccttcatataccacagcaagaggccgggagttcccggcctgacgagcgcgccgcgacgaacgcttagccttcgagctcggttggctggatcacttcgaccc > 2:1159406‑M1/1‑1 (MQ=255) tcgctgtggtatgtgaagcagttaccttcatataccacagcaagaggccgggagttcccggcctgacgagcgcgccgcgacgaacgcttagccttcgagctcggttggctggatcacttcgaccc < 1:1159406‑M1/125‑125 (MQ=255) | TTCCAGAAACGCCTGCAGGACGGCCGCATGAACCACCTGGCCTTCGTCAAGGACCCGGACGGTTATTGGGTCGAAGTGATCCAGCCAACCGAGCTCGAAGGCTAAGCGTTCGTCGCGGCGCGCTCGTCAGGCCGGGAACTCCCGGCCTCTTGCTGTGGTATATGAAG‑‑GTAACTGCTTCACATACCACAGCGAGGTAAGGACGATGCAATCTCTTCACTGTGAATACCGCGAGCACACCATCACTGCCAGCGTGATGCCCCATCCCGACTCACCCCTGCCCTATGCCGCCGGCTGCCTGA > NC_002947/4296773‑4297071 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |