| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 4330902 = | 99 (1.120) | 5 (0.060) | 5/232 | NT | 5.0% | coding (304/747 nt) | PP_3802 | cation ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 4330967 = | 96 (1.150) | coding (369/747 nt) | PP_3802 | cation ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GCAAGAGCTCGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGC > NC_002947/4330753‑4331048 | gtaaGAGCTCGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTTCCCATGACCGTGGACGATCTCa > 2:1110426/3‑150 (MQ=255) ggccgacatcggttcgtccagcaccagcaactgcggctcggggatcaggccctgggccagcagcacgcgctggcgctcaccgccggacagtgcccccattcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaAt > 2:1280960‑M1/149‑150 (MQ=255) aaGAGCTCGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATg > 1:666838/1‑150 (MQ=255) ccgacatcggttcgtccagcaccagcaactgcggctcggggatcaggccctgggccagcagcacgcgctggcgctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATgg > 2:1620679‑M1/147‑150 (MQ=255) gagCTCGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGgc > 2:54039/1‑150 (MQ=255) gacatcggttcgtccagcaccagcaactgcggctcggggatcaggccctgggccagcagcacgcgctggcgctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGgcc < 1:2263487‑M1/6‑1 (MQ=255) gacatcggttcgtccagcaccagcaactgcggctcggggatcaggccctgggccagcagcacgcgctggcgctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGgcc < 2:403720‑M1/6‑1 (MQ=255) agCTCGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGgcc > 2:204120/1‑150 (MQ=255) cGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCa < 1:178843/150‑1 (MQ=255) gTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCAt > 2:2263487/1‑150 (MQ=255) gTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCAt > 2:483971/1‑150 (MQ=255) gTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCAt < 1:1463633/150‑1 (MQ=255) gTTGATAAAGACCCTGCTCGGGCAGAAGCCACACCAGGGACAGCTGACACTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCGGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCAt < 2:442636/150‑1 (MQ=255) aTCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGTCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGc > 2:543532/1‑150 (MQ=255) aaGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATAGCCGCCATGTGCCAg < 1:695183/150‑1 (MQ=255) aGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTCGCCGGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAgc < 1:1351820/150‑1 (MQ=255) aCCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCATGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGTCCTGCCCATGACCGTTGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAgcgc > 2:756841/1‑150 (MQ=255) gtgccgggggCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCACCATGTGCCAGcgccg > 1:83971/8‑150 (MQ=255) 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ctgggccagcagcacgcgctggcgctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGgc < 1:922697‑M1/5‑1 (MQ=255) ctgggccagcagcacgcgctggcgctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGgc > 2:922697‑M1/98‑102 (MQ=255) gACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGaa < 1:483971/150‑1 (MQ=255) gACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGaa < 1:1477202/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAg > 2:1519490/1‑150 (MQ=255) ccagcagcacgcgctggcgctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGc > 2:860157‑M1/93‑150 (MQ=255) 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aCTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTgg > 1:1914244/1‑132 (MQ=255) aGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACgcggc < 1:114311/150‑1 (MQ=255) aGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATCTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACgcggc < 1:2111696/150‑1 (MQ=255) ttCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGgcgc > 1:1617801/1‑150 (MQ=255) gACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGa < 1:929290/131‑1 (MQ=255) gACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGgcgc < 2:1803370/147‑1 (MQ=255) gACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGgcgc > 1:1803370/1‑147 (MQ=255) gACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATg > 1:2152225/1‑150 (MQ=255) aCCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGc > 1:1014704/1‑122 (MQ=255) aCCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATgg > 2:1752008/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGCCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATggg < 1:2102290/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCa < 1:2274026/150‑1 (MQ=255) cTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATgggg > 1:1188450/1‑144 (MQ=255) cccATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTcc < 1:1110426/150‑1 (MQ=255) ccATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCcg > 1:2287321/1‑150 (MQ=255) ccATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCcg > 1:924866/1‑150 (MQ=255) aCCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTg < 2:2220362/57‑1 (MQ=255) gACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCAT‑GGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGcc > 2:1400654/1‑150 (MQ=255) ttCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAtcgc > 2:1943601/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGgcgc > 2:682650/1‑52 (MQ=255) cATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGgcgc < 1:682650/52‑1 (MQ=255) | GCAAGAGCTCGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGC > NC_002947/4330753‑4331048 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |