New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4330902 = | 99 (1.120) | 5 (0.060) | 5/232 | NT | 5.0% | coding (304/747 nt) | PP_3802 | cation ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 4330967 = | 96 (1.150) | coding (369/747 nt) | PP_3802 | cation ABC transporter ATP‑binding protein |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGATGTCGGCC > NC_002947/4330820‑4331114 | gCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑Ga > 2:1224508/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑Ga > 1:1500811/1‑150 (MQ=255) gTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAg > 2:1607398/1‑150 (MQ=255) gcgAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACTGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTgg < 1:926428/150‑1 (MQ=255) gAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGtt > 2:444385/1‑150 (MQ=255) gTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGCGTTCGACCGCGGCCTGCCCATCACCGTGGACGATTTCATGGCCCCCATGTGCCAGCGTCACCCGGGCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GTTGCAGCCTTGGTTCAg < 1:508504/150‑1 (MQ=255) tGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAgg < 2:1952114/150‑1 (MQ=255) aTTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGtt > 1:2365099/1‑150 (MQ=255) acagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAgg < 1:899905‑M1/85‑1 (MQ=255) acagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAgg > 2:899905‑M1/63‑147 (MQ=255) tGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGAAGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTgg > 2:1465804/1‑150 (MQ=255) gCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGc < 1:2346576/149‑1 (MQ=255) gCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGc > 2:2346576/1‑149 (MQ=255) gCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCa > 1:1248588/1‑150 (MQ=255) cTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑A‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCAt > 2:560950/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTg > 1:1490975/1‑132 (MQ=255) gTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTg < 2:1490975/132‑1 (MQ=255) ccGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGAc > 2:2274026/1‑150 (MQ=255) 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cACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGTCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGc > 1:1163067/1‑115 (MQ=255) cACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGc < 2:1163067/115‑1 (MQ=255) aCTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTgg > 1:1914244/1‑132 (MQ=255) aCTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTgg < 2:1914244/132‑1 (MQ=255) aGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACgcggc < 1:114311/150‑1 (MQ=255) aGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATCTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACgcggc < 1:2111696/150‑1 (MQ=255) ttCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGgcgc > 1:1617801/1‑150 (MQ=255) gACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGa < 1:929290/131‑1 (MQ=255) gACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGgcgc < 2:1803370/147‑1 (MQ=255) gACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGgcgc > 1:1803370/1‑147 (MQ=255) gACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATg > 1:2152225/1‑150 (MQ=255) aCCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGc > 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ccGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATcccc > 2:244142/1‑150 (MQ=255) cGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCg > 1:1051560/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAg > 2:1802924/1‑150 (MQ=255) ccTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑Ga > 1:1413635/1‑40 (MQ=255) ccTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑Ga < 2:1413635/40‑1 (MQ=255) cTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTg < 1:356014/97‑1 (MQ=255) tCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGc < 1:245098/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCa > 1:911229/1‑150 (MQ=255) tCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGTCCTGATCCCCGAGCCGCAGt > 2:730170/1‑150 (MQ=255) tCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGt > 2:1849504/1‑150 (MQ=255) cTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCACCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTtgctg < 1:1465804/150‑1 (MQ=255) cTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGAAGCGCGAACACGGTGCGCTGGGCCATTGCGCTGCGGTGTTCTTCATCGCGTTCTTCGGGCCCGGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTtgctg < 2:2080203/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCGCGTGAAGCCGGTCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTtgctggtg > 2:1621793/1‑150 (MQ=255) gcggcgCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTtgctggtgct > 2:2119489/1‑150 (MQ=255) cggcgCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTtgctggtgctg < 2:2312432/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGa < 1:1224508/150‑1 (MQ=255) ctggcacatggcggccatT‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGa < 2:1831460‑M2/132‑1 (MQ=255) cgTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGa < 2:1051560/150‑1 (MQ=255) gTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGaa > 2:465786/1‑150 (MQ=255) tGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAAc < 2:546308/150‑1 (MQ=255) tGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAAc > 1:2327137/1‑150 (MQ=255) gcaggccatT‑GATGAAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGAt > 2:2329401‑M2/10‑150 (MQ=255) ggccatT‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGATGTc < 1:2263487‑M2/144‑1 (MQ=255) ggccatT‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGATGTc < 2:403720‑M2/144‑1 (MQ=255) gccatT‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAg > 2:922697‑M2/6‑102 (MQ=255) ccatT‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGATGTCgg > 2:1620679‑M2/5‑150 (MQ=255) atT‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGAATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGATGTCGGcc > 2:1280960‑M2/3‑150 (MQ=255) | GCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAT‑T‑GATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGATGTCGGCC > NC_002947/4330820‑4331114 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |