New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4577844 = | 106 (1.200) | 15 (0.180) | 12/236 | NT | 13.3% | intergenic (+9/+100) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
? | NC_002947 | 4577929 = | 94 (1.110) | intergenic (+94/+15) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
ACAGTGGAGTTGGGATTGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCA > NC_002947/4577695‑4577993 | ccgagctgtatgccgggtcgaatgtcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactg < 1:1303707‑M1/1‑1 (MQ=255) aGTGGAGTTGGGATTGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGggccggc < 1:549297/150‑1 (MQ=255) gTGGAGTTGGGATTGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGggccggcc > 1:793150/1‑150 (MQ=255) ttGGGATTGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTcg > 1:1900536/1‑150 (MQ=255) tGGGATTGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTcgc < 2:875094/150‑1 (MQ=255) tGGGATTGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑CTcgt < 2:1900536/150‑2 (MQ=255) ggCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAAcc > 2:1704448/1‑150 (MQ=255) ggCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAAcc > 2:134321/1‑150 (MQ=255) atgtcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCg < 2:1512229‑M1/22‑1 (MQ=255) gtggCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGTTc < 1:15153/150‑1 (MQ=255) gtggCGAGAGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGCTGGAGATGGCAATGAGCTGGACAAATTGATTGGCAGCCTTCGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:2349277/150‑1 (MQ=255) atctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtaccGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacac < 2:549752‑M1/31‑1 (MQ=255) aCGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAAc < 2:48173/132‑1 (MQ=255) aCGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAAc > 1:48173/1‑132 (MQ=255) gCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGACAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACACGGGTCAcc > 1:396174/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGAAAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCaga > 1:60987/1‑148 (MQ=255) cTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAccgc > 1:1490213/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCATTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCgg < 2:535381/150‑1 (MQ=255) gTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggt < 2:827247/150‑1 (MQ=255) cagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtg < 2:324651‑M1/47‑1 (MQ=255) ggCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTGGGAGCGTGCCTACACGGGTCACCGCCGggtgc > 1:1811664/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgc < 2:2214605/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgc < 2:2345002/150‑1 (MQ=255) gttgttCGTCAGCGCCGCTTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGTCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgcggt < 2:401940/150‑1 (MQ=255) ttgttCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgcggt < 2:209143/149‑1 (MQ=255) ttCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCt > 1:448697/1‑150 (MQ=255) tCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTg < 1:134321/150‑1 (MQ=255) gTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCCTGGGGTGCGGATGCGGAGCGGAGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCg > 1:1957085/1‑150 (MQ=39) gccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttgggtgtactGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTa > 1:324651‑M1/91‑150 (MQ=255) ccGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAAc < 1:1704448/150‑1 (MQ=255) cacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcagaaggctgtactGGCCCT‑CGCGCGG‑TAGACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACgg > 1:295373‑M1/85‑150 (MQ=255) cGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGGCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTa > 2:396846/1‑144 (MQ=255) gATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACgg < 1:1566791/150‑1 (MQ=255) gATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACgg < 2:77772/150‑1 (MQ=255) gATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACgg < 2:2018961/150‑1 (MQ=255) aTTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACggg < 2:1638169/150‑1 (MQ=255) ttACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGACAGGGCTGAGTTGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGt < 2:2371987/150‑1 (MQ=255) ttACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAccgccg > 2:924311/1‑124 (MQ=255) ttACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAccgccg < 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ccTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCaa < 2:1235566/129‑1 (MQ=255) tcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCa > 1:107329‑M1/33‑118 (MQ=255) gggTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAac < 2:1957085/150‑1 (MQ=255) ggTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACgg > 2:213649/1‑94 (MQ=255) ggTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACgg < 1:213649/94‑1 (MQ=255) gTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAacac < 1:1455089/150‑1 (MQ=255) gTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAacac > 2:1428360/1‑150 (MQ=255) aTGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCaa < 1:1583424/150‑1 (MQ=255) aTGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCaa > 2:1104192/1‑150 (MQ=255) ggtggtAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGaaa > 2:1355004/1‑96 (MQ=255) ggtggtAGGCAGGGCCCGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGaaa < 1:1355004/96‑1 (MQ=255) tAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAg < 2:172808/150‑1 (MQ=255) tAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGAGCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAg < 2:1391199/150‑1 (MQ=255) aGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAgg > 2:2194294/1‑150 (MQ=255) aGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCACCAAATGCTGCAgg > 2:1978471/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGtt > 2:465542/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGAt > 2:1564873/1‑108 (MQ=255) cAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGAt < 1:1564873/108‑1 (MQ=255) ggccggccCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAgg < 2:448697/150‑1 (MQ=255) GGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCa < 2:390019‑M1/150‑1 (MQ=255) | ACAGTGGAGTTGGGATTGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCA > NC_002947/4577695‑4577993 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |