New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 4588104 | 84 (1.070) | intergenic (‑244/‑78) | PP_4063/ivd | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase/isovaleryl‑CoA dehydrogenase |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CTGAAGCAAGCGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGGGCGGGGCCGGATCCCAAGCTATGGTGTAACCCAATTTCAAGAACAAGAAGGTGCCCCAGCATGCATTACC > NC_002947/4587894‑4588191 | cTGAAGCAAGCGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGC < 2:684934‑M1/150‑1 (MQ=255) gAAGCAAGCGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCtt < 2:2073034/150‑1 (MQ=255) agcaagcGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGc < 2:688558/150‑1 (MQ=255) 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tACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGa > 1:107565/1‑150 (MQ=255) tACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGa < 1:1323434/150‑1 (MQ=255) tctGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTATGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGTGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGAcc < 2:1410717/149‑1 (MQ=255) tctGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGTGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGAcc > 1:1410717/1‑149 (MQ=255) gcAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGC < 1:1742457‑M1/125‑1 (MQ=255) 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< 2:91898‑M1/150‑52 (MQ=255) gAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTCCATTACCGTACAGCCGATGAACGAGACCCGCTTTAGGCTCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTAtt > 1:658239/1‑150 (MQ=255) tGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGAGCCATCAGGTAGTTAGGGTGGCCTGCCTGACGTGTTcgc > 2:21353/1‑150 (MQ=255) tGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTcgc < 1:436350/150‑1 (MQ=255) taTTGACGGTGACCCTCATTCAGTTTTACGTTAACGTAAAGGTTATGAAGGACACGCACTTGAGGCGCCACGCGGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTTCTGACGTATTcgctg < 2:119909/149‑3 (MQ=255) gATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAt < 1:2109899/105‑1 (MQ=255) gATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAt > 2:2109899/1‑105 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1:514501‑M2/1‑72 (MQ=255) tgGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGGGCGGGGCCGGATCCCAAGCTATGGTGTAACCCAAt < 1:1227939/124‑1 (MQ=255) gcgagCGGGCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattaccggattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacaga > 2:1901181‑M1/3‑10 (MQ=255) ggAGCGGGCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttagcgtagtcctgcatgagg < 2:2153860‑M1/150‑142 (MQ=255) ggAGCGGGCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagg < 2:1150446‑M1/150‑142 (MQ=255) ggAGCGGGCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagg < 1:1199618‑M1/150‑142 (MQ=255) ggAGCGGGCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagg < 1:1371736‑M1/150‑142 (MQ=255) tctgggcttGCCCGCGAATGCGACCAATCAAGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTCGCGGGCATgcccgctcccacagagggcggcgtggcgaatcaagtgggtgtcgttcatcgccgtgacgttaacgtaaacctgcatgagggt > 1:1507298‑M2/4‑68 (MQ=255) gggCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaa < 1:94627‑M1/99‑96 (MQ=255) ggCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTCGCGGGCATgcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagggtcaga < 2:1507298‑M2/150‑87 (MQ=255) ggCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGGGCGGGGCCGGATCCCAAGCTATGGTGGAACCCAATTTCAAGAACAAGAAGTTGCCCCAGCATGCATTAc > 1:1328082/1‑150 (MQ=255) ggCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCATGCTGACGTATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGGGCGGGGCCGGATCCCAAGCTATGGTGTAACCCAATTTCAAGAACAAGAAGGTGCCCCAGCATGCATTAc < 2:847813/150‑1 (MQ=255) gCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagggtcactg > 1:309809‑M1/1‑2 (MQ=255) | CTGAAGCAAGCGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGGGCGGGGCCGGATCCCAAGCTATGGTGTAACCCAATTTCAAGAACAAGAAGGTGCCCCAGCATGCATTACC > NC_002947/4587894‑4588191 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |