| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4731520 = | 126 (1.420) | 7 (0.080) | 7/242 | NT | 5.8% | intergenic (‑31/+63) | lpdG/sucB | dihydrolipoyl dehydrogenase/2‑oxoglutarate dehydrogenase dihydrolipoyltranssuccinylase subunit |
| ? | NC_002947 | 4731576 = | 103 (1.180) | intergenic (‑87/+7) | lpdG/sucB | dihydrolipoyl dehydrogenase/2‑oxoglutarate dehydrogenase dihydrolipoyltranssuccinylase subunit | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
TCGGTGTACTTCTCGATACAGGCAGTCTTCAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAG > NC_002947/4731377‑4731669 | tCGGTGTACTTCTCGATACAGGCAGTCTTCAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATGAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGa > 1:1741895/1‑150 (MQ=255) aCTTCTCGATACAGGCAGTCTTCAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACcgcgc > 2:564307/1‑150 (MQ=255) gATACAGGCAGTCTTCAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTgg > 2:487184/1‑150 (MQ=255) aTACAGGCAGTCTTCAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGc > 2:128350/1‑150 (MQ=255) aGGCAGTCTTCAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGcttct > 1:2329219/1‑150 (MQ=255) ggCAGTCTTCAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGcttctt > 2:550286/1‑150 (MQ=255) gCAGTCTTCAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTg > 2:1162865/1‑150 (MQ=255) cAGTCTTCAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGc < 2:930958/150‑1 (MQ=255) cAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCa < 1:128350/150‑1 (MQ=255) gACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTATAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAgg < 1:2293004/150‑1 (MQ=255) gACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAgg < 2:1674130/150‑1 (MQ=255) cAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTg > 1:1367683/1‑137 (MQ=255) cAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTg < 2:1367683/137‑1 (MQ=255) cAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGccc > 2:2136760/1‑150 (MQ=255) cAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGccc > 2:313706/1‑150 (MQ=255) cAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTa > 1:2207423/1‑150 (MQ=255) aTGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTg > 2:1303064/1‑120 (MQ=255) aTGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTg < 1:1303064/120‑1 (MQ=255) aGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGcttc > 2:193213/1‑112 (MQ=255) aGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGcttc > 2:193615/1‑112 (MQ=255) aGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGcttc < 1:193213/112‑1 (MQ=255) aGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGcttc < 1:193615/112‑1 (MQ=255) aGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCa < 1:811150/123‑1 (MQ=255) aGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCa > 2:811150/1‑123 (MQ=255) aGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAggg > 2:1180274/1‑150 (MQ=255) ccACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGtt < 2:2015455/150‑1 (MQ=255) gcaaggaagcggtaaccttcctggtaactatcaagaacctgctggaagatccgtcccgcctgctgctggacatctaaccccctgGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTa > 1:1839176‑M1/85‑150 (MQ=255) cacaTAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAGGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTa > 1:1345791/1‑150 (MQ=255) caaggaagcggtaaccttcctggtcactatcaagaacctgctggaagatccgtcccgcctgctgctggacatctaaccctctgGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAg > 1:1570731‑M1/84‑150 (MQ=255) acaTAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGATAGGCGCAGAGCAGTTGGCAGCCAAGCGGCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTGAg > 1:285930/1‑150 (MQ=255) tAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATg < 2:2036384/150‑1 (MQ=255) tAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATg < 1:1696141/150‑1 (MQ=255) aGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGTACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGt < 1:2365048/150‑1 (MQ=255) aGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACTCa < 1:2406088/133‑1 (MQ=255) aGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCa > 2:2406088/1‑133 (MQ=255) gccgccTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATGAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTc < 2:1741895/150‑1 (MQ=255) gccTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCcag < 1:487184/150‑1 (MQ=255) gggCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCcagcagc < 1:134121/150‑1 (MQ=255) ccTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGcc < 1:1612116/103‑1 (MQ=255) aCCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGa > 1:506860/1‑150 (MQ=255) gATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACgg > 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cTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTc > 1:912605/1‑117 (MQ=255) cTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTc < 2:912605/117‑1 (MQ=255) cTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTAc < 1:860219/150‑1 (MQ=255) ttATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGCAGCCAGGCCCGGCACGGTAGGCAGCCAGAGGGTTACATGTCCAGCAGCAGGAGGGACGGATGTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGtagat > 1:22850/1‑146 (MQ=255) ttATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTAcc < 1:313706/150‑1 (MQ=255) ttATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTAcc > 1:319677/1‑150 (MQ=255) aTCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGc < 1:2398087/150‑1 (MQ=255) tCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTCGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAg > 1:1136125/1‑141 (MQ=255) gctacaagctacaaGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTcc > 2:2189728/1‑150 (MQ=255) gctacaagctacaaGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTcc > 2:1551792/1‑150 (MQ=255) caagctacaagcCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCcagcag < 1:2071162/112‑1 (MQ=255) caagctacaagcCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCcagcag > 2:2071162/1‑112 (MQ=255) agctacaagcCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCg > 1:1334768/1‑150 (MQ=255) ctacaagcCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTc < 2:2229476/150‑1 (MQ=255) aagcCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCca > 1:53536/1‑76 (MQ=255) GCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACg < 1:121309‑M1/89‑1 (MQ=255) GCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAg < 1:1867749‑M1/150‑1 (MQ=255) | TCGGTGTACTTCTCGATACAGGCAGTCTTCAGACCAAGTTGGGCAGCCTTGATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAG > NC_002947/4731377‑4731669 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |