New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4731520 = | 126 (1.420) | 7 (0.080) | 7/242 | NT | 5.8% | intergenic (‑31/+63) | lpdG/sucB | dihydrolipoyl dehydrogenase/2‑oxoglutarate dehydrogenase dihydrolipoyltranssuccinylase subunit |
? | NC_002947 | 4731576 = | 103 (1.180) | intergenic (‑87/+7) | lpdG/sucB | dihydrolipoyl dehydrogenase/2‑oxoglutarate dehydrogenase dihydrolipoyltranssuccinylase subunit |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCAT > NC_002947/4731427‑4731725 | gATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGcc > 1:1571357/1‑150 (MQ=255) gatcgacggcaaggaagcggtaaccttcctggtcactatcaagaacctgctggaagatccgtcccgcctgctgctggacatctaaccctctgGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCa < 2:1570731‑M1/58‑1 (MQ=255) aTGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACGGTTTACATCTCCGTAGAATTTCGGGGGCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCa < 2:2329219/150‑1 (MQ=255) aGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAggg > 1:1358109/1‑150 (MQ=255) aGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAggg > 2:1180274/1‑150 (MQ=255) ccACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGtt < 2:2015455/150‑1 (MQ=255) gcaaggaagcggtaaccttcctggtaactatcaagaacctgctggaagatccgtcccgcctgctgctggacatctaaccccctgGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTa > 1:1839176‑M1/85‑150 (MQ=255) cacaTAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAGGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTa > 1:1345791/1‑150 (MQ=255) caaggaagcggtaaccttcctggtcactatcaagaacctgctggaagatccgtcccgcctgctgctggacatctaaccctctgGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAg > 1:1570731‑M1/84‑150 (MQ=255) acaTAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGATAGGCGCAGAGCAGTTGGCAGCCAAGCGGCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTGAg > 1:285930/1‑150 (MQ=255) caTAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGa > 2:1913158/1‑150 (MQ=255) tAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATg < 2:2036384/150‑1 (MQ=255) aGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGTACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGt < 1:2365048/150‑1 (MQ=255) gccgccTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATGAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTc < 2:1741895/150‑1 (MQ=255) gccTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCcag < 1:487184/150‑1 (MQ=255) gggCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCcagcagc < 1:134121/150‑1 (MQ=255) gATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACgg > 2:1878309/1‑150 (MQ=255) aTTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGa < 1:1058316/150‑1 (MQ=255) ccACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCtt < 2:1185851/150‑1 (MQ=255) ccACAACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGATCAAAGCGGTGGTGCGTACCCCGTTGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCtt < 1:550286/150‑1 (MQ=255) cACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTc > 2:1584562/1‑150 (MQ=255) aCTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTcc > 1:2001649/1‑150 (MQ=255) aCTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTcc > 2:2336604/1‑150 (MQ=255) 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tttCTTGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGATACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCtt < 2:285930/150‑1 (MQ=255) tGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATa < 1:1584562/150‑1 (MQ=255) agatccgtcccgcctgctgctggacatctaaccctctgGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCagag > 1:1652404‑M1/39‑99 (MQ=255) agatccgtcccgcctgctgctggacatctaaccctctgGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCagag < 2:1652404‑M1/61‑1 (MQ=255) gggTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGTACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAg > 1:693387/1‑150 (MQ=255) ggTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGt > 1:585328/1‑150 (MQ=255) 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ttGCGAAGCCAGGCTCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAgg > 1:1240470/1‑150 (MQ=255) gAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGa < 1:1082616/87‑1 (MQ=255) gAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGa > 2:1082616/1‑87 (MQ=255) gAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTAca > 1:297798/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACatcatc < 2:2202376/149‑1 (MQ=255) aGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCg > 2:2366511/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCggg < 1:2366511/150‑1 (MQ=255) cccGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGc < 1:2336604/150‑1 (MQ=255) ccGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCg > 2:1984569/1‑150 (MQ=255) gCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAAt > 2:1745551/1‑150 (MQ=255) gCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAAt > 1:526108/1‑150 (MQ=255) gCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAAt < 2:1240470/150‑1 (MQ=255) aCGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCa > 2:941024/1‑150 (MQ=255) gTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGa < 1:1984569/150‑1 (MQ=255) aGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCtt > 2:497349/1‑55 (MQ=255) aGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCtt < 1:497349/55‑1 (MQ=255) cAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGTGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCAt > 2:2234484/1‑150 (MQ=255) cAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCAt > 1:922654/1‑150 (MQ=255) | GATGGCAGCCACATAGCCGCCTGGGCCTGCACCGATTACCACTACGTCGAATTTCTGGGTCATAAAAGATTCCTTATCAGCTACAAGCTACAAGCCGCGAACCGCGCGGCCTGGCTTCTTGCGAAGCCAGGCCCGGCACGGTACGCAGCCAGAGGGTTAGATGTCCAGCAGCAGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCAT > NC_002947/4731427‑4731725 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |