New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4928740 = | 87 (0.980) | 5 (0.060) | 4/238 | NT | 5.7% | coding (1477/2244 nt) | cheA | chemotaxis histidine kinase CheA |
? | NC_002947 | 4928767 = | 82 (0.960) | coding (1450/2244 nt) | cheA | chemotaxis histidine kinase CheA |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CTCGGCGGCGTCCTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAGTTCCAGATTGATCTCTTTC > NC_002947/4928591‑4928885 | cTCGGCGGCGTCCTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCtt < 2:1239961/150‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGTCCTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTg > 2:1753216/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGCGTCCTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTg > 2:2225546/1‑150 (MQ=255) cggcggCGTCCTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGc < 1:2065242/150‑1 (MQ=255) cggcggCGTCCTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGc > 2:1620840/1‑150 (MQ=255) ggcgTCCTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGa > 1:376367/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCACCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGc > 1:1339705/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCAAGGCCGTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGc > 1:443885/1‑150 (MQ=255) cTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGCGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGc > 1:2009727/1‑140 (MQ=255) cTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGTCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTc < 2:2358896/150‑1 (MQ=255) cTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGc < 2:2009727/140‑1 (MQ=255) cTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTc < 1:2130390/150‑1 (MQ=255) cATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCtc > 1:445669/1‑150 (MQ=255) ccagctgaagaaagagatcaatctggaactggtcggcgaagagaccgaccttgacaagaacctcgtagaagccttggccgacccgctggtgcacttggtgcgcaatgcggtcgaccacggtatcgagat < 2:446456‑M1/1‑1 (MQ=255) ccagctgaagaaagagatcaatctggaactggtcggcgaagagaccgaccttgacaagaacctcgtagaagccttggccgacccgctggtgcacttggtgcgcaatgcggtcgaccacggtatcgagat > 1:446456‑M1/129‑129 (MQ=255) agctgaagaaagagatcaatctggaactggtcggcgaagagaccgaccttgacaagaacctcgtagaagccttggccgacccgctggtgcacttggtgcgcaatgcggtcgaccacggtatcgagaTGCCAGACGCTTCACGctcgtcgc > 1:85060‑M1/127‑149 (MQ=255) gCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCggg > 2:1178391/1‑150 (MQ=255) cccTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTAGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACCATGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGc < 1:2225546/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCa > 2:1696023/1‑150 (MQ=255) cTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCAt > 2:2095173/1‑150 (MQ=255) ttttCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCATCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCAtc > 1:62384/1‑150 (MQ=255) cACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGAt > 2:1425837/1‑150 (MQ=255) aCGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCa < 2:880278/129‑1 (MQ=255) aCGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCa > 1:880278/1‑129 (MQ=255) aCGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATa > 2:498619/1‑150 (MQ=255) aCGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATa > 2:1784958/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATAcc > 1:650414/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGAGCATCTCGATACCGt > 2:1277324/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGGCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTgg < 1:633883/150‑1 (MQ=255) cgcAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGAcc < 2:1972637/150‑1 (MQ=255) gcAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCg < 1:1334776/150‑1 (MQ=255) aGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCAACCGCa < 1:498619/150‑1 (MQ=255) tagggTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCa < 1:639556/148‑1 (MQ=255) cGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCAc > 1:98888/1‑150 (MQ=255) gggTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCCTGGTCGACCGCATTGCGCAcc > 2:1758782/1‑150 (MQ=255) ggTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTTGCCTTCCTGTTCGGGCGACAGCCCTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGGCGCTTCACGCTCGTCTGGCATCTCGATACCGTGGGCGGCCGCATTGCGCACCa > 2:2138194/1‑150 (MQ=255) ggTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCa > 1:1755367/1‑150 (MQ=255) gTCCCTGCCCTTGCCGTCGTCCGCCATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCaa < 2:1946488/150‑1 (MQ=255) gTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCNCGCNCGNCGGGCATCTCGANACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCaa < 1:2138194/150‑1 (MQ=255) gTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCaa < 1:1693875/150‑1 (MQ=255) tCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAg < 2:2385335/150‑1 (MQ=255) aTGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGc > 2:1098445/1‑150 (MQ=255) tGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCa > 1:1194831/1‑150 (MQ=255) tGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCa > 2:1245243/1‑150 (MQ=255) gCCCTTGCCGTCGTTCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCAc < 1:1098445/150‑1 (MQ=255) gCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGTCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGAAGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCAc < 1:66185/150‑1 (MQ=255) cccTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGt > 1:1265253/1‑121 (MQ=255) cccTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGt < 2:1265253/121‑1 (MQ=255) ccTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCa > 2:1795947/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCgg > 2:724279/1‑150 (MQ=255) cgtcgtCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCt > 1:1007837/1‑86 (MQ=255) cgtcgtCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCt < 2:1007837/86‑1 (MQ=255) tcCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCAtt < 2:1593559/122‑1 (MQ=255) tcCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCAtt > 1:1593559/1‑122 (MQ=255) cGATATCGGAAGCAGGATGTGGTCTCCTTCCTTGTCGCCCTACAGCACTTCGCGGATGGTGCTCGCCTTCCCAGACGCTTCACGCCCGTCGGTCATTTCGATACCGTGTTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCaa < 2:334491/150‑1 (MQ=255) cGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATAACGCGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCaa < 1:1758782/150‑1 (MQ=255) gagaTCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAg < 2:1105735/150‑1 (MQ=255) gagaTCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAg < 1:1973527/150‑1 (MQ=255) gagaTCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAg < 1:1767760/150‑1 (MQ=255) gACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCt > 1:1190429/1‑150 (MQ=255) aCAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGATGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTg > 2:736641/1‑113 (MQ=255) aCAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGATGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTg < 1:736641/113‑1 (MQ=255) aCAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGAt < 1:889141/94‑1 (MQ=255) agcagGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACg > 2:2149191/1‑150 (MQ=255) gccgacccgctggtgcacttggtgcgcaatgcggtcgaccacggtatcgagaTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCggg < 2:1040135‑M1/25‑1 (MQ=255) gccgacccgctggtgcacttggtgcgcaatgcggtcgaccacggtatcgagaTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCggg > 1:1040135‑M1/53‑77 (MQ=255) aTGTGGTCGCGTTACTGGTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTc < 2:62384/150‑1 (MQ=255) gtgGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCtt < 2:681352/150‑1 (MQ=255) gtgGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCtt > 1:681352/1‑150 (MQ=255) cgacccgctggtgcacttggtgcgcaatgcggtcgaccacggtatcgagaTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATa < 2:1061897‑M1/35‑1 (MQ=255) cgacccgctggtgcacttggtgcgcaatgcggtcgaccacggtatcgagaTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATa > 1:1061897‑M1/51‑85 (MQ=255) ggTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATa > 1:452400/1‑83 (MQ=255) ggTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATa < 2:452400/83‑1 (MQ=255) ccTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAgg < 1:1784958/150‑1 (MQ=255) ccGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGc > 1:2045550/1‑150 (MQ=255) ccGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGc < 2:445669/150‑1 (MQ=255) cGACAGCACTACGCTGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGcc < 1:1178391/150‑1 (MQ=255) cGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGcc > 1:283583/1‑150 (MQ=255) gACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTg > 1:640075/1‑129 (MQ=255) gACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTg < 2:640075/129‑1 (MQ=255) cAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAggtcggtc > 1:2152375/1‑139 (MQ=255) cAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAggtcggtc < 2:2152375/139‑1 (MQ=255) aGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGAcc > 2:2224467/1‑150 (MQ=255) cACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAg < 1:2274132/150‑1 (MQ=255) tACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCgg > 1:2338641/1‑44 (MQ=255) tACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCgg < 2:2338641/44‑1 (MQ=255) tACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGAc > 1:1033567/1‑66 (MQ=255) tACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGAc < 2:1033567/66‑1 (MQ=255) tACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCtt < 2:1611504/120‑1 (MQ=255) tACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCtt > 1:1611504/1‑120 (MQ=255) cgcgGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAGTTCCa < 1:522687/150‑1 (MQ=255) tACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAGTTCCAGATTGAtct < 1:1753216/150‑1 (MQ=255) cgcgCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAGTTCCAGATTGATctct < 1:724279/150‑1 (MQ=255) cgcgCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAGTTCCAGATTGATctct < 1:1425837/150‑1 (MQ=255) gcgcCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCtt > 1:1952315/1‑106 (MQ=255) gcgcCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCtt < 2:1952315/106‑1 (MQ=255) gcgcCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAGTTCCAGATTGATCtctt < 2:462631/150‑1 (MQ=255) cgcCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAGTTCCAGATTGATCtcttt < 2:376367/150‑1 (MQ=255) gcCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAGTTCCAGATTGATCtctttc < 2:313007/150‑1 (MQ=255) gcCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAGTTCCAGATTGATCtctttc > 1:71699/1‑150 (MQ=255) | CTCGGCGGCGTCCTTGTCCATCAGGCCCTTTTCCACGGCCTTGGCGCGCAGGATGTTCGGGTCCATGCCCTTGCCGTCGTCCGAGATCGACAGCAGGATGTGGTCGCCTTCCTGTTCGGCCGACAGCACTACGCGGCCGGTACGCGCCTTGCCAGACGCTTCACGCTCGTCGGGCATCTCGATACCGTGGTCGACCGCATTGCGCACCAAGTGCACCAGCGGGTCGGCCAAGGCTTCTACGAGGTTCTTGTCAAGGTCGGTCTCTTCGCCGACCAGTTCCAGATTGATCTCTTTC > NC_002947/4928591‑4928885 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |