New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5477138 = | 18 (0.200) | 18 (0.310) | 13/164 | NT | 58.1% | intergenic (+3/+109) | PP_4813/PP_4814 | PAP2 family protein/DedA family protein/ATP‑dependent protease La domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 5477237 = | 14 (0.240) | intergenic (+102/+10) | PP_4813/PP_4814 | PAP2 family protein/DedA family protein/ATP‑dependent protease La domain‑containing protein |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
TCAGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTCCCCCT > NC_002947/5476990‑5477266 | tCAGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTT > 2:749061‑M1/1‑150 (MQ=255) tggccaatcagctggcgtacctgttgccgttcatggaagaggacaagctggacctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTg < 2:2396819‑M1/3‑1 (MQ=255) aGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCCTGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGC < 2:1746664‑M1/150‑1 (MQ=255) aGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGC < 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gACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAAC > 1:405116‑M1/1‑150 (MQ=255) cgttcatggaagaggacaagctggacctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAAc > 2:1512977‑M1/121‑150 (MQ=255) aCCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACC > 2:672867‑M1/1‑150 (MQ=255) aCCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTGCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACC < 1:1249146‑M1/150‑1 (MQ=255) ttcatggaagaggacaagctggacctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCgg > 2:208836‑M1/119‑142 (MQ=255) 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tCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATcgtagga > 1:48563‑M2/1‑77 (MQ=255) tCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATcgtagga < 2:48563‑M2/84‑8 (MQ=255) gcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCgg < 1:1164211‑M1/69‑1 (MQ=255) gcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCgg > 1:1588493‑M1/17‑85 (MQ=255) aTCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttaccc < 2:1912570‑M2/90‑20 (MQ=255) aTCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttaccc > 1:1912570‑M2/1‑71 (MQ=255) aTCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTccccc > 2:969500/1‑141 (MQ=255) aTCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTC < 1:753714‑M1/49‑1 (MQ=255) aTCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTC > 2:753714‑M1/1‑49 (MQ=255) aaTATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGataagcgcgatcccgtgcgtaggagcgggtttacccgcgaatag < 1:411050‑M1/95‑45 (MQ=255) atatTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttacccgcgaataggcc < 2:1556357‑M2/97‑31 (MQ=255) aTGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATcgtaggagcgggtttacccgcgaataggccggcacagg > 2:358013‑M2/1‑61 (MQ=255) TTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACg > 2:196892‑M1/1‑41 (MQ=255) TTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACg < 1:196892‑M1/41‑1 (MQ=255) | TCAGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAATACAGAACCATCAGGCGAACAACTCCCCCT > NC_002947/5476990‑5477266 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |