New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 5492620 = | 96 (1.130) | coding (1444/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CGATCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCAT > NC_002947/5492444‑5492739 | cGATCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAg < 1:1380826/150‑1 (MQ=255) cGATCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCCACTAACAACCTCCAg > 2:1267528/1‑150 (MQ=255) gcccaggcaggtgcaccgctggggcatgacttctgcgtgatgtcgctgtcggacaacctcaagccctggtcgatcattgaaaagcgcctggacctggctgcccaggccgacctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggCCAgg < 2:2256172‑M1/5‑1 (MQ=255) gcccaggcaggtgcaccgctggggcatgacttctgcgtgatgtcgctgtcggacaacctcaagccctggtcgatcattgaaaagcgcctggacctggctgcccaggccgacctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggCCAgg > 1:773729‑M1/146‑150 (MQ=255) aTCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAggg > 2:717661/1‑150 (MQ=255) aTCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAggg < 1:1158703/150‑1 (MQ=255) aTCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAggg > 2:1158703/1‑150 (MQ=255) tCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGc > 1:356853/1‑150 (MQ=255) 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< 1:763774/150‑1 (MQ=255) gacaacctcaagccctggtcgatcattgaaaagcgcctggacctggctgcccaggccgacctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCggcc‑tgg < 1:2218677‑M1/30‑1 (MQ=255) gCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAAGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGcc < 2:598804/150‑1 (MQ=255) cAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGtt < 2:664838/138‑1 (MQ=255) cAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGtt > 1:664838/1‑138 (MQ=255) cAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAg < 1:1013879/150‑1 (MQ=255) 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ccAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATc > 2:1817888/1‑150 (MQ=255) aaGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGa < 1:1509807/150‑1 (MQ=255) aaGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGa > 1:558986/1‑150 (MQ=255) ggACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCa < 2:794031/123‑1 (MQ=255) ggACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCa > 1:794031/1‑123 (MQ=255) cTACAGTGGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGTGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAgg < 1:2194449/150‑1 (MQ=255) tACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGc < 2:1115618/93‑1 (MQ=255) tACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGc > 1:1115618/1‑93 (MQ=255) aGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCa > 2:1846995/1‑98 (MQ=255) aGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCa < 1:1846995/98‑1 (MQ=255) aGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCtt < 1:95993/150‑1 (MQ=255) gtgtTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCtttt < 2:1982596/127‑1 (MQ=255) cccGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTc < 1:2216229/150‑1 (MQ=255) tCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑CGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGa < 2:697331/139‑1 (MQ=255) tCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑CGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGa > 1:697331/1‑139 (MQ=255) gATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTgg > 1:1221485/1‑54 (MQ=255) acaACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGAt < 2:36531/47‑1 (MQ=255) acaACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGAt > 1:36531/1‑47 (MQ=255) acaACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGAt < 2:1561064/110‑1 (MQ=255) acaACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGAt > 1:1561064/1‑110 (MQ=255) ccaaggCCAGG‑CCGCACC‑AGCTCGGTGTGGCCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATc > 2:454240‑M1/7‑110 (MQ=255) ccaaggCCAGG‑CCGCACC‑AGCTCGGTGTGGCCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATc < 1:454240‑M1/104‑1 (MQ=255) tCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCa > 1:1907089/1‑150 (MQ=255) CCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGCTCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCAt > 1:2358534‑M1/1‑150 (MQ=255) | CGATCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCAT > NC_002947/5492444‑5492739 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |