New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 5492620 = | 96 (1.130) | coding (1444/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGCACCTGCCTGGGC > NC_002947/5492473‑5492764 | acttctgcgtgatgtcgctgtcggacaacctcaagccctggtcgatcattgaaaagcgcctggacctggctgcccaggccgacctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCggcc‑tggcct > 1:1058470‑M1/118‑150 (MQ=255) gACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCtt > 2:1879614/1‑150 (MQ=255) aCCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTg > 1:799282/1‑150 (MQ=255) 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tttCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGCGCGGCC‑TGGCCTTGgaga < 1:1771580/150‑1 (MQ=255) gtgatgtcgctgtcggacaacctcaagccctggtcgatcattgaaaagcgcctggacctggctgcccaggccgacctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggccaggccgcaccagctcggtgtggcctggCCTTGGAGATCg < 1:1225831‑M2/12‑1 (MQ=255) ggCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCggg < 1:1693666/150‑1 (MQ=255) gcagcaGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGt > 2:2216229/1‑150 (MQ=255) agcagTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTg > 2:1013879/1‑150 (MQ=255) 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aaCCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGa > 2:111243/1‑111 (MQ=255) tCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCa > 1:1907089/1‑150 (MQ=255) aggccaggccgcaccagctcggtgtggccctggCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGt > 1:1058470‑M2/34‑150 (MQ=255) CCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGCTCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCAt > 1:2358534‑M1/1‑150 (MQ=255) gCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGcccc > 1:2386425/1‑150 (MQ=255) ccACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCa > 2:2335725/1‑150 (MQ=255) gccgcaccagctcggtgtggcctggCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAg < 2:1280498‑M2/58‑1 (MQ=255) gccgcaccagctcggtgtggcctggCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAg > 1:1280498‑M2/26‑83 (MQ=255) gAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGc > 2:1797374/1‑150 (MQ=255) tcggTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt > 2:1360226/3‑68 (MQ=255) tcggTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt < 1:1360226/66‑1 (MQ=255) t‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGCAcct > 2:2250480/1‑150 (MQ=255) gTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAg > 2:1412061/1‑99 (MQ=255) gTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAg < 1:1412061/99‑1 (MQ=255) gTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTcc > 1:1287845/1‑106 (MQ=255) gTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTcc < 2:1287845/106‑1 (MQ=255) gTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGCAcctgc > 1:595184/1‑150 (MQ=255) gTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTCGCTTATTGGATCAGGGCGTGATGTTGTCCGAGCGCGCCACAACGTAGAAGTAATTCCCCAGCGGTGCAccttc > 1:656293/1‑148 (MQ=255) cctggCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGCACCTGCCTGggc < 2:2256172‑M2/145‑1 (MQ=255) | CGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCC‑TGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGTGCACCTGCCTGGGC > NC_002947/5492473‑5492764 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |