| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5634190 = | 96 (1.080) | 7 (0.080) | 6/238 | NT | 6.9% | coding (3669/3954 nt) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 5634227 = | 95 (1.110) | coding (3706/3954 nt) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GGCCCGACCGGCGAGCGCAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGCCAGCAGGTGGCCAAGCGT > NC_002947/5634041‑5634337 | ggCCCGACCGGCGAGCGCAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAg < 2:1462844/150‑1 (MQ=255)ggCCCGACCGGCGAGCGCAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAg < 2:627115/150‑1 (MQ=255) gctggacagcccgtgcaccccaacgatcgccccggcacgcttggccacctgctggcatacgccgcgcagctggtccgagtcgccatggtggatcacggcgtcgaacgccacttcatccttgttccagtccgcgaccagcttcaccttGGc > 1:2352406‑M1/148‑150 (MQ=255) ccGACCGGCGAGCGCAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGcc > 2:599358/1‑150 (MQ=255) cGACCGGCGAGCGCAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGccc < 2:1378656/150‑1 (MQ=255) gACCGGCGAGCGCAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCt > 1:1108085/1‑150 (MQ=255) gACCGGCGAGCGCAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCACCGGCAGTGCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGAGGTCTGGGTTGCGGGGGAACCGGGCAAGGCCCt > 1:532451/1‑150 (MQ=255) gCGAGCGCAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAgg > 2:1826805/1‑141 (MQ=255) gCGAGCGCAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAgg < 1:1826805/141‑1 (MQ=255) cgtgcaccccaacgatcgccccggcacgcttggccacctgctggcatacgccgcgcagctggtccgagtcgccatggtggatcacggcgtcgaacgccacttcatccttgttccagtccgcgaccagcttcaccttg > 1:992330‑M1/137‑137 (MQ=255) cAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCt > 1:1813397/1‑150 (MQ=255) cAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCt < 1:1519976/150‑1 (MQ=255) cccaacgatcgccccggcacgcttggccacctgctggcatacgccgcgcagctggacagcgacgccatggtggatcacggcgtcgaacgccacttcatccttgttccagtccgcgaccagcttcaccttGGCCATGCGCGCACGCCTgcg < 2:933878‑M1/21‑2 (MQ=255) gCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCACCCGCCTGCcgc > 2:1077541/1‑150 (MQ=255) tACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACGGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGt > 1:498046/1‑150 (MQ=255) cacCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTgg > 1:1304095/1‑149 (MQ=255) acCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAg > 1:204279/1‑150 (MQ=255) acCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAg < 1:2020821/150‑1 (MQ=255) 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gcgTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCaa > 2:1223940/1‑150 (MQ=255) gcgTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCaa < 2:1545694/150‑1 (MQ=255) gcgTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCaa > 2:236268/1‑150 (MQ=255) cgTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAg < 2:1725407/150‑1 (MQ=255) cgTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAg < 2:823061/150‑1 (MQ=255) 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ggCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGCCCAACGTGAAGCTGGTCGCGGANTGGAATNAGGATGAAGTGGNGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGa < 1:2304968/150‑1 (MQ=255) gCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGAc > 2:962368/1‑150 (MQ=255) gCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGAc > 2:838329/1‑150 (MQ=255) cacttcatccttgttccagtccgcgaccagcttcaccttGGc < 2:362296‑M1/3‑1 (MQ=255) cacttcatccttgttccagtccgcgaccagcttcaccttGGc > 1:362296‑M1/40‑42 (MQ=255) aGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGa < 1:1808798/146‑1 (MQ=255) aGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGa > 2:1808798/1‑146 (MQ=255) gCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGc > 2:1099308/1‑150 (MQ=255) gtgtGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCgcggc < 1:1099308/150‑1 (MQ=255) gggTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCAt < 2:439669/122‑1 (MQ=255) gggTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCAt > 1:439669/1‑122 (MQ=255) gggTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTAt < 2:1542841/150‑1 (MQ=255) gTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGc > 2:2228545/1‑150 (MQ=255) ttGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGcc > 2:2395492/1‑150 (MQ=255) ttGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGcc > 1:416879/1‑150 (MQ=255) gTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAg > 1:1202721/1‑128 (MQ=255) gTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAg < 2:1202721/128‑1 (MQ=255) tGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGCCAGCAGGt < 1:826861/150‑1 (MQ=255) tGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTAGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGCCAGCAGGt < 2:1566960/150‑1 (MQ=255) gAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGc > 2:197329/1‑141 (MQ=255) gAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGc < 1:197329/141‑1 (MQ=255) aaCCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTc > 2:985159/1‑62 (MQ=255) aaCCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTgg > 2:1317555/1‑87 (MQ=255) cAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGCCAGCAGGTGGCCAAGCg > 1:2376196/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGCCAGCAGGTGGCCAAGCGt < 2:1973378/150‑1 (MQ=255) | GGCCCGACCGGCGAGCGCAACAGCTACACCATTCTGCCGCGTGAGCACGTGCTGTGCCTGGCCGACAACGAAACCGACCTGCTGGCGCAGTTCGCCGCGGTACTGGCCGTTG‑GCAGCTCGGCGGTGTGGGTTGACGGTGAACCGGGCAAGGCCCTGCGCGCCCGCCTGCCGCGTGAGCTGCAGGCCAAGGTGAAGCTGGTCGCGGACTGGAACAAGGATGAAGTGGCGTTCGACGCCGTGATCCACCATGGCGACTCGGACCAGCTGCGCGGCGTATGCCAGCAGGTGGCCAAGCGT > NC_002947/5634041‑5634337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |