New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 5671868 | 82 (0.960) | coding (67/789 nt) | PP_4979 | substrate‑binding protein |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGT > NC_002947/5671694‑5671991 | gCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTT > 2:1911775‑M1/1‑150 (MQ=255) aaCCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTg > 1:1180199/1‑150 (MQ=255) aCCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGc > 1:2398312/1‑150 (MQ=255) 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ctCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGc > 2:295998/1‑99 (MQ=255) ctCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGc < 1:295998/99‑1 (MQ=255) tCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGaacgagcagcaggatccagaacagacgggcgatatgtggcatggccggagattacgcgctcggccggtgtacggtaaaggcatgcattatcgatgtgg > 1:1447467‑M2/1‑30 (MQ=255) tCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGaacgagcagcaggatccagaacagacgggcgatatgtggcatggccggagattacgcgctcggccggtgtacggtaaaggcatgcattatcgatgtgg < 2:1447467‑M2/128‑99 (MQ=255) gTTcgcccagagccaacgggctcaggcaaacgagcagcaggatccagaacagacgggcgatatgtggcatggccggagattacgcgctcggccggtgtacggtaaaggcatgcattatcgatgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccg < 1:1124393‑M1/150‑148 (MQ=255) gTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAg > 2:1206530/1‑150 (MQ=255) tttGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGaacgagcagcaggatccagaacagacgggcgatatgtg > 2:2249809‑M2/1‑27 (MQ=255) tttGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCgcca > 1:1923406/1‑114 (MQ=255) tttGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCgcca < 2:1923406/114‑1 (MQ=255) tttGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGt < 2:1258778/150‑1 (MQ=255) | GCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGT > NC_002947/5671694‑5671991 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |