New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 5671868 | 82 (0.960) | coding (67/789 nt) | PP_4979 | substrate‑binding protein |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCAATTCCTGCCTTGGAAGCGCTG > NC_002947/5671722‑5672016 | cGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGaac < 1:1124393‑M2/150‑4 (MQ=255) gtgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGc > 1:307659/1‑150 (MQ=255) tgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGG‑CAaacgagc > 2:1545789‑M2/1‑143 (MQ=255) 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tcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACcgacga < 2:1101481‑M2/143‑1 (MQ=255) ccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACt > 2:1420862‑M2/6‑150 (MQ=255) ccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACt > 1:1534568‑M2/6‑150 (MQ=255) cactTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTg < 2:272951‑M2/146‑1 (MQ=255) cacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTg > 1:188244‑M2/5‑150 (MQ=255) acaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTg > 2:448153‑M2/4‑135 (MQ=255) acaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTg < 1:448153‑M2/132‑1 (MQ=255) aTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGAGCCTGGTAACCGACGACTGGGc > 1:1929686‑M2/2‑150 (MQ=255) tCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCa < 2:790872/150‑1 (MQ=255) cGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCAc < 1:89517/150‑1 (MQ=255) aTAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCt < 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tttGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCgcca > 1:1923406/1‑114 (MQ=255) gCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGc < 2:2280998/150‑1 (MQ=255) cTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTAc > 1:1570132/1‑99 (MQ=255) cTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTAc < 2:1570132/99‑1 (MQ=255) cTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCaa < 1:808914/150‑1 (MQ=255) cTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCaa > 1:1226832/1‑150 (MQ=255) gAGCCCGTTGGTTCTGGGAGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCATATGTGTTTCAGCACAACGGACAACCGCGCGGCATAGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTAGCACGCCTCGTAGTCGAGGCGTAGTGGCAAtt > 2:1148993/1‑150 (MQ=255) aGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCAATTc < 2:1124393/150‑1 (MQ=255) gCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTTGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCAGACGTGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCAATTcc < 1:1355586/150‑1 (MQ=255) gCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCAATTcc > 1:1416955/1‑150 (MQ=255) ccGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTa < 2:859127/92‑1 (MQ=255) ccGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTa > 1:859127/1‑92 (MQ=255) cGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCCATccccac < 2:2212152/150‑4 (MQ=255) cGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCAATTCCTGc < 1:1843161/150‑1 (MQ=255) ctctGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTc > 1:1087363/1‑122 (MQ=255) ctctGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTc < 2:1087363/122‑1 (MQ=255) tctGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAgg > 2:581559/1‑125 (MQ=255) tctGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAgg < 1:581559/125‑1 (MQ=255) tGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCAATTCCTGCCTTGGAAgc < 2:1226832/150‑1 (MQ=255) cGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCAATTCCTGCCTTGGAAGCgctg > 1:1294908/1‑150 (MQ=255) cGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCAATTCCTGCCTTGGAAGCgctg > 1:1004616/1‑150 (MQ=255) | CGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGCACCTTATGTGTTTCAGCACAACGGCCAACCGCGCGGCATCGACTACGAAGTCGCCAGCCAGGTCTTCGCACGCCTCGGCGTCGAGGTGGAGTGGCAATTCCTGCCTTGGAAGCGCTG > NC_002947/5671722‑5672016 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |