| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 5731921 = | 77 (0.870) | 6 (0.070) | 5/232 | NT | 7.3% | coding (691/1206 nt) | hutI | imidazolonepropionase |
| ? | NC_002947 | 5731965 = | 80 (0.960) | coding (647/1206 nt) | hutI | imidazolonepropionase | |||||
CAGCACGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAGTCGT > NC_002947/5731772‑5732067 | cagcaCGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAg < 2:1557026/150‑1 (MQ=255) gcctggcggcgcacgctttgcccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccgg > 1:1465082‑M1/149‑150 (MQ=255) gcctggcggcgcacgctttgcccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccgg > 1:142518‑M1/149‑150 (MQ=255) gcaCGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGc > 2:604525/1‑150 (MQ=255) gcaCGGCGACCGTGCCGACGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGAAGAGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTAACCGGCAGGc > 1:149178/1‑150 (MQ=255) ctggcggcgcacgctttgcccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGcc < 2:1796636‑M1/4‑1 (MQ=255) ctggcggcgcacgctttgcccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGcc < 2:2224318‑M1/4‑1 (MQ=255) ctggcggcgcacgctttgcccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGcc > 1:1286486‑M1/147‑150 (MQ=255) ccggcggcgcacgctttgcccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGcc < 2:2263256‑M1/4‑1 (MQ=255) aCGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGccc > 1:2247650/1‑150 (MQ=255) aCGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGccc > 2:1501553/1‑150 (MQ=255) ggcggcgcacgctttgcccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacgtcgagcaccgctgtgaggagatctggccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCa < 1:2101942‑M1/6‑1 (MQ=255) gcggcgcacgctttgcccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCAg > 1:1068255‑M1/144‑150 (MQ=255) aCCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTcg < 1:2365880/150‑1 (MQ=255) ccGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTcgc > 1:94997/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTcgcgc < 1:2179403/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGCCCTTGCCATGGCCAAGGAGTCTTCATCTGTTATAAACTACAGCTGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGAGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCCGCTTGACCGGCCGGCACAGTTcgcgc > 2:282439/1‑150 (MQ=255) gcTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCAAGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTtgat < 1:1951888/150‑1 (MQ=255) 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tctGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGc > 1:2396073/1‑150 (MQ=255) tctGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGc < 2:1590410/150‑1 (MQ=255) tGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCga < 1:604525/150‑1 (MQ=255) tCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCgaga > 1:1796636/1‑150 (MQ=255) aTGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAAc < 2:2247650/150‑1 (MQ=255) atcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCt > 1:2235979‑M1/96‑134 (MQ=255) atcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCt < 2:2235979‑M1/39‑1 (MQ=255) aCTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGa < 1:821648/150‑1 (MQ=255) cTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCtt < 1:639352/111‑1 (MQ=255) cTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCtt > 2:639352/1‑111 (MQ=255) cTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAg < 1:2011465/150‑1 (MQ=255) 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cAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACAtctc < 2:660596/150‑1 (MQ=255) aGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCg > 2:1951295/1‑150 (MQ=255) aGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAATTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCg > 2:234588/1‑150 (MQ=255) gttgttCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGt > 1:2263256/1‑150 (MQ=255) ttCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTcaca > 2:2239624/1‑150 (MQ=255) ttCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTcaca < 1:1729829/150‑1 (MQ=255) ttCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTcaca > 1:682362/1‑150 (MQ=255) gCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGAtg > 1:1204998/1‑150 (MQ=255) tGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGgcatccacc > 1:1174247/1‑96 (MQ=255) tGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGgcatccacc < 2:1174247/96‑1 (MQ=255) tGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTgc < 2:682362/150‑1 (MQ=255) tGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTgc > 1:1776960/1‑150 (MQ=255) aGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGcgcg > 2:1258572/1‑150 (MQ=255) cTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCg < 2:1183763/122‑1 (MQ=255) cTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCg > 1:1183763/1‑122 (MQ=255) gACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATccacca > 2:329070/1‑98 (MQ=255) gACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATccacca < 1:329070/98‑1 (MQ=255) gACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACCGATGTGCGCGAtacc < 2:33849/150‑4 (MQ=255) gCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAgtcgt < 1:471580/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAgtcgt < 1:2254212/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCga > 1:1924036/1‑51 (MQ=255) cAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCga < 2:1924036/51‑1 (MQ=255) | CAGCACGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAGTCGT > NC_002947/5731772‑5732067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |