| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
AACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAA > NC_002947/5743255‑5743553 | aaCCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGT < 2:438150‑M1/150‑1 (MQ=255) cccACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTAc < 1:776570/150‑1 (MQ=255) ccACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTGAGCCTTCGCCAGGCCGGTGTTCTGGTTGTGTGTCCATTCGAGGACGCGGTCGCTCCTACAGGTACa > 1:424961/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtctc > 1:1727449‑M1/1‑145 (MQ=255) aGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGa > 1:740348/1‑150 (MQ=255) gggAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGaa < 1:811672/150‑1 (MQ=255) agTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTg < 1:1890740/150‑1 (MQ=255) cGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCgaga < 2:642985/150‑1 (MQ=255) 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ccACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgccg > 1:2054046/1‑150 (MQ=255) cacaGGTgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgagcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcct < 2:2284732‑M1/88‑82 (MQ=255) acaGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGCTGTacctgtgggagcgagcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtc < 1:2216152‑M2/121‑88 (MQ=255) acaGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtgggagcgagcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgagagccgtggcgagtctcatcactcgc < 2:1967302‑M2/150‑117 (MQ=255) aGGTgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgagcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgagagccgtggcgagtctcatcactcgcta < 1:1868343‑M1/150‑147 (MQ=255) aGGTgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgagcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgagagcc > 2:1220929‑M1/1‑4 (MQ=255) gTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtgggagcgagcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgagagccgtggcgagtctcatcactcgctagc < 2:248075‑M2/150‑121 (MQ=255) gTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCa > 2:1166160/1‑150 (MQ=255) tACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCaa < 1:2384872/150‑1 (MQ=255) | AACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAA > NC_002947/5743255‑5743553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |