| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5795530 = | 101 (1.140) | 6 (0.070) | 5/234 | NT | 6.1% | coding (2426/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
| ? | NC_002947 | 5795555 = | 89 (1.060) | coding (2401/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GTCGAAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCC > NC_002947/5795382‑5795679 | gTCGAAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGcc > 2:327960/1‑150 (MQ=255) agggtgcgcgcttcgaagacctggaaaacgaccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaccc > 1:717582‑M1/148‑150 (MQ=255) agggtgcgcgcttcgaagacctggaaaacgaccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaccc > 1:1882580‑M1/148‑150 (MQ=255) gtgcgcgcttcgaagacctggaaaacgaccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCctgc > 2:1694209‑M1/145‑150 (MQ=255) aaCGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCctgct > 2:1974861/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGca > 1:1227423/1‑150 (MQ=255) ttGAGAATCGCCTCCGGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGACACCATTTGATGTCGAGTGA‑TTGGGGATCATCGACACCGGGCGATGGTCCACCAGCGTGGTCGACTCGTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGcaca < 1:551391/150‑1 (MQ=255) ttGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTGGAC‑CGCTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGcaca > 1:1267960/1‑150 (MQ=255) aaTCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGc < 2:1503692/150‑1 (MQ=255) aaTCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAAGCATCGACACCGGTCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTCGTCGCCCTGCTGCCCAGCCGc > 1:1003833/1‑150 (MQ=255) gaagacctggaaaacgaccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCCTGCTGCACAGCCGc < 1:1158371‑M1/17‑1 (MQ=255) gCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGc < 2:1889743/150‑1 (MQ=255) gCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACAGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGc > 2:1033692/1‑150 (MQ=255) cTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAg > 1:2407698/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAgg < 1:873060/150‑1 (MQ=255) gCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgtgt < 1:1147391/150‑1 (MQ=255) aacgaccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGtt > 2:1158371‑M1/122‑150 (MQ=255) gCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGa < 2:2109891/150‑1 (MQ=255) gCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTGTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGTGCCCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGa < 1:539454/150‑1 (MQ=255) tCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGAcc > 1:996302/1‑150 (MQ=255) ccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCct < 1:1096823‑M1/4‑1 (MQ=255) ccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCct > 2:1096823‑M1/117‑120 (MQ=255) gCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCg > 1:2354575/1‑150 (MQ=255) cTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCgg > 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cgGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGAcc > 2:89397/1‑130 (MQ=255) cgGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTg < 1:1974861/150‑1 (MQ=255) gTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTc < 2:2407698/150‑1 (MQ=255) gC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCTCCAGCGTGGTGTATTCCTTTAACTTGGTGTAGTCGCTCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGCCCACGGTCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCa < 2:478301/150‑1 (MQ=255) gC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCa > 1:1842072/1‑150 (MQ=255) gC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCa < 2:478430/150‑1 (MQ=255) c‑cACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGc < 2:1323794/103‑1 (MQ=255) c‑cACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGc > 1:1323794/1‑103 (MQ=255) cACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCCCAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGAc < 1:1033692/150‑1 (MQ=255) cACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGAc < 1:2310093/150‑1 (MQ=255) cACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGAc < 2:295845/150‑1 (MQ=255) 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aGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAg < 1:2200941/150‑1 (MQ=255) gCGTGGTGTATTCCTTGCACTTGGAGTCGACGCCCCGCTGCACAGCTGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAgg < 2:1230438/150‑1 (MQ=255) tggtgTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTg < 1:1708693/124‑1 (MQ=255) gtgtATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATGCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCg < 2:1732571/150‑1 (MQ=255) ttCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCgg < 2:650350/146‑1 (MQ=255) ttCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGgccgc < 1:500069/150‑1 (MQ=255) cTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGaa < 1:1439293/93‑1 (MQ=255) cTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGaa > 2:1439293/1‑93 (MQ=255) cTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCg < 2:1030002/119‑1 (MQ=255) cTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCg > 1:1030002/1‑119 (MQ=255) cTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcag > 1:17371/1‑150 (MQ=255) ttGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTg < 1:2204869/71‑1 (MQ=255) ttGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTg > 2:2204869/1‑71 (MQ=255) ttGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGgcc > 1:720329/1‑144 (MQ=255) ttGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGgcc < 2:720329/144‑1 (MQ=255) ttGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagc > 2:1595255/1‑150 (MQ=255) ttGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagc > 2:917789/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCtt < 1:917789/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTc > 2:563078/1‑150 (MQ=255) gTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGNAGGGTGTTGACCNCGTCCGNGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTc > 1:2133986/1‑150 (MQ=255) gTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTc > 2:330616/1‑150 (MQ=255) gTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTc > 1:534221/1‑150 (MQ=255) CCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTcc < 2:589632‑M1/150‑1 (MQ=255) | GTCGAAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGC‑CACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCC > NC_002947/5795382‑5795679 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |