| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 5795530 = | 101 (1.140) | 6 (0.070) | 5/234 | NT | 6.1% | coding (2426/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
| ? | NC_002947 | 5795555 = | 89 (1.060) | coding (2401/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGA > NC_002947/5795408‑5795704 | gCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgtgt < 1:1147391/150‑1 (MQ=255) cGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGtt < 2:228369/150‑1 (MQ=255) aacgaccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGtt > 2:1158371‑M1/122‑150 (MQ=255) gCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGa < 2:2109891/150‑1 (MQ=255) gCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTGTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGTGCCCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGa < 1:539454/150‑1 (MQ=255) tCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGAcc > 1:996302/1‑150 (MQ=255) gCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCg > 1:2354575/1‑150 (MQ=255) cTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCgg > 1:1120943/1‑150 (MQ=255) ccagcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGt < 2:650474/150‑1 (MQ=255) agccgccagcgGCTGGTCGGACACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACAAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGtt > 2:500069/4‑150 (MQ=255) agcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCg < 1:2019558/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTCGGCTACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGt < 1:1100623/150‑1 (MQ=255) cgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGAcc < 1:89397/130‑1 (MQ=255) cgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGAcc > 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CCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTcc < 2:589632‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCAAGCACGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAg < 1:1999025‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGt > 2:1143792‑M1/1‑150 (MQ=255) GCTGCACAGCCGCTTGCAGGGAGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGt < 2:184624‑M1/150‑1 (MQ=255) gcACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCtt > 1:2080025/1‑150 (MQ=255) gcACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTCGTGTTCTCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCtt < 1:760522/150‑1 (MQ=255) gcggctgtgcagcagggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTc < 1:1158371‑M2/133‑1 (MQ=255) cacaGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGtt > 2:607949/1‑36 (MQ=255) cacaGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGtt < 1:607949/36‑1 (MQ=255) aGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGaa < 2:2133986/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAg < 1:742606/150‑1 (MQ=255) ccGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAgc < 2:2009000/150‑1 (MQ=255) ccGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAgc < 2:2354575/150‑1 (MQ=255) gcagggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCAc > 2:1694209‑M2/7‑150 (MQ=255) agggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTgg > 2:1096823‑M2/5‑120 (MQ=255) agggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTgg < 1:1096823‑M2/116‑1 (MQ=255) gggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCt > 1:717582‑M2/4‑150 (MQ=255) gggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCt > 1:1882580‑M2/4‑150 (MQ=255) ggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTCGCTGGATCGGc > 1:171111‑M2/3‑79 (MQ=255) ggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTCGCTGGATCGGc < 2:171111‑M2/77‑1 (MQ=255) tgtTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGa < 2:1882580/150‑1 (MQ=255) | GCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGA > NC_002947/5795408‑5795704 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |