New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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CCACATGTCGGCATCCAGCGGCCAGCCGTGGCTGAACAGCACGGGCTTGCCGCTGCCCCAGTCCTTGAAATAGATCGAAGTGCCATCGCGGGTAACGAACGTGCTCATAGCGGTATCTCCTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTG > NC_002947/5997998‑5998295 | gtgatctgcccgatgaccatggtcatcccgcaactgctggcgccgctgtttgcgcgcttcccgcagctgggcggcgtgattaccggcaacctgatcgtcaacctgttcgtcatcctgcccgtggtgttctacatcatgccttgggtaacc > 1:820441‑M1/150‑150 (MQ=255) ggCATCCAGCGGCCAGCCGTGGCTGAACAGCACGGGCTTGCCGCTGCCCCAGTCCTTGAAATAGATCGAAGTGCCATCGCGGGTAACGAACGTGCTCATAGCGGTATCTCCTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCa > 1:1699266/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGGCCAGCCGTGGCTGAACAGCACGGGCTTGCCGCTGCCCCAGTCCTTGAAATAGATCGAAGTGCCATCGCGGGTAACGAACGTGCTCATAGCGGTATCTCCTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCa < 2:1774804/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCggg > 1:251387/1‑150 (MQ=255) cTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCggg > 2:783208/1‑150 (MQ=255) tGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGaa < 2:1425848/150‑1 (MQ=255) tGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGaa < 2:2043204/150‑1 (MQ=255) tGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGaa < 1:793238/150‑1 (MQ=255) gtgtCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAgcgcg > 1:811137/1‑150 (MQ=255) tCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCaa > 2:1805649/1‑150 (MQ=255) tCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCaa > 2:1604002/1‑150 (MQ=255) gagaTGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAAc > 2:1519920/1‑150 (MQ=255) gagaTGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAAc > 1:510246/1‑150 (MQ=255) catcatgccttgggtaacCCGCCGCTGC‑GCCAACTGGCTGC‑GCGGCTGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAgc > 1:937872‑M1/19‑142 (MQ=255) catcatgccttgggtaacCCGCCGCTGC‑GCCAACTGGC‑TGCGCGGCTGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAgc < 2:937872‑M1/124‑1 (MQ=255) agaTGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGGTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACa > 2:1002153/1‑150 (MQ=255) aTGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAgc > 2:2240617/1‑150 (MQ=255) gAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAgcgg > 1:2191436/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAgcggc < 1:1800018/150‑1 (MQ=255) ggCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGgcgc < 2:1492483/150‑1 (MQ=255) gCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGGGGGGGGTTACCCAAGGTATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGcc > 2:533659/1‑150 (MQ=255) gCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGcc > 2:1501365/1‑150 (MQ=255) cGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCcagca > 1:2198711/1‑150 (MQ=255) tCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTg > 2:383491/1‑150 (MQ=255) tCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTg > 1:1179903/1‑150 (MQ=255) | CCACATGTCGGCATCCAGCGGCCAGCCGTGGCTGAACAGCACGGGCTTGCCGCTGCCCCAGTCCTTGAAATAGATCGAAGTGCCATCGCGGGTAACGAACGTGCTCATAGCGGTATCTCCTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGC‑GCAGCCAGTTGGC‑GCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTG > NC_002947/5997998‑5998295 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |