| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 6013891 | 42 (0.470) | 9 (0.130) | 8/192 | NT | 18.8% | intergenic (+40/+70) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| ? | NC_002947 | = 6013919 | 45 (0.650) | intergenic (+68/+42) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTG > NC_002947/6013742‑6014038 | agaAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT < 2:1028819‑M1/150‑1 (MQ=255) aaGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgc < 1:2191006/150‑1 (MQ=255) cGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgcagca < 2:1344993/150‑1 (MQ=255) gTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGcac > 2:2232360/1‑150 (MQ=255) ccgctggggcggccgTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcac > 2:2402137‑M1/7‑143 (MQ=255) tCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAg < 2:352377/150‑1 (MQ=255) ccGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACg > 2:1988516/1‑150 (MQ=255) tGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCtg > 2:1056177/1‑150 (MQ=255) ccGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCtgtg > 2:846734/1‑150 (MQ=255) ccGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCtgtg < 1:142871/150‑1 (MQ=255) cTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTa > 1:740418‑M2/1‑149 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTac > 1:1449322‑M2/1‑148 (MQ=255) gACAGCCAGGGTTACCGCGATAAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacct < 2:2020302‑M2/150‑5 (MQ=255) 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cgcgTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgt > 1:452215‑M1/1‑103 (MQ=255) cgcgTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑ATCTCGA‑ACGCTGTGCAGTacctgtgggagcgggggtg < 1:1029213‑M2/150‑20 (MQ=255) tGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTTTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGcc < 1:2232360/150‑1 (MQ=255) gCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTac > 1:595550‑M2/1‑116 (MQ=255) gCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTac < 2:595550‑M2/118‑3 (MQ=255) ggTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacct < 1:827637‑M2/115‑5 (MQ=255) 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1:827637‑M1/115‑112 (MQ=255) aGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttcc < 2:2312524‑M2/103‑72 (MQ=255) aGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttcc > 1:2312524‑M2/1‑32 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca > 1:1449322‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggc > 1:595550‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggc < 2:595550‑M1/118‑117 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTaaa < 1:1780304/115‑1 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTaaa > 2:1780304/1‑115 (MQ=255) tacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccag > 1:740418‑M1/1‑1 (MQ=255) tGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTaa > 1:2290056/1‑126 (MQ=255) tGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTaa < 2:2290056/126‑1 (MQ=255) | AGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTG > NC_002947/6013742‑6014038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |