New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6022690 | 69 (0.780) | 8 (0.100) | 7/234 | NT | 11.1% | coding (842/1293 nt) | PP_5273 | oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 6022719 | 63 (0.750) | coding (871/1293 nt) | PP_5273 | oxidoreductase |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CAAGACCCTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCTT > NC_002947/6022541‑6022838 | cAAGACCCTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGT > 1:1794441‑M1/1‑150 (MQ=255) aGACCCTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGgtgt < 2:421832/150‑1 (MQ=255) aGACCCTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGgtgt < 2:714190/150‑1 (MQ=255) gACCCTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGgtgtg < 1:282116/150‑1 (MQ=255) aCCCTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTAAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGgtgtgt > 2:1392980/1‑150 (MQ=255) ccTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGgtgt < 2:1424499/146‑1 (MQ=255) ccTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGgtgt > 1:1424499/1‑146 (MQ=255) ccTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGa > 1:1385376/1‑150 (MQ=255) cTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAAAGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGAc > 1:273198/1‑150 (MQ=255) tGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACACTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGAcc > 1:1065121/1‑150 (MQ=255) ggTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCa < 1:687414/150‑1 (MQ=255) ggTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCa < 2:668009/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTagtagtccagcgcc > 2:1957018‑M1/1‑136 (MQ=255) tgtgCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCAACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGcgcg > 1:1957848/1‑150 (MQ=255) gtgCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGt < 1:776392/150‑1 (MQ=255) tgctgcAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAgcgccac < 2:1385376/150‑4 (MQ=255) tgctgcAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTg > 2:1990286/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTg < 2:289873/150‑1 (MQ=255) 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cGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTagtagtccagcgccacgcgctggtcacacaccgcca < 1:679411‑M1/150‑37 (MQ=255) cGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCt < 2:1361121/150‑1 (MQ=255) cGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCt < 1:857186/150‑1 (MQ=255) gACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTg < 2:1874442/150‑1 (MQ=255) ccacccatcgggaGCCGGGCTGTAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTagtagtccagcgccacgcgctggtcacacaccgccata < 2:1944266‑M1/144‑39 (MQ=255) aCCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTagtagtccagcgccacgcgctggtcacacaccgccata < 1:1957018‑M1/150‑39 (MQ=255) cTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTcc > 2:1429420/1‑150 (MQ=255) cTCAATCACGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAACCGCCGGGCCAAGAACGCCCACGCACATTGCTGCCGCAGAATCAGGCGGTGTCTCACCAGCGCGGCGCGCTACACTCCTAACGcgagacc > 2:668647/1‑144 (MQ=255) aaTCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTccgcc < 2:2183517/150‑1 (MQ=255) aaTCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTccgcc > 1:348736/1‑150 (MQ=255) 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acaTTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAg > 2:629254/1‑150 (MQ=255) acaTTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAACCACATCGCCGCCTTCATGCGGCGGagg > 2:750466/1‑148 (MQ=255) tgcCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGAGCTGGCGTCCAcctgcaacattcttcggcagcaattggcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgcccagctcg < 1:657328‑M2/150‑103 (MQ=255) ccGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAg < 1:2386551/150‑1 (MQ=255) ccGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAg < 1:71461/150‑1 (MQ=255) ccGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAg < 1:2019855/150‑1 (MQ=255) ccGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAg < 1:472654/150‑1 (MQ=255) gCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCCGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGgt > 2:1044704/1‑150 (MQ=255) gCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACACGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGgt > 1:1120783/1‑150 (MQ=255) aGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGgtgt < 1:1419649/150‑1 (MQ=255) tatGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgcccagctcgcgattgaggt < 1:1957018‑M2/150‑113 (MQ=255) tatGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttacagcccggctcccgatgggtgg < 2:1944266‑M2/150‑113 (MQ=255) atGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCg > 2:1850316/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgcccagctcgcgattgaggtcg < 1:679411‑M2/150‑115 (MQ=255) ggCGGTGTGTGACCAGCCCGTGGCGCTGGACTACTaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgaccagctcgcgattgaggtcgt < 2:1237580‑M2/150‑116 (MQ=255) gCGGTagtagtccagcgccacgcgctggtcacacaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgcccatctcgctattgaggtcgtt < 2:1419649‑M1/150‑146 (MQ=255) gCGGTagtagtccagcgccacgcgctggtcacacaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgta < 2:96153‑M1/102‑98 (MQ=255) ggTagtagtccagcgccacgcgctggtcacacaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgcccagctcgcgattgaggtcgttgt < 1:1361121‑M1/150‑148 (MQ=255) gtgtgtGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgc > 1:810816‑M2/1‑31 (MQ=255) gtgtgtGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgc < 2:810816‑M2/125‑95 (MQ=255) gtgtgtGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCtt < 1:629254/150‑1 (MQ=255) gtagtagtccagcgccacgcgctggtcacacaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgcccagctcgcgattgaggtcgttgtg < 2:2386551‑M1/150‑149 (MQ=255) gtagtagtccagcgccacgcgctggtcacacaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcacagcggctcggtggcgatgatgtagctgccgaccggcagcaccttgccgcccagctcgcgattgaggtcgttgtg > 2:1004262‑M1/1‑2 (MQ=255) | CAAGACCCTGGTACTGTGCTGCAACGCCTACCACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCTT > NC_002947/6022541‑6022838 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |