New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 6103431 = | 116 (1.310) | 8 (0.090) | 7/238 | NT | 6.7% | coding (208/855 nt) | PP_5353 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 6103462 = | 110 (1.280) | coding (239/855 nt) | PP_5353 | hypothetical protein |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CGCCAGCGCCAAGCGTTTCGGCGGCGGCAAGAGCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCCTCGTGTTCCGCTTCATCGCCGCGCGCCGTCGCCAGCA > NC_002947/6103283‑6103579 | cGCCAGCGCCAAGCGTTTCGGCGGCGGCAAGAGCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTggg < 2:376231/150‑1 (MQ=255) catggcctggcatggccatttgcggctgctgctggcgacggcgcgcggcgatgaagcggaacacgaggaaggcgatgagcgccacgatcaggaagtccatgatctggaagccttcgaaaccgtcgcccatgcacatggaagccagcaGGc < 2:2111291‑M1/3‑1 (MQ=255) gcCAAGCGTTTCGGCGGCGGCAAGAGCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTg < 2:1958874/150‑1 (MQ=255) cAAGCGTTTCGGCGGCGGCAAGAGCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTggc > 1:360737/1‑150 (MQ=255) aaGCGTTTCGGCGGCGGCAAGAGCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTggcc > 1:167398/1‑150 (MQ=255) gTTTCGGCGGCGGCAAGAGCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTggccggcc > 1:1046723/1‑150 (MQ=255) tttCGGCGGCGGCAAGAGCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCt > 2:861710/1‑150 (MQ=255) cggcggcAAGAGCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTcgccgc < 2:1046723/150‑1 (MQ=255) cggcggcAAGAGCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTcgccgc > 1:1358085/1‑150 (MQ=255) agagCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCGCGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTGGCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTTCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCGGGTGGcc > 1:170313/1‑150 (MQ=255) agagCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGcc < 2:167398/150‑1 (MQ=255) gCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCctgc > 2:2365725/1‑150 (MQ=255) cGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTCCGCCGGCTGCCGCACGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTgg > 2:572958/1‑150 (MQ=255) gggCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGc > 1:2211808/1‑150 (MQ=255) tCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCtt < 1:1307210/148‑1 (MQ=255) tCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCtt > 2:1307210/1‑148 (MQ=255) tCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGGGGCCTGCTGGCTTcc > 1:18687/1‑150 (MQ=255) tATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGc > 2:2403414/1‑103 (MQ=255) tATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCAt < 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aGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAg < 1:2003500/150‑1 (MQ=255) aGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGAGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAg < 1:2293414/150‑1 (MQ=255) gCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGc > 1:447788/1‑150 (MQ=255) tACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCtt > 2:1196738/1‑150 (MQ=255) aCGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACGTTGTTGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTc < 2:803162/150‑1 (MQ=255) 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aCGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATg < 1:1521602/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATg < 1:300324/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGAGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATg < 1:1016991/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGa < 2:360737/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGa > 1:1638422/1‑150 (MQ=255) 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gccAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCCTCGTGTTCCGCTTc < 1:606593/150‑1 (MQ=255) gccAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCACATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCg < 2:1485467/130‑1 (MQ=255) aGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCCTCGTGTTCCGCTTCATc < 1:2396274/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCt > 2:1489909/1‑109 (MQ=255) gCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCt < 1:1489909/109‑1 (MQ=255) ggTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCCTCGTGTTCCGCTTCATcgcc > 2:1774570/1‑150 (MQ=255) tGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCTTCGTGTTACGCTTCATcgctgc > 1:2029584/1‑150 (MQ=255) ttccgatcTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCCTCGTGTTCCGCTTCATCGCcgcgc < 2:659270/143‑1 (MQ=255) cgcTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCCTCGTGTTCCGCTTCATCGCCGCGCGCAGt < 2:2211808/150‑1 (MQ=255) gcTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTg > 2:1007436/1‑104 (MQ=255) gcTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTg < 1:1007436/104‑1 (MQ=255) gcTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCCTCGTGTTCCGCTTCATCGCCGCGCGCCGTc > 2:1534821/1‑150 (MQ=255) gcTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCCTCGTGTTCCGCTTCATCGCCGCGCGCCGTc > 1:1386948/1‑150 (MQ=255) tGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCCTCGTGTTCCGCTTCATCGCCGCGCGCCGTCGc > 1:1618605/1‑150 (MQ=255) | CGCCAGCGCCAAGCGTTTCGGCGGCGGCAAGAGCTCGGGCTCCGCGCCTATCCACCAGACCCGCCAGGCTACGCCAACCACGCCTGCTGCCGCGCCGACCGTACCTGGCCGTGCACCGGCTGCCGCCAGCGGTGCTTCGCGCTGGTTGGGCCCACTGGCCGGCCTCGCCGCCGGTGGCCTGCTGGCTTCCATGTTCATGGGCGACGGTTTCGAAGGCTTCCAGATCATGGACTTCCTGATCGTGGCGCTCATCGCCTTCCTCGTGTTCCGCTTCATCGCCGCGCGCCGTCGCCAGCA > NC_002947/6103283‑6103579 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |