New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 277165 = | 142 (1.600) | 9 (0.120) | 9/216 | NT | 7.6% | coding (3/1221 nt) | PP_0223 | DszC family monooxygenase |
? | NC_002947 | 277234 = | 94 (1.210) | intergenic (‑67/+30) | PP_0223/PP_0224 | DszC family monooxygenase/DszC family monooxygenase |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
ACGGCCAGGGCTTGGGCATCGCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGG > NC_002947/277085‑277378 | gcgcttaccaccttaacggcaccctgcctgcgcggcattcctggatctgatttgcgggccctgggggctgctttgcagccCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATgg > 2:2214588‑M1/81‑150 (MQ=255) aCGGCCAGGGCTTGGGCATCGCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATgg < 1:2131492/150‑1 (MQ=255) cGGCCAGGGCTTGGGCATCGCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTCGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATggg < 2:1889715/150‑1 (MQ=255) 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tACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCa > 1:1053006/1‑69 (MQ=255) tACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCa < 2:1053006/69‑1 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGgtgt < 2:588439/150‑1 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGgtgt < 1:951879/150‑1 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGACCTTGGGTCTCGATGGGCTGCAAAG‑CATCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCACGgtgt < 2:231590/150‑1 (MQ=255) ttGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTaa < 1:2268627/95‑1 (MQ=255) cccatcgCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTc > 2:1244235/7‑136 (MQ=255) tgGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCAc > 1:445729/1‑150 (MQ=255) tgGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCAc > 1:1704748/1‑150 (MQ=255) aGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCgg < 2:1501426/150‑1 (MQ=255) gACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTg > 2:266671/1‑107 (MQ=255) gACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTg < 1:266671/107‑1 (MQ=255) ccttgtgtcgcgatgGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCAtt > 2:2243080‑M2/16‑150 (MQ=255) gtgtcgcgatgGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGc < 1:862778‑M2/139‑1 (MQ=255) tcgcgatgGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTaa < 2:1765678‑M2/76‑1 (MQ=255) tcgcgatgGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTaa > 1:1765678‑M2/9‑84 (MQ=255) tcgcgatgGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGAGCCCGCAAATCAGACCCAGGAATGCAGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCTCACCGGGTCCTGCAGGTTGTGCACCCGGGCATTCCCCCAg > 2:915638‑M2/9‑150 (MQ=255) cgatgGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTgg < 2:1015572‑M2/145‑1 (MQ=255) cgatgGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTgg < 2:1803802‑M2/145‑1 (MQ=255) cgatgGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTgg < 1:525814‑M2/145‑1 (MQ=255) | ACGGCCAGGGCTTGGGCATCGCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAG‑CAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGG > NC_002947/277085‑277378 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |